S-Kin Lab,

お肌の常在菌解析（肌フローラ）、お口の中の常在菌解析（口内フローラ）を行っている会社です。菌叢解析に関する内容をつぶやいています。
※S-KIN Labは肌フローラ、口内フローラの両方をサポートするようになりました。
#肌フローラ
#口内フローラ
#常在菌解析

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この研究では、フローラの成熟を菌叢の多様性の向上と定義しています。
「ある菌が多いか」ではなく、時間とともにフローラがどう成熟していったかを時系列で見ることでT1Dと腸内フローラの関係を紐づけました。https://t.co/cwfig3OcY6

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特に最後の成熟停止型では、通常の成熟型に比べT1Dや膵島自己抗体陽性化のリスクが約3倍高くなっていました。 違いを作っていたのは主にBifidobacteriumやRuminococcusの時間的変化。さらに微生物が作るアミノ酸やビタミンなどの代謝機能にも違いがありました。

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赤ちゃんの腸内フローラの「成熟の仕方」と将来の病気には関係があるのでしょうか。
最新の研究では、1型糖尿病の遺伝的リスクが高い子どもを最長6年間追跡し腸内の菌を解析しました。
すると腸内microbiomeの発達には、早く成熟・遅れて成熟・早期に成熟停止の3パターンが見つかりました。

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さらに皮脂腺細胞の成熟とholocrine secretionに関連する遺伝子も変化しました。
つまり、 皮脂を餌にC. acnesが増える だけでなく、C. acnesがpropionateを作って積極的に皮膚の皮脂産生を促す。
というfeedback loopが存在する可能性があります https://t.co/8wSG9KrimK

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Cutibacterium acnesは皮脂の多い毛穴に多く存在します。これまでは、皮脂が多い環境だからC. acnesが増える、と考えるのが自然でした。
ところが今日紹介の研究は、逆方向の作用もあるのでは？という面白い結果を報告しています。

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研究チームはヒトの皮脂腺細胞にC.acnesの培養上清を加え、脂質量や遺伝子発現などを解析しました。
すると細胞内のlipid dropletが増加。原因を調べると、C. acnesが作る短鎖脂肪酸のpropionateが主要なドライバーでした。 propionateは細胞の代謝を変え、脂質合成に必要な材料の産生を誘導します。

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乳児では実に98%の菌種で環境の影響が重要。一卵性と二卵性双生児間で差がありませんでした。 ところが成人では62菌種で遺伝的影響が検出され、一卵性双生児の方が菌叢の類似性が高くなりました。
つまり口内フローラは年齢によって環境と遺伝の重みが違ってくるようです。
https://t.co/aNQM2D1ZJy

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口腔フローラは遺伝で決まるのでしょうか。それとも食事や生活環境でしょうか。
この疑問を調べるために利用されたのが「双子」です。
ある研究では乳児の双子と成人の双子を比較し、唾液の細菌に対する遺伝と環境の影響を解析しました。

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まず驚くのは、乳児と成人に共通して、17種類の共通する菌が存在したこと。 Streptococcus mitis、Rothia mucilaginosa、Veillonella parvulaなどが含まれ、基本的な口腔生態系はかなり早い時期に形成される可能性があります。 一方、その決まり方は年齢で違いました。

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毛穴の目立つ肌で多様性が下がる現象は我々が独自に行った肌フローラ試験でも同じ結果が得られています。 肌フローラと肌状態の関係は地域を超えた共通性があるようです。
https://t.co/Ed8FekM02E

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毛穴の目立ちはスキンケアで関心の高いテーマです。
皮脂量や肌の弾力だけでなく「肌フローラ」との関係を調べた研究が登場しました。
研究対象は上海在住の18から35歳の女性199人。
顔写真から毛穴面積で群に分け、皮脂、経皮水分蒸散量（TEWL）、弾力などの肌測定と、皮膚の細菌叢を解析しました。

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結果は、毛穴が大きい群ほどTEWLが高く、肌の弾力は低下。皮脂も増える傾向がありました。 そして肌フローラでは、毛穴が大きくなるにつれてフローラの多様性が低下。アクネ菌が増える一方、Pseudomonas、Streptococcusなどは減りました。 さらにアクネ菌量は皮脂量などとも正の相関を示しました。

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これらの結果から、プロバイオティクスは、特にUC患者において、腸管前処置後の腸内細菌叢の多様性や構成の回復を促進する可能性が示唆されました。
https://t.co/KmYZ4sE9CJ

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大腸内視鏡検査の前には大量の腸管洗浄液を飲みます。では、腸内フローラはすぐ元に戻るのでしょうか？。
今回の研究では、健常者40人と潰瘍性大腸炎(UC)患者39人を対象に、腸管洗浄前後の便を採取。さらにプロバイオティクスを28日間摂取する群と非摂取群に分け、16S rRNA解析で追跡しました。

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健常者では腸管洗浄直後に多様性が低下したものの、28日までに徐々に回復。一方UC患者では元の多様性が低く、回復も遅い傾向でした。
ところが、プロバイオティクス摂取では、特にUC患者でフローラ多様性の回復がより大きく、Faecalibacterium、Blautiaなど有益な菌の増加が観察されました。

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手術前に口腔細菌を評価したり、口腔ケアで菌叢を調整することで、術後合併症を減らせるでしょうか。すでに臨床現場でも手術前に口腔状態を確認することが行われていますが、この研究も「Oral microbiome → Lung」という全身とのつながりを非常に分かりやすく示しています。
https://t.co/lQs3bFv0hl

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高齢者や手術患者では、口腔内の細菌を含む唾液が気道に入ることで肺炎につながります。
先週発表された研究では、口腔がん患者203人から採取した口腔洗浄液のmicrobiomeを解析し、手術後に誤嚥性肺炎を起こした患者と起こさなかった患者を比較しました。

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すると年齢、性別、がんのステージなどを調整した後でも、microbiomeのα・β多様性に差がみられました。17属で調整後も違いが認められ、ParvimonasやVeillonellaなどが候補に挙がりました。
つまり口の中の菌叢は、局所的な口腔疾患だけではなく、呼吸器合併症のリスクを反映する可能性があります。

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つまり「アトピーなら同じ菌叢」ではなく、皮膚の細菌・真菌、遺伝的背景、アレルギーの組み合わせによってmicrobiomeが違う可能性があります。
症状だけでは見えない皮膚状態をmicrobiomeから層別化するという方向性は、今後の皮膚研究で重要になりそうです。https://t.co/HRKB4cVoUi.

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赤ちゃんのアトピー性皮膚炎や食物アレルギーは、症状が出てから診断されます。では、その前から皮膚の微生物に何か変化は起きているのでしょうか。
研究チームは429人の乳児から1,000検体以上の皮膚スワブを採取し、2から3か月齢と12か月齢でshotgun metagenomics解析を行いました。

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興味深いことに、後にアトピー性皮膚炎と食物アレルギーを併発した乳児では、まだ症状が明確になる前の3か月齢ですでにStaphylococcus属などの構成に違いが見られました。
さらに12か月齢では、ADだけの乳児と、AD＋食物アレルギーの乳児で菌叢が異なり、後者では真菌も増えていました。