Ken Osaki

ゲノム界隈でまたまたロングリードに転生しました。フォローご自由にどうぞ。2025年はナノポア関連の論文や情報６割、仕事と関係無い📮４割、を目指す！ リアル孤独のグルメ。調子に乗って8月5日にプレミアム始める Views are my own

[Ken Osaki @ken_osaki]

【ウェビナー情報】8月5日（水）Decoding the Transcriptome：ロングリードが解き明かす遺伝子発現の世界

久しぶりにウェビナーやります！　テーマはLong Read RNA-Seqです！　
ショートリードでのRNA-Seqとはどこが違うのでしょうかね？

8月5日は水曜日です午後3時から始まります。例によって質問が終わるまで続けるので4時に終わらないかもしれませんがお付き合いくださ〜い

録画します
登録はこちら＞＞https://t.co/c06p5ZHkSU

[Ken Osaki @ken_osaki]

住んでましたー😆

[Tak Sonoyama, M.D., Ph.D. @sonoyamataku]

ブルーバッジ相互の会の皆さん、こんばんは😆😆華金🌼
今夜は、アメリカ、カリフォルニア州中部のフレズノのダウンタウン🇺🇸フレズノは、農業が盛んで、アーモンド、オレンジ等の生産量は世界有数

旅行が好きなので、毎日AIで世界の気持ちのいい風景画像を作って旅行した気分になって楽しんでます！

[Ken Osaki @ken_osaki]

うん、ナノポア使われていますね

[三嶋博之 @mishimahryk]

UCSC Genome Browserにヒト長鎖SVトラック（参照ゲノムはhg38とhs1、ToMMo日本人情報入り）登場！
https://t.co/IjPxeLZTYa

[Ken Osaki @ken_osaki]

@2shitsuJI

[Ken Osaki @ken_osaki]

@harukafilomena アミノバイタル、の高いやつ（プロかプレミアムか）を運動後5分以内に飲むと筋肉痛とは無縁です。僕の場合。

[Ken Osaki @ken_osaki]

@developSeqtech シェアありがとうございます
メチレーションと加齢の関係は良く言われますね

[Ken Osaki @ken_osaki]

年齢って単に産まれた時からの年数じゃないですか
生物学的な、身体的な年齢、ってあるんですかね？
人間ドックで知らされるカラダ年齢とかは信じていいものなのか🤣

もう少し客観的な年齢の評価基準ってないのかなぁ
残りテロメアの長さとか😆

[Ken Osaki @ken_osaki]

佐賀イカ🦑　美味しかった

[生物物理若手の会 公式 @bpwakate]

【第66回生物物理若手の会夏の学校　参加登録延長！】

現在100名ほど現地参加登録を受け付けています！

参加登録は本日締切の予定でしたが、一人でも多くの方に夏学に来てほしいという思いから登録期間を1週間延長します！

最終締切は7月17日(金)！ラストチャンスをお見逃しなく！

#bpss2026

[Ken Osaki @ken_osaki]

@kmoooooog そうですね
バイオ企業の技術営業、学術、はサイエンスの知識とコミュニケーション能力の両方が求められて、給料も安定して金額もそれなりなので、こっちの方が全然オススメですね

[Ken Osaki @ken_osaki]

@drk0311 おめでとうございます🎉
アズキの厳しい環境下での多様性、驚きですねー

てかこのBreeding Science のXのポスト、めちゃ面白いのにフォロワー少なすぎ🤣

[Ken Osaki @ken_osaki]

東京から大阪に行く場合、新幹線🚄にすべきか飛行機✈️にすべきかで迷う

新幹線のメリット
→ 乗るまでの移動が早い、荷物検査など面倒くさいアレコレが無い

飛行機のメリット
→ 眠っても着いたらCAさんが起こしてくれる（2度ほど経験あり😆）

でも最近は新幹線が多いなー

[Ken Osaki @ken_osaki]

頑張って書いたのに何となくチャッピー風になっちまったのは偶然よ😆

[Ken Osaki @ken_osaki]

【アプリケーションノート】〜ナノポアはプラズミドのシーケンスにも革命をもたらした✨〜

ナノポアを使ったアンプリコンシーケンスは、たった30分でSangerと同等以上のコンセンサス精度を達成できることを知らない人が多い
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コンセンサス精度はSangerとほぼ同等（99.7～99.99% identity、ambiguityを考慮すると100% concordance） の精度を達成できるんです
これは96サンプルをバーコード付けて同時に流しても、30分で平均1,000カバレッジに達するので、無理しなくても通常のランで十分以上のカバレッジが得られて、Sangerと同等以上の精度が得られるわけですね

ナノポアのロングリードは深いカバレッジからアレル頻度を正確に推定できる👍
さらに、Sangerの弱点であるリード両端の波形クオリティも無いし、多くのサンプルを混ぜてシーケンスできるのも大きな利点👍👍
もちろんコストだって、プライマーを設計したりする手間と時間もいらないし、多検体を同時にランできることを考えれば全然高くない👍👍👍

ということでこれからプラズミドのシーケンスはナノポアで、という流れが加速するのは間違い無い

アプリケーションノートはこちらから↓
https://t.co/gU50aS26IO

[Ken Osaki @ken_osaki]

いま海外にいるんだけど、🇯🇵対🇧🇷戦はホテルのテレビでやっていなかったからスマホで観てたんだけど、画面小さくてボール⚽️がどこにあるのかわからんくて😂

あー惜しかったなぁ

あのブラジル🇧🇷と互角に戦ってるの観て元気もらったよ

[もふもふ動画 @tyomateee2]

ラスボスと対面した魚の反応…🐟
ww

[Ken Osaki @ken_osaki]

@ganbaru_cell その共通機器の一つにナノポアのロングリードシーケンサーもぜひ！😆

[Ken Osaki @ken_osaki]

トッピングにマッシュドポテトを選んだつもりが間違ってハーフハンバーグを選んでしまったようです😆
これはこれで美味い✨

[Ken Osaki @ken_osaki]

オジサンにはちと恥ずい🤣