Shunta Sakaguchi

developmental biology/ single cell transcriptomics
本名アカがないと不便なので作りました

[Shunta Sakaguchi @SakaguchiShunta]

@gojira_kusorep 本人のようです

[Shunta Sakaguchi @SakaguchiShunta]

カバー飾りました
https://t.co/mhCXZUR5wk

[中日新聞 @chunichi_denhen]

【訃報】DNAの小さな断片「岡崎フラグメント」発見の岡崎恒子さん死去、93歳　名古屋大学初の女性教授

▼記事はこちら
https://t.co/7ApGkxblCk

[Masahiro Shinya （日本語） @shinyamasahirox]

Our new paper is now available!

野球審判のストライク・ボール判定のカウントバイアスは、ベイズ感覚統合で数理的に説明できるよ！

一般向けの詳しい説明は、プレスリリースの際に…

https://t.co/esgFihPQPf

[Kaede Shiohara @KaedeShioharaCS]

Introducing a new generative model, Empirical Variational Autoencoder (EVA):

We can revive VAEs for sequential generation only with an extra single linear layer that predicts the next prior without VQVAEs or diffusion models.

Project page:
https://t.co/vc0Ft4EgzZ

[Rahul Satija @satijalab]

Our stream for Single Cell Genomics Day goes live tomorrow morning at https://t.co/KJpeGwWLIr , look forward to seeing you there for our 10th year!

[Shunta Sakaguchi @SakaguchiShunta]

グダってしまい、申し訳ない......

[Shunta Sakaguchi @SakaguchiShunta]

#JSAI2026
まもなくです
https://t.co/7jWhv0ylfk

[Honda Naoki @HondaNaoki]

来週は人工知能学会。
https://t.co/wpOeDKRy8M

うちからは
坂口さん（@SakaguchiShunta）がVAEベースの新しいオミクス解析手法について、
堤さん（@masa10223_）が変分ベイズエネルギーランドスケープによる精神状態解析について、
話します。

[Shunta Sakaguchi @SakaguchiShunta]

前橋へ向かう電車、高崎に宿を取りそびれた学会参加者がめちゃくちゃ目立つな……

[Yohei Kondo @KondohYohei]

Our preprint is now out.
We present a method for inferring voxel-wise maps of tau amplification rates from PET scans using differentiable simulation of prion-like propagation.

https://t.co/h2jMrgP9x3

[arc@dmz @arcatdmz]

今、私が前座で話し終わってちょうど前島さん（@OLMDRD）が #JSAI2026 でお話しされているところですが、ここまでまとまったアニメの作り方の解説（しかも技術者目線）は、私は初めて見ます。
https://t.co/DUI7HRTlSR

[Honda Naoki @HondaNaoki]

来週は人工知能学会。
https://t.co/wpOeDKRy8M

うちからは
坂口さん（@SakaguchiShunta）がVAEベースの新しいオミクス解析手法について、
堤さん（@masa10223_）が変分ベイズエネルギーランドスケープによる精神状態解析について、
話します。

[Honda Naoki @HondaNaoki]

【金子貴輝さんのプレプリント】
1細胞オミクス解析における新しいコンセプトのクラスタリング法 Monju（深層生成モデル）を開発しました

従来：次元削減してからクラスタリング
Monju：次元削減（＝解釈）しやすいようにクラスタリング

https://t.co/e396fluibn

[Honda Naoki @HondaNaoki]

明日13時からです！

[Honda Naoki @HondaNaoki]

Yuichiro Yada (@yadapo)'s paper is out!

Patients with the same diagnosis can follow different disease trajectories.

Our machine-learning method decomposes disease progression into patient-specific speed and pathway, enabling future prediction from first-visit data.

[理化学研究所（理研） @RIKEN_JP]

マイクロペプチドがタイマーとして細胞の運命を導く
－複雑な器官形成を支える細胞分化の制御切り替え－

doi: https://t.co/fZNJoTUlQr

詳細はこちらをご覧ください⬇️
https://t.co/vnIawBhxl4

#理研プレス

[Honda Naoki @HondaNaoki]

小池くんとの研究がPNASから出版！

データ駆動モデリングで脳の配線原理を解読した研究です。

神経はなぜ正しい場所につながるのか？

脳の接続データから神経を導く 「見えない分子の地図」 を解読。

さらに遺伝子発現データのみから脳の配線構造の再構成にも成功。

https://t.co/vZYGjuHBYB

[Shunta Sakaguchi @SakaguchiShunta]

科研費取れました

[Honda Naoki @HondaNaoki]

ふと気になって、Cell系列のeditorたちの拠点国を調べてみた（chatGPTを使って）。
そしたら、日本からのeditorは０人だった…。

[Shunta Sakaguchi @SakaguchiShunta]

レビューを読んでたら引用にSpemann et al., 2024と出てきて「1924のミスでは？？？」となったが、どうやら、（おそらく100周年で）再出版されたもののメタデータをそのまま拾って載せたらしい。こういう場合はどう引用するのが正解なんだろう……