PolyTechnicLab

Mass Spectrometry Laboratory at Rzeszow University of Technology

Laboratorium Spektrometrii Mas Politechniki Rzeszowskiej im. Ignacego Łuksiewicza

[PolyTechnicLab @PolyTechnicLab]

23 lipca 2026 roku członkini naszego zespołu badawczego, mgr inż. Sumi Krupa, obroniła rozprawę doktorską pt. „Opracowanie i optymalizacja metod obrazowania spektrometrią mas do analizy związków małocząsteczkowych”.

W swoich badaniach zajmowała się rozwojem i optymalizacją metod obrazowania spektrometrią mas, umożliwiających określanie przestrzennego rozmieszczenia metabolitów w materiałach biologicznych. Szczególną uwagę poświęciła obrazowaniu dwu- i trójwymiarowemu z wykorzystaniem ablacji laserowej, pozwalającemu analizować nie tylko powierzchnię próbki, lecz także zmiany składu chemicznego w jej głębi. Opracowane rozwiązania zastosowano https://t.co/70YpnNJssW. do badania tkanek, materiałów roślinnych oraz hodowli mikroorganizmów.

Badania stanowiące podstawę rozprawy realizowała w ramach projektu SONATA BIS 12 pt. „System do obrazowania spektrometrią mas w trzech wymiarach (3D MSI)”, nr 2022/46/E/ST4/00016, finansowanego przez Narodowe Centrum Nauki
Na szczególne podkreślenie zasługuje również tempo i efektywność jej pracy naukowej: doktorat został zrealizowany w ciągu trzech lat, dorobek dr inż. Sumi Krupy obejmuje już 15 publikacji naukowych, a wyniki swoich badań prezentowała w formie wystąpień ustnych podczas licznych konferencji krajowych i międzynarodowych.

Promotorem rozprawy była dr hab. Joanna Nizioł, prof. PRz.

Serdecznie gratulujemy dr inż. Sumi Krupie i życzymy dalszych sukcesów naukowych!

[PolyTechnicLab @PolyTechnicLab]

Dnia 27 czerwca 2026 roku odbyła się konferencja „Podkarpackie Forum Uro-Onkologii: Synergia Medycyny i Nauki”. Wydarzenie miało miejsce w sali wykładowej Politechniki Rzeszowskiej, a głównymi organizatorami byli: dr Anna Ossolińska (Szpital w Kolbuszowej) oraz prof. Tomasz Ruman (PRz).

W ramach forum odbyły się następujące sesje:

SESJA I: Sztuczna inteligencja i metabolomika w diagnostyce. Pierwsze wykłady zostały przedstawione przez rdzeń zespołu PolyTechnicLab – pracowników Wydziału Chemicznego PRz: prof. Tomasza Rumana oraz prof. Joannę Nizioł. Przedstawili oni przekrój nowoczesnej metabolomiki i lipidomiki – od próbki, przez metody badawcze, po zaawansowaną analizę statystyczną. Dotychczasowe wyniki zespołu uzyskane przez ostatnie 10 lat pracy z nowotworami nerki i pęcherza moczowego zaprezentował dr n. med. Krzysztof Ossoliński.

SESJA II: Nowe standardy leczenia onkologicznego. Obejmowała tematykę wysokiego ryzyka NMIBC (dr P. Pszczółkowski), rolę radioterapii (dr M. Kolbusz) oraz standardy światowe i leczenie systemowe (dr n. med. W. Michalski, prof. P. Radziszewski).

SESJA III: Chirurgia robotyczna i "Inteligentny nóż". Koncentrowała się na wdrażaniu programów robotycznych (prof. R. Sosnowski), cyberbezpieczeństwie (prof. P. Radziszewski), metabolomice śródoperacyjnej (dr n. med. A. Ossolińska) oraz badaniach nad nowymi biomarkerami (prof. Ł. Zapała).

Dyskusję zamknęła debata na temat interdyscyplinarnego podejścia do pacjenta z udziałem zaproszonych ekspertów: prof. T. Kluza, lek. A. Prejsnar oraz dr. n. med. K. Kucia.

Organizatorzy pragną złożyć serdeczne podziękowania za wsparcie Forum dla Rektora Politechniki Rzeszowskiej – prof. dr. hab. inż. Piotra Koszelnika oraz Dziekan Wydziału Chemicznego – dr hab. inż. Beaty Mossety-Leszczak, prof. PRz.

Spotkanie zwieńczyła doskonała debata o stworzeniu zintegrowanej, regionalnej platformy badawczej. Nasz cel jest prosty: chcemy, aby innowacje z laboratoriów chemicznych jak najszybciej trafiały na bloki operacyjne dla dobra pacjentów.

Dziękujemy wszystkim Wykładowcom, Gościom oraz Uczestnikom za niesamowitą energię, obecność i genialny poziom merytoryczny! Do zobaczenia na kolejnych edycjach!

Więcej o konferencji na: https://t.co/zUlFKNWj8t

#PodkarpackieForumUroOnkologii #UrologiaKolbuszowa #PolitechnikaRzeszowska #MedycynaPrzyszłości #RobotykaMedyczna #AIwMedycynie #Metabolomika #OnkologiaPodkarpacie #PolyTechnicLab #PolitechnikaRzeszowska #SzpitalKolbuszowa #RadekTworek #WydzialChemicznyPRz

[PolyTechnicLab @PolyTechnicLab]

A prestigious Horizon Europe MSCA PF project will be carried out in our team! Out of 17,000 applications, only 4 fellowships were awarded to Poland. Dr Tereza Branysová will study green technologies for cultural heritage protection and microbial biodeterioration. #HorizonEurope #MSCA

[PolyTechnicLab @PolyTechnicLab]

Prestiżowy projekt Horizon Europe MSCA PF w naszym zespole! Spośród 17 tys. wniosków tylko 5 trafiło do Polski. Dr Tereza Branysová zbada zielone technologie ochrony zabytków oraz metabolomikę i lipidomikę mikroorganizmów odpowiedzialnych za biodeteriorację. #HorizonEurope #MSCA

[PolyTechnicLab @PolyTechnicLab]

Staż naukowy mgr. inż. Tomasza Grzyba w naszym laboratorium.

Podczas stażu pracował z próbkami glebowymi z doświadczeń nad biopreparatami bakteryjnymi i ambrozją bylicolistną (Ambrosia artemisiifolia L.). Przygotowywał ekstrakty do niecelowanych analiz metabolomicznych UHPLC-HRMS oraz uczestniczył w opracowaniu profili metabolicznych.

#metabolomika #UHPLCHRMS #spektrometriamas #mikrobiologiaśrodowiskowa #biotechnologia #mikroorganizmyglebowe #AmbrosiaArtemisiifolia #ambrozjabylicolistna #roślinyinwazyjne

[PolyTechnicLab @PolyTechnicLab]

Scientific internship of Tomasz Grzyb, MSc Eng., in our laboratory.

During his stay, he worked with soil samples from experiments on bacterial biopreparations and common ragweed (𝘈𝘮𝘣𝘳𝘰𝘴𝘪𝘢 𝘢𝘳𝘵𝘦𝘮𝘪𝘴𝘪𝘪𝘧𝘰𝘭𝘪𝘢 L.). He prepared extracts for untargeted UHPLC-HRMS metabolomics and contributed to metabolic profile interpretation.

#metabolomics #UHPLCHRMS #environmentalmicrobiology #biotechnologia #biotechnology #soilmicroorganisms #AmbrosiaArtemisiifolia #commonragweed #invasiveplants

[PolyTechnicLab @PolyTechnicLab]

The video shows cold atmospheric plasma interacting with the skin of a finger. The visible light effects correspond to localized micro-discharges, generated by the interaction of the plasma with the heterogeneous surface of the skin. These phenomena will be utilized in our new mass spectrometry imaging system.

Na filmie pokazujemy zimną plazmę atmosferyczną oddziałującą ze skórą palca. Widoczne efekty świetlne to lokalne mikrowyładowania elektryczne, powstające w wyniku oddziaływania plazmy z niejednorodną powierzchnią skóry. Zjawiska te wykorzystamy w naszym nowym systemie do obrazowania spektrometrią mas.

#ColdPlasma #AtmosphericPlasma #MassSpectrometry #MassSpectrometryImaging #MSI #AnalyticalChemistry #Ionization #PlasmaJet #SurfaceAnalysis #Bioanalysis #ChemicalAnalysis #Research #Science #LaboratoryLife #Innovation

[PolyTechnicLab @PolyTechnicLab]

🌱Jak pestycydy zmieniają metabolizm rzodkiewki?

W naszej najnowszej pracy pokazaliśmy, że wpływ pestycydów na roślinę nie ogranicza się wyłącznie do ich funkcji ochronnej — może on prowadzić do istotnych zmian metabolicznych, zależnych zarówno od rodzaju związku, jak i jego dawki. Połączyliśmy niecelowaną metabolomikę UHPLC-UHRMS z obrazowaniem spektrometrią mas w dwóch i trzech wymiarach (2D/3D MSI) za pomocą techniki LARAPPI/CI, aby zobaczyć nie tylko jakie metabolity ulegają zmianom, ale również gdzie w tkankach rośliny te zmiany zachodzą.

Nasze wyniki pokazały, że dawki odpowiadające praktyce rolniczej wywołują raczej subtelne zaburzenia, natomiast dawki wielokrotnie wyższe prowadzą już do szerokiego przeprogramowania metabolizmu aminokwasów, cukrów, lipidów i metabolitów wtórnych. Obrazowanie MSI ujawniło ponadto wyraźne, tkankowo i głębokościowo zależne wzorce zmian metabolicznych, a także nieaddytywne efekty mieszanin pestycydów.

To podejście pozwala lepiej zrozumieć odpowiedź roślin na stres chemiczny i otwiera nowe możliwości oceny wpływu praktyk ochrony roślin na fizjologię upraw oraz bezpieczeństwo żywności.

Nasza praca ukazała się w Journal of Agricultural and Food Chemistry — czasopiśmie z 1. kwartylu (Q1), plasującym się w ścisłej czołówce kategorii General Agricultural and Biological Sciences. https://t.co/zFJ8MqXDdQ

Badania wykonano w ramach grantu SONATA BIS nr 2022/46/E/ST4/00016 finansowanego przez Narodowe Centrum Nauki
#spektrometriamas #MSI #metabolomika
#BezpieczeństwoŻywności #Pestycydy #LARAPPI #UHPLCHRMS #Rzodkiewka #ChemiaAnalityczna #NCN #SONATABIS

[PolyTechnicLab @PolyTechnicLab]

🌱𝗛𝗼𝘄 𝗱𝗼 𝗽𝗲𝘀𝘁𝗶𝗰𝗶𝗱𝗲𝘀 𝗮𝗹𝘁𝗲𝗿 𝗿𝗮𝗱𝗶𝘀𝗵 𝗺𝗲𝘁𝗮𝗯𝗼𝗹𝗶𝘀𝗺?
In our latest study, we showed that the effects of pesticides on plants extend beyond their protective role and can lead to significant metabolic changes depending on both the type of compound and its dose. We combined untargeted UHPLC-UHRMS metabolomics with two- and three-dimensional mass spectrometry imaging (2D/3D MSI) using the LARAPPI/CI technique to reveal not only which metabolites are altered, but also where these changes occur within plant tissues.

Our results demonstrated that pesticide doses corresponding to standard agricultural practice induce relatively subtle disturbances, whereas much higher doses lead to extensive reprogramming of the metabolism of amino acids, sugars, lipids, and secondary metabolites. In addition, MSI revealed clear tissue-specific and depth-dependent patterns of metabolic alterations, as well as non-additive effects of pesticide mixtures.

This approach provides deeper insight into plant responses to chemical stress and opens new possibilities for evaluating how crop protection practices affect plant physiology and food safety.

Our work was published in the Journal of Agricultural and Food Chemistry — a Q1 journal ranked among the top journals in the category General Agricultural and Biological Sciences.
https://t.co/zFJ8MqXDdQ

This research was supported by SONATA BIS grant no. 2022/46/E/ST4/00016, funded by the National Science Centre.
#MassSpectrometry #MSI #Metabolomics #PlantScience #FoodSafety #Pesticides #LARAPPI #UHPLCHRMS #Radish #AnalyticalChemistry

[PolyTechnicLab @PolyTechnicLab]

𝗙𝗶𝗿𝘀𝘁 𝗯𝗯𝗖𝗜𝗗 𝗔𝗽𝗽𝗹𝗶𝗰𝗮𝘁𝗶𝗼𝗻 𝗶𝗻 𝗠𝗦𝗜
In one of our recent publications, we demonstrated the first application of the bbCID measurement method in mass spectrometry imaging (MSI).

We combined bbCID with the LARAPPI/CI system, enabling simultaneous acquisition of full-scan MS and fragmentation spectra for thousands of compounds in a single experiment — without the need to select specific precursor ions.

This approach simplifies metabolite identification, requires no additional MS/MS steps, and fits well with fast imaging workflows.

We tested the method on human bladder and kidney cancer tissues, comparing tumor and non-tumor regions. By generating parallel precursor and fragment ion maps, we were able to reliably confirm differences in the spatial distribution of several metabolites, including fatty acids, proline, creatine, and serine.

Overall, this solution expands the identification capabilities of MSI and streamlines the analysis of untargeted metabolomic data.

The paper was published in the ACS Journal of the American Society for Mass Spectrometry https://t.co/CwY7hm1fVc

This research was supported by SONATA BIS grant no. 2022/46/E/ST4/00016, funded by the National Science Centre.

#3DMSI #MassSpectrometry #MassSpectrometryImaging #MSImagingy #Metabolomics #Bioimagin #MassSpectrometry #MSI #MassSpectrometryImaging #bbCID #LARAPPI #ChemicalImaging #Metabolomics #UntargetedMetabolomics #CancerResearch #BladderCancer #KidneyCancer #AnalyticalChemistry #ImagingMS #TissueImaging #SpatialMetabolomics #MSMS #SonataBis #NCNPoland #ScientificResearch

[PolyTechnicLab @PolyTechnicLab]

𝗣𝗶𝗲𝗿𝘄𝘀𝘇𝗲 𝘇𝗮𝘀𝘁𝗼𝘀𝗼𝘄𝗮𝗻𝗶𝗲 𝗯𝗯𝗖𝗜𝗗 𝘄 𝗼𝗯𝗿𝗮𝘇𝗼𝘄𝗮𝗻𝗶𝘂 𝗠𝗦𝗜

W jednej z naszych ostatnich publikacji pokazaliśmy pierwsze zastosowanie metody pomiarowej bbCID w obrazowaniu spektrometrią mas (MSI).

Połączyliśmy bbCID z systemem LARAPPI/CI, dzięki czemu podczas jednego eksperymentu można równocześnie zbierać widma MS i oraz widma fragmentacyjne dla tysięcy związków jednocześnie — bez konieczności wybierania konkretnych prekursorów.

Takie podejście ułatwia identyfikację metabolitów bez dodatkowych kroków i pasuje do szybkich eksperymentów obrazowania.

Przetestowaliśmy metodę na tkankach ludzkiego raka pęcherza i raka nerki, porównując obszary nowotworowe i zdrowe. Dzięki jednoczesnym mapom prekursorów i fragmentów mogliśmy wiarygodnie potwierdzić różnice w rozmieszczeniu m. in. kwasów tłuszczowych, proliny, kreatyny i seryny.

To rozwiązanie rozszerza możliwości identyfikacyjne MSI i upraszcza pracę z nieukierunkowanymi danymi metabolomicznymi.

Publikacja ukazała się w specjalistycznym czasopiśmie wydawnictwa ACS Journal of the American Society for Mass Spectrometry https://t.co/CwY7hm1fVc
Badania wykonano w ramach grantu SONATA BIS nr 2022/46/E/ST4/00016 finansowanego przez Narodowe Centrum Nauki

#spektrometriamas #obrazowaniespektrometriąmas #MSI #LARAPPI

[PolyTechnicLab @PolyTechnicLab]

From September 29 to October 2, a scientific conference organized by the International Mass Spectrometry Imaging Society (IMSIS) took place on the campus of the University of California, @ucdavis (USA).

This international conference welcomed all the world's key scientists involved in mass spectrometry imaging, both in terms of research objects and the development of MSI techniques. In addition to the scientists, the conference was attended by specialists from key MSI instrument manufacturers: Bruker, Waters, Shimadzu, Agilent, Jeol, and others.

Tomasz Ruman and Joanna Nizioł represented the Faculty of Chemistry of the Rzeszow University of Technology @PolitechnikaRz and the PolytechnicLab at the conference. T. Ruman, as the keynote speaker, delivered a lecture titled "Direct 3D Mass Spectrometry Imaging" in the session titled "Novel Instrumentation and Fundamentals."

The lecture focused on the LARAPPI/CI MSI (Laser Ablation Remote Atmospheric Pressure Photoionization/Chemical Ionization Mass Spectrometry Imaging) method developed by the research team, which enables direct 2D and 3D imaging of metabolites and other chemical compounds in human, plant, and microbial tissues.

This technique allows for the analysis of biological objects without the need for complex preparation and under atmospheric pressure, opening new perspectives in biomedical and environmental research.

The research was carried out as part of the SONATA BIS 12 project (no. 2022/46/E/ST4/00016) financed by @NCN_PL

#IMSIS2025 #PolytechnicLab #MassSpectrometryImaging #3DMSI #LARAPPI #3DImaging #UCdavis #ScientificConference #WChPRz #RzeszowUniversityOfTechnology #KeynoteSpeaker #ScientificResearch #SonataBIS #NCN #ScienceInPoland #ResearchInnovation #Innovation #AnalyticalChemistry #BiomedicalResearch #EnvironmentalScience

[PolyTechnicLab @PolyTechnicLab]

🇵🇱 W dniach od 29 września do 2 października na kampusie Uniwersytetu Kalifornijskiego w Davis (UC Davis, CA, USA) odbyła się konferencja naukowa organizowana przez Międzynarodowe Towarzystwo Obrazowania Spektrometrią Mas (The International Mass Spectrometry Imaging Society, IMSIS).

Konferencja o zasięgu międzynarodowym gościła wszystkich kluczowych naukowców na świecie zajmujących się obrazowaniem spektrometrią mas zarówno od strony badanych obiektów jak i rozwojem technik MSI. Poza naukowcami, w konferencji uczestniczyli specjaliści kluczowych w MSI producentów aparatury badawczej: Bruker, Waters, Shimadzu, Agilent, Jeol i in.

Przedstawicielami WCh PRz oraz PolytechnicLab na konferencji byli prof. Tomasz Ruman oraz dr hab. Joanna Nizioł. T. Ruman jako keynote speaker wygłosił wykład pod tytułem „Direct 3D mass spectrometry imaging” w sesji zatytułowanej Nowa instrumentacja i podstawy (Novel Instrumentation and Fundamentals).

Tematem wykładu była opracowana przez zespół badawczy metoda LARAPPI/CI MSI (Laser Ablation Remote Atmospheric Pressure Photoionization/Chemical Ionization Mass Spectrometry Imaging) umożliwiającej bezpośrednie obrazowanie 2D i 3D metabolitów oraz innych związków chemicznych w tkankach ludzkich, roślinnych i mikrobiologicznych. Technika ta pozwala na analizę obiektów biologicznych bez konieczności skomplikowanej preparatyki i w warunkach ciśnienia atmosferycznego, co otwiera nowe perspektywy w badaniach biomedycznych i środowiskowych.

Badania były realizowane w ramach projektu SONATA BIS 12 (nr 2022/46/E/ST4/00016) finansowanego przez @NCN_PL

https://t.co/U3uCTW7wec

@PolitechnikaRz

#IMSIS2025 #PolyTechnicLab #MassSpectrometryImaging #3DMSI #MSI #IMS #obrazowaniespektrometriamas #science #LARAPPI #obrazowanie3D #SpektrometriaMas #3DImaging #BadaniaNaukowe #NoweOdkrycia #Innowacje #UCdavis #ScientificConference #WChPRz #PolitechnikaRzeszowska #KeynoteSpeaker #ScientificResearch #SonataBIS #NCN #NCN_PL #ScienceInPoland #ResearchInnovation

[PolyTechnicLab @PolyTechnicLab]

W dniach 10–12 września 2025 r. na Kampusie Uniwersytetu w Białymstoku odbyło się Konwersatorium Spektrometrii Analitycznej, jedno z najważniejszych wydarzeń naukowych w Polsce dedykowanych nowoczesnym technikom spektrometrycznym.

Podczas konferencji prof. dr hab. inż. Tomasz Ruman, lider zespołu PolyTechnicLab, wygłosił wykład pt. „Obrazowanie spektrometrią mas obiektów biologicznych w dwóch i trzech wymiarach”. Prezentacja dotyczyła autorskiej technologii LARAPPI/CI MSI (Laser Ablation Remote Atmospheric Pressure Photoionization/Chemical Ionization Mass Spectrometry Imaging) umożliwiającej bezpośrednie obrazowanie 2D i 3D metabolitów oraz innych związków chemicznych w tkankach ludzkich, roślinnych i mikrobiologicznych.

Technika opracowana w naszym zespole pozwala na analizę obiektów biologicznych bez konieczności skomplikowanej preparatyki i w warunkach ciśnienia atmosferycznego, co otwiera nowe perspektywy w badaniach biomedycznych i środowiskowych.

Wystąpienie spotkało się z dużym zainteresowaniem uczestników konferencji, podkreślając innowacyjny charakter prowadzonych badań.

Badania były realizowane w ramach projektu SONATA BIS 12 (nr 2022/46/E/ST4/00016) finansowanego przez @NCN_PL @PolitechnikaRz

#PolyTechnicLab #KOSAT #massspectrometryimaging #3DMSI #MSI #IMS #obrazowaniespektrometriamas #science #obrazowanie3D #SpektrometriaMas #BadaniaNaukowe #NoweOdkrycia #Innowacje

[Krzysztof Ossolinski @lek_ossolinski]

🚨 New publication!
We identified 31 non-invasive serum & urine biomarkers (AUC > 0.90) for kidney cancer using untargeted metabolomics!
Collab: Kolbuszowa Urology Dept & Rzeszow University of Technology.
🧬🧪
📖 https://t.co/BLIk3DQPX7
#Metabolomics #KidneyCancer #Biomarkers