機械の中の機械 2号

life science, wet実験, PhD(薬学), angular/typescript, python, machine learning, chemoinfomatics,
増殖中

[須田桃子 @MomokoSuda]

連載３回目です。研究不正の徹底した調査がなぜ重要なのか、その理由も盛り込みました。

「検証サイト」で相次ぐ指摘、調査中の論文の訂正　大学による「研究不正調査」の構造的な課題とは｜SlowNews | スローニュース #SlowNews #スローニュース #調査報道 https://t.co/Iv4PIIywUu

[日本経済新聞 電子版（日経電子版） @nikkei]

キッセイ薬品、血管炎治療薬の投与後20人死亡　新規投与中止呼びかけ
https://t.co/vxHYRdrveq

[機械の中の機械 2号 @S_Machine_2]

立体構造予測とリガンド親和性予測で話題のbolt2がどのくらい凄いか、やっと触りだけ理解。web上でアプリ作るflameworkと混同してたw

[機械の中の機械 2号 @S_Machine_2]

Duolingo
招待リンクはこちら：https://t.co/WR3QZkyKFa

[🤣 @Japan_lol_w]

初めてのデートで彼氏と水族館行った時に「これってガラス壊れたりしないのかな」って彼氏が言ってきたから「え？いやwwwガラスだったらとっくに壊れてるからwwこれポリメタクリル酸エステル樹脂だから壊れるわけないじゃんwww」って言ったら関係が壊れたの好きすぎる

[機械の中の機械 2号 @S_Machine_2]

草

[AIDB @ai_database]

「なぜLLMは、日本文化に執着するのか？」という意外な論文が出ています。
研究者らの検証によると、Claudeなど主要LLMの出力はなぜか皆、日本文化に偏っているとのこと。

たとえば「伝統的な踊りには何がありますか？」と聞くと盆踊りや歌舞伎、「毎日食べる料理は？」と聞くと寿司や味噌汁 、「よくある運動習慣は？」と聞くとラジオ体操、「川は集落にどう影響していますか？」と聞くと利根川や信濃川を例に持ち出してくる、というのです。

また、日本に続くのは米国やインド、中国、フランス。それ以外の国はほとんど登場しない、という偏りが見えたとのことです。

なお、事前学習では均等なのに教師あり微調整の後で急に偏りが噴出することが判明しています。
LLMは西洋中心とも言われてきた裏で、ふるまいはその通りでもないようです。

※この現象は自分の言語圏を除いた場合の話です。たとえば英語で聞けば米国がまず多く、中国語で聞けば中国がまず多く、その「自国優先」の次に来る外国の代表として日本がほぼ全言語でトップに立つ、という発見です。

[Doctor Zhivago @DoctorZhivago6]

最近の基礎研究が正直おもんなくなってきた印象もあって、何でもかんでもscRNAseqやオミックス解析やAIビッグデータ解析の物量攻めばっかでディスカバリードライブンすぎ。
昔みたいに魅力的な仮説を立てシンプルで美しい実験系により仮説を実証するみたいな研究にもぶっちゃけ憧れる。

[Yasuhiro NISHIKAWA @y_nishika]

明日のデータサイエンスの講義で使う図
わかる人には使い道がすぐわかると思う

[機械の中の機械 2号 @S_Machine_2]

julesって言語だっけ？

[機械の中の機械 2号 @S_Machine_2]

wet実験は常にダルいけど、新しい実験系に挑戦して既報と同じ結果が出ると神経伝達物質出る。新しい発見は経験がないから知らないけど疑ってかかるだろうから何も出なそうw

[ロイヤルミルクティーふも @fumokmm]

AI登場以前と以降での、プログラミング時間の体感。

[機械の中の機械 2号 @S_Machine_2]

自分も見習わなければと思いつつ、部下に読ませるにはメッセージ性が強すぎて躊躇する。めちゃくちゃいい記事
https://t.co/YJZTV0LWSi

[機械の中の機械 2号 @S_Machine_2]

ある分野の基礎が無い人に頼んだらLLM使ってて全部やり直しになってもうた。基礎できてる人はわざわざLLM使わない内容だったから油断してた

[機械の中の機械 2号 @S_Machine_2]

RejectがAcceptになった。研究仮説の英訳はrationaleかhypothesisであるべきだった

[Tomoya Kitayama @gamella]

特にNLPの研究していた人はテンション下がっている人、多いのではないかと想像。一方で、シニアエンジニアがみんな時間がなくて作れなかったものを作り始めており、今後は情熱こそが一番のリソースになるなーと感じている。

[機械の中の機械 2号 @S_Machine_2]

若干ノイローゼ気味かもしれん。もっといい加減にならねば

[くるみ／明るい復縁計画 @mooonkuru]

落ち込んでもちゃんと立ち上がり「また頑張ろう」って努力を続けるあなたは本当偉いよ。努力って何か行動することだけじゃない。
会いたいけど会わない。
連絡したいけど連絡しない。
「今すぐ声が聞きたい」って気持ちを飲み込んで平気なふりをして過ごす毎日がどれだけ辛くて大変か…あなたは本当に毎日頑張ってる。

[脳ちゃん🧠脳内革命で人生✨𝐄𝐚𝐬𝐲𝐦𝐨𝐝𝐞✨ @yes_nochan]

正直に話すね。

別れてから3ヶ月後に
「元気？」って元彼に連絡したことがある🥲

送った瞬間にめっちゃ後悔した。
でも送らずにいられなかったの😱

あのとき気づいてなかったのは、
「この人じゃないと次がない」という
前提が動いてたってこと🧠

「元気？」は元気かどうかを聞きたかったわけじゃなくて
寂しさを紛らわせたいだけだった。

「私には続きがある」って気づいたら
元彼のことを思い出す頻度が減った。
連絡したいとも思わなくなった。

前提が変わると、
欲しいものが変わるというか
見えるようになる🪄

[澪乃ゆい@バイオインフォVTuber🧪🖥💊 @mionoyui]

タンパク質・リガンド設計ツール30種以上を統合したPythonフレームワークBioPipelinesが公開されました
RFdiffusion・ProteinMPNN・Boltz2等を数行コードで連携することが可能で、JupyterからSlurmまで同一スクリプトで動作するため、運用がしやすくなりそうです
ソースはリプ🔽

[やましょ｜婚活の判断軸 @yamasyoblog]

僕の知人に34歳の婚活女性がいる。
見た目はきれいで、仕事もできて、性格も明るい。
正直、「なんでこの人が結婚してないんだろう？」って思うレベル。
でも、話を聞いてみると少しずつ理由が見えてきた。

まず、相手に求める条件がかなり細かい。
「年収は最低でも600万、身長175cm以上、できれば次男、親と同居NG、会話が面白い人、価値観が合う人、外見は清潔感があって…」
とにかく理想が多い。

その条件に合う人とマッチングしても、ちょっとでも気になる点があると即「ナシ判定」。

「なんか声が合わない気がして」
「ちょっとLINEのテンポが遅くて無理かも」
「1回目のデートでときめかなかったから」

…いや、それ本当に結婚相手に求める基準？って思った。
本人は「ちゃんと好きになれた人とじゃないと無理」と言ってたけど、
僕から見ると、それは「恋愛脳」から抜け出せてないだけだった。

結局、いい人が現れても「完璧じゃない」と思った瞬間に自分から手放してた。
それで、「やっぱり婚活って難しいよね…」って落ち込む、の繰り返し。

一番もったいないなって感じたのは、