バイオステーション(Bio-station)/ポッドキャスト

バイオステーションポッドキャストは研究やキャリア選択の裏側を可視化することを目指します。SpotifyやApple podcastなど各種プラットホームで好評配信中です！

[バイオステーション(Bio-station)/ポッドキャスト @Bio_stations]

ポッドキャスト新エピソードです！

理研でPIをされている荻沼政之先生をゲストに、pHや解糖系の勾配による発生タイミングの制御、キリフィッシュを用いた休眠研究、遺伝研でのPhD生活からフランス/アメリカにわたるポスドク生活、これからの展望についてお聞きしました
https://t.co/izzDBBU8Vt

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温度センサーとして機能する分子

植物において、COP1というタンパク質のVPモチーフが温度によって構造変化。低温環境では不活性状態を維持し、温暖な温度では活性型に移行し形態形成が誘導される。モチーフスワップにより温度応答の感度のコントロールも実現
https://t.co/rg0oDN2pxF

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リボソームを分解に導くEat-meシグナル

ヒストンメチル基転移酵素として知られてきた酵素Dot1が、細胞質でリボソームのサブユニットをメチル化し、選択的オートファジーを誘導することを発見。ストレス応答から寿命���で関連

ヒストン修飾酵素がそんなところにも！
https://t.co/gAeGb0cM3x

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ペルキオキシソームの新規単離法

ペルキオキシソーム膜タンパク質の相互作用因子の同定から、ペルを高純度に回収する新手法PerCapを開発。新たなペル局在タンパク質や形態制御因子の同定、さらに組織特異的なペルタンパク質の比較を実現

面白そうです！
https://t.co/U3curXtftD

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マイクロエクソンと疾患

単一細胞RNA-seqなどを用いることで、3~27塩基の短いエクソン(マイクロエクソン)を新たに1000種以上発見。タンパク質の構造やmRNAの安定性に影響。さらに自閉症と関連が見られるらしい
https://t.co/ueK8ycSCz1

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フレームシフトを狙ったがん治療へ

多くのが���細胞において特定��コドンで-1のフレームシフトを起こす確率が高いことを発見。その機構に迫るとともに、逆にこれを利用することでがん細胞を選択的に細胞死させる合成治療回路を開発
https://t.co/nmYFlonARR

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タンパク質間相互作用の制御因���を網羅的に探索

DNAとタンパク質を結合させ、タンパク質の相互作用がDNAの構造変化に対応するような系をハイスループット化。低分子ライブラリから、実際にタンパク質間相互作用を促進する候補分子を発見

面白い系です、！
https://t.co/wNl3hBW1Ta

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小型の近接標識システム

わずか6アミノ酸のテトラシステインタグとFlAsH光触媒を組み合わせることで、微小なタンパク質の相互作用を検出することに成功。哺乳類のミトコンドリア膜間に局在する微小タンパク質RP11-469Aの機能を明らかに
https://t.co/WHbadGm7JI

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大規模なタンパク質収量測定と予��

約4万種類のタンパク質について、 大腸菌で発現・精製した際の単量体収量を大規模に測定し、そのデータを使ってアミノ酸配列から収量を予測するAIモデルを開発。人工タンパク質の選別精度の向上を実現
https://t.co/kYiA4CRjrR

[Kotaro Tsuboyama @KotaroTsuboyama]

We can now design all kinds of fancy de novo proteins. But can we produce them at scale, at a reasonable cost, and without extensive optimization? That’s what got this project started. Our preprint is now out! Much of the work was led by Selena @sesameandrea  and Kaori. 1/8

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タンパク質分解を活性化する治療に向けて

E3ユビキチンリガーゼを低分子で活性化する刺激性タンパク質分解(SPD)という新たなアイデアを提案。酵素の基質認識部位を塞ぐ阻害タンパク質を選択的に排除することでタンパク質分解を促進。神経疾患の異常を改善
https://t.co/gGzWWJkcFd

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タンパク質の構造が記憶を制御

バエの長期記憶を支えるOrb2タンパク質が、老化に伴って機能のない構造へと変化することを発見。シャペロンの発現操作により若い状態へとタンパク質構造を変化させることで高齢ハエの記憶力が改善
https://t.co/XiB7X16UkU

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膜タンパク質の複合体形成

膜タンパク質が小胞体の脂質二重層で複合体へと組み上げられる過程に、小胞体膜タンパク質複合体が持つシャペロン活��が重要であることを発見。シャペロン活性の阻害により心筋細胞の収縮機能が低下するとか
https://t.co/xsthex4wHf

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骨への刺激が寿命を伸ばす

マウスの系で、骨への機械的な刺激により健康寿命と寿命が延長することを発見���骨由来の分泌因子が複数の臓器で細胞老化を抑制。さらに重要な因子の同定にも成功し、運動模倣薬への期待も
https://t.co/2CY2yFR9uO

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遺伝子発現を記録する人工オルガネラ

非破壊的に過去の遺伝子発現を記録するツールとして人工オルガネラ"Recordanelles"を設計。ミトコン膜アンカー、凝縮体アセンブラ、およびRNA結合ドメインの融合。単一細���レベルで遺伝子発現の履歴を解析できる
https://t.co/lIHEVAZxER

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神経由来の細胞外小胞の単離に向けて

細胞外小胞を分離する新規の手法を確立。遺伝子発現データなどと組み合わせることで、神経の細胞種特異的な細胞外小胞マーカーを探索。生検せずに脳の状態を知る診断手法などへの応用に期待
https://t.co/a29Ho333sq

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予約投稿のamとpmを間違えてしまいました！
また、管理人が休暇のため論文紹介はしばらく不定期になるかもしれません！

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ミトコンドリアのストレス応答

細胞がストレスを受けた時、変性したタンパク質だけをピンポイントで凝集・隔離する仕組みを発見(凝集体をSIMPAと命名)。さらに、ERとミトコンのコンタクトを制御によってこの凝集体の除去が行われるとか
https://t.co/gvocIeRAGj

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生体分子設計の新たなスタンダード"RF Diffusion4"

推論モデルを改良し、アミノ酸、糖類、DNA、RNAなど多様な化学成分を標的とするde novoタンパク質を設計できるツールを開発。リン酸化結合タンパク質や、Ca依存的結合、種/パラログ間の識別なども可能に
https://t.co/lPEk6o6NxQ

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低温が寿命��延ばすメカニズム

筋肉で作られる代謝物が、離れた組織のタンパク質凝集を抑え個体の寿命を延ばすことを報告。比較的安定で輸送可能な補酵素前駆体を、各組織が活性型の補酵素に変換して利用するらしい。主に線虫の系で、ヒト細胞でも病的タンパク質凝集を抑制
https://t.co/RNO36N65WU

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ミトコンドリアが核の若返りを助ける

酵母の配偶子形成において、老化関連因子を次世代へ持ち込ませない核の品質管理にミトコンドリアが重要であることを発見。Tom70がミトコンと核膜の接触を作り、核膜孔複合体を隔離するらしい
https://t.co/mPPWXUvy2G