分子デザインはじめました (Podcast)

このpodcastは、さまざまな形で分子デザインに携わるメンバーが、分子デザインについてゆるく語りつつ情報発信する番組です。タンパク質デザインや核酸 (DNA/RNA)デザインが主なトピックです。

[分子デザインはじめました (Podcast) @Biomol_Design]

今回は、インタビュー回前編です。後編も乞うご期待！

[分子デザインはじめました (Podcast) @Biomol_Design]

Ep 26-1: [Interview] Shintaro Minami (Accipiter Biosciences) “Design at Scale" を公開しました！
https://t.co/ZotzdaWLzU

南慎太朗さん @shintaro_minami をゲストに、米国スタートアップでのタンパク質デザイン、最新のデザインツール、vibe coding や cloud computing について伺いました。

[YasuOkamoto @Okamoto_Yasu_CH]

ちょっと期間が空いてしまいましたが、新エピソードです！tips紹介は、既存製品とかとのconflictもあるので、カットの判断が難しかったです笑
この回の後からClaude codeを使い始めて、独自？の設計パイプラインを考えて実行したりしています。電子実験ノートも自作したので、どこかでお話しできれば。

[matsubayashi @Matsubayashi_J]

Podcast #分子デザインはじめました、今回のエピソードで、2年続けることができました！聞いてくださる方と、出演いただいたゲストの皆様に感謝🙇‍♂️

今回は実験 tips！時流は、自動化・並列化・アウトソースだなぁと思う回でした。

[Shingo Honda (本田 信吾) @akg_entrance]

新エピソードです！

ついに私イチオシのRaininのマルチチャネルピペットを紹介する機会がやってきました笑

デザインを実験室で評価する際のTipsはまだまだありそうなので今後も定期的にやっていきたいですね！

[分子デザインはじめました (Podcast) @Biomol_Design]

Ep 25: [Tips] Pipettes and Pro Tips を公開しました！
https://t.co/ZotzdaWLzU

科学大の浜田さんをゲストMCに迎え、DNAゲル分子ロボのデザインに関する最新の成果についてご紹介いただきました。また、podcast 初の試みとして、分子デザインを検証する際の Wet lab の Tips について話しました。

[分子デザインはじめました (Podcast) @Biomol_Design]

Ep 24: [Journal] Membrane Protein Designs を公開しました。
https://t.co/ZotzdaWLzU

理研の新津藍さん @AiNiitsu212 、岡本 @Okamoto_Yasu_CH 本田 @akg_entrance 松林 @Matsubayashi_Jで、膜タンパク質デザインの論文４報についてジャーナルクラブを行いました。

[YasuOkamoto @Okamoto_Yasu_CH]

本podcastも3年目突入！そんな今回のゲストは以前からお声がけしていた@NaohiroTerasakaさん！

あらためて分子進化の強力さを再認識しました。独自の進化技術を確立した寺坂ラボの今後に要注目です！Don’t think (too much) but evolve it!

[matsubayashi @Matsubayashi_J]

Podcast で寺坂さん @NaohiroTerasaka にインタビューさせていただきました！


古細菌 tRNA 修飾、ribosome改変、人工キャプシドの開発、PUREfrex とマイクロ流路を使った in vitro 進化系などの研究はもちろん、独立を見据えたテーマ選びや独自技術の確立など、大変勉強させていただきました！

[Naohiro Terasaka 寺坂 尚紘 @NaohiroTerasaka]

大学院生・研究員を随時募集中です。共同研究やちょっとした研究の質問も大歓迎ですので、お気軽にリプライ・DMいただければと思います！

[Naohiro Terasaka 寺坂 尚紘 @NaohiroTerasaka]

楽しくしゃべりすぎて長くなってしまいましたが、お時間ある時に聞いていただけますと嬉しいです！あらためて自分の研究キャリアを振り返ることで、今後の研究方針も明確になった気がします。@Okamoto_Yasu_CH @akg_entrance @Matsubayashi_J ありがとうございました！

[Shingo Honda (本田 信吾) @akg_entrance]

新エピソードです！
分子デザインと相補的な技術である進化分子工学について、寺坂さん@NaohiroTerasaka にリアルな話を伺いました！分子進化を加速するComputationalなツールについても話しています

[分子デザインはじめました (Podcast) @Biomol_Design]

Ep 23: [Interview] Naohiro Terasaka (Science Tokyo) “Just Evolve it!” を公開しました！
https://t.co/ZotzdaWLzU

科学大の寺坂尚紘さん @NaohiroTerasaka に、RNA研究から始まったキャリア、HFSPでのスイス留学、タンパク質進化分子工学、独立後の in vitro 進化系の技術開発などを伺いました。

[matsubayashi @Matsubayashi_J]

Podcastで、ジーンフロンティアの金森さんにインタビューさせていただきました。

PUREfrex の特徴、使い方、AI時代への展望のほか、翻訳効率を上げる配列設計、Triton-X 114 を使った精製、市販の特級試薬に残存の金属などなど、技術の裏側や実験 tips の数々を教えていただきました！

[YasuOkamoto @Okamoto_Yasu_CH]

New Episode!!
ちょうどin vitro翻訳に手を出し始めたところだったので、とても勉強になりました！！蓄積されていくtipsの重要さを強く実感しました。僕と同じようにこれから使おうとしている方は必聴です！(遺伝子合成発注前に聞くこと推奨👂)

[Shingo Honda (本田 信吾) @akg_entrance]

新エピソードです！

ここ数年でデザインタンパク質の評価に用いられる例が急増した無細胞翻訳系PURE Systemの基礎やさまざまなTipsについて、「中の人」である金森さんにお話を伺いました！

[分子デザインはじめました (Podcast) @Biomol_Design]

Ep 22: [Interview] Takashi Kanamori (GeneFrontier. Corp.) “The Making of PURE” を公開しました。
https://t.co/ZotzdaWdKm

ジーンフロンティア（株）の金森崇さんに、無細胞翻訳系 PUREfrex 開発の裏側、タンパク質合成のさまざまな tips、AI時代への展望などについて伺いました。

[matsubayashi @Matsubayashi_J]

#分子デザインはじめました podcast の新しいエピソードをリリースしました。
今年もたくさんの方に聴いていただき、ありがとうございました！よいお年をお迎えください。

[Shingo Honda (本田 信吾) @akg_entrance]

2025年最後のエピソードです！

年末の研究会の振り返りをしました。来年は生体分子デザイン界隈がさらに盛り上がりますように！

[YasuOkamoto @Okamoto_Yasu_CH]

2025年の最後の最後に駆け込みエピソード公開！お二人に研究会の様子を伺いました。次回はぜひとも参加したい！
みなさま、良いお年をお迎えください。来年もよろしくお願いします！！