Orkide Coşkuner-Weber

The Universe of Intrinsically Disordered Proteins and Polymers

[Orkide Coşkuner-Weber @OrkidWeber]

Instead of using solvent accessible area in their code, AlphaFold3 should use radius of gyration.

[Orkide Coşkuner-Weber @OrkidWeber]

Tertiary structural properties are underestimated and wrong as well. RoseTTAFold gives better results than AlphaFold3 based on my findings. However, none of them can fully capture the structural properties of disordered proteins.

[Orkide Coşkuner-Weber @OrkidWeber]

I have been calculating the results for intrinsically disordered proteins using AlphaFold3. I compared the results to experiments and REMD simulations. I found that AlphaFold3 overestimates helix content, underestimates turn content and tertiary structural properties are

[QuantAI Computing @QuantaiC]

QuantAI Computing Şirketi'nin kurucusu Orkide Coşkuner Weber'in öğrencileri ile birlikte Alzheimer hastalığı üzerine 21 Eylül Dünya Alzheimer Günü öncesinde yaptığı çalışmalar ve elde ettiği gelişmeler Milliyet Gazetesi'nde yer aldı. Haberin devamı için: https://t.co/GXcoU7XVRj

[Türk-Alman Üniversitesi @tauedutrde]

Koç Üniversitesi'nden Dr. Onur Pusuluk ve Dr. Gökhan Torun, TAÜ'den Doç. Dr. Orkide Coşkuner-Weber ve Dr. Neşe Aral'ın sunuşlarıyla 14 Nisan Perşembe günü TAÜ Derslikler Binası Konferans Salonu'nda gerçekleştirildi.

[Türk-Alman Üniversitesi @tauedutrde]

TAÜ Fen Fakültesi Moleküler Biyoteknoloji Bölüm Başkanı Doç. Dr. Orkide Coşkuner Weber, bilim dünyasının prestijli dergisi Frontiers in Dementia’ya Prof. Dr. Vladimir N. Uversky, Dr. David Kang ve Dr. Alexa Woo ile birlikte konu editörü olarak seçildi.

[Orkide Coşkuner-Weber @OrkidWeber]

G-protein coupled receptors are proteins with intrinsically disordered regions. Please, see https://t.co/jCD40nP2jM

[Orkide Coşkuner-Weber @OrkidWeber]

Preparing our manuscript entitled "Paving the Way for Synthetic Intrinsically Disordered Polymers for Soft Robotics" for publication.