Tsukazaki-LAB

構造生命科学, Structural Life Science

[Tsukazaki-LAB @TsukazakiL]

奈良先端大・構造生命科学（塚崎研）のサイトをリニューアルしました。

https://t.co/JfqkuzmktR

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[奈良先端科学技術大学院大学 @NAIST_MAIN]

【お知らせ】
「先端研究基盤刷新事業（EPOCH）」の採択が決定
https://t.co/3lt8Iby0u5

#奈良先端大 #NAIST

[奈良先端科学技術大学院大学 @NAIST_MAIN]

本日10時🕙スタート‼️

NAISTオープンキャンパス2026.02開催🏫✨
事前申し込み不要🆗
お気軽にお越しください😊

開催日時：2026年2月28日（土） 10:00～16:00
場所：奈良先端科学技術大学院大学

詳細は、以下の特設サイトから！
https://t.co/K9mYhYkNjb

#奈良先端大 #NAIST #オープンキャンパス

[NAISTバイオサイエンス領域 @NAIST_BS]

NAIST Granite Program の支援により、D2学生がシンガポール南洋理工大学 生物科学学部へ約4週間の短期留学を実施しました。研究技術の習得と国際交流を深める貴重な機会となりました。
https://t.co/TafKOogqNH

#構造生命科学研究室 #塚﨑研 #NAISTバイオ

[NAISTバイオサイエンス領域 @NAIST_BS]

第5回ファージセラピー研究会 にて、D2・細田さんが ポスター賞を受賞しました。おめでとうございます。
https://t.co/7Q7eOiAHZ0

#構造生命科学研究室 #塚﨑研 #NAISTバイオ

[NAISTバイオサイエンス領域 @NAIST_BS]

NAIST 公式チャンネルの動画
「人口減少社会に挑む ― 奈良先端大が提案する未来の大学と社会」の撮影に協力しました。ぜひご覧ください。
https://t.co/IAbJl2Gxd3

#構造生命科学研究室 #塚﨑研 #NAISTバイオ

[奈良先端科学技術大学院大学 @NAIST_MAIN]

【イベント報告】NAISTプレジデンツフェロー2025表彰式を実施（2026/1/6）
https://t.co/7NiOx8ws0B

#奈良先端大 #NAIST

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蛋白質科学会アーカイブにて、

大矢 康太ら

「外膜形成に関わるメタロプロテアーゼ BepA の構造と機能」

を発表しました。

BepA の動的な作用機構を、既報研究と AlphaFold 予測構造をもとに議論しています。

https://t.co/demuMDUgxk

[Tsukazaki-LAB @TsukazakiL]

Using multiple cryo-EM structures, we revealed how the periplasmic chaperone SurA dynamically changes its conformation to deliver substrates to the BAM complex.

Miyazaki et al., 2025, bioRxiv

https://t.co/g7zkwqiwhz

[Tsukazaki-LAB @TsukazakiL]

複数のクライオ電子顕微鏡構造解析により、ペリプラズムシャペロンSurAがBAM複合体との相互作用を利用してダイナミックに構造変化し、基質をBAMへ輸送する分子機構を明らかにしました。

Miyazaki et al., 2025, bioRxiv

https://t.co/g7zkwqiwhz

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The complex between a bacteriophage peptide and the essential membrane protein MurJ — Part II

Both SglPP7 and LysM inhibit MurJ, but through distinct binding modes — a striking case of convergent evolution.

Hosoda et al., bioRxiv (2025)

https://t.co/IcDlImMkd7

[bioRxiv Molecular Biology @biorxiv_molbio]

Structural basis for MurJ inhibition by phage lysis protein SglPP7 suggesting convergence https://t.co/xezKJn771E #biorxiv_molbio

[Tsukazaki-LAB @TsukazakiL]

細菌に必須の膜タンパク質 MurJ と、それを阻害するファージペプチドとの構造解析・第２弾！

ファージ由来の SglPP7 と LysM は、同じ Lipid II フリッパーゼ MurJ を標的にするが、結合様式は異なる。収斂進化のようだ。

Hosoda et al., bioRxiv (2025)

https://t.co/IcDlImMS2F

[bioRxiv Molecular Biology @biorxiv_molbio]

Structural basis for MurJ inhibition by phage lysis protein SglPP7 suggesting convergence https://t.co/xezKJn771E #biorxiv_molbio

[Tsukazaki-LAB @TsukazakiL]

３つのうちの３つ目が Science Advances に掲載されました。

Kohga et al., Sci. Adv. (2025)

バクテリオファージ由来の小型タンパク質LysMが、Lipid II フリッパーゼMurJの機能を阻害する様子をクライオ電子顕微鏡解析で明らかにしました。

https://t.co/u5ZibBF0kA

[Tsukazaki-LAB @TsukazakiL]

Our MurJ/LysM paper has been published in Science Advances.

Kohga et al., Sci. Adv. (2025).

This study elucidates, through cryo-electron microscopy, the mechanism by which the small bacteriophage-derived protein LysM inhibits the lipid II flippase MurJ.

https://t.co/u5ZibBF0kA

[奈良先端科学技術大学院大学 @NAIST_MAIN]

【プレスリリース】
ウイルス由来のペプチドが細菌の生命必須の装置を止める仕組みを解明
〜薬剤耐性菌克服への重要な手掛かり〜
https://t.co/jXV6DPvN6Z
#奈良先端大 #NAIST

[Tsukazaki-LAB @TsukazakiL]

こちらは、2025年1月に発表した「タンパク質が膜透過する様子を高速AFMで捉えた報告」です。
ナノディスクに組み込んだ１ユニットのSecYEG-SecAを、紐状のタンパク質（ペプチド）が通過しています。

Kanaoka et al., Nature communications (2025)

https://t.co/eK9ZaHRhY8

[奈良先端科学技術大学院大学 @NAIST_MAIN]

／
10月8日は #レーザーディスクの日💿
＼

レーザーディスクは直径30cmと大きいですが、こちらは、直径約100nmの膜タンパク質含有ナノディスクです。

構造生命科学研究室では、こうしたナノディスクを用いてタンパク質の性質などを調べていますhttps://t.co/8kMDAgAFzM

#奈良先端大 #NAIST

[Tsukazaki-LAB @TsukazakiL]

Our MurJ/LysM paper has been published in Science Advances.

Kohga et al., Sci. Adv. (2025).

This study elucidates, through cryo-electron microscopy, the mechanism by which the small bacteriophage-derived protein LysM inhibits the lipid II flippase MurJ.

https://t.co/u5ZibBF0kA

[NAISTバイオサイエンス領域 @NAIST_BS]

塚崎研では、現在、発表前の論文（投稿中）を3つbioRxivにアーカイブしています。
bioRxivは生物系研究を査読前に公開するサイトです。
最先端の研究にご興味あればぜひ！
https://t.co/OihJ1sTGPm
https://t.co/6l91wVG6fS
https://t.co/kKfdpvh14p

#構造生命科学研究室 #塚崎研 #NAISTバイオ

[Tsukazaki-LAB @TsukazakiL]

３つのうちの３つ目が Science Advances に掲載されました。

Kohga et al., Sci. Adv. (2025)

バクテリオファージ由来の小型タンパク質LysMが、Lipid II フリッパーゼMurJの機能を阻害する様子をクライオ電子顕微鏡解析で明らかにしました。

https://t.co/u5ZibBF0kA

[Tsukazaki-LAB @TsukazakiL]

３つのうちの２つ目が FEBS Letters に掲載されました。
Takahashi et al., FEBS Letters (2025)

Leminorella grimontii の糖輸送体GatCの結晶構造とクライオ電顕構造を解明しました。

> 投稿時のアーカイブはこちら：
> https://t.co/GuTrDGnMiF

https://t.co/Ntc5UIR0FB

[Tsukazaki-LAB @TsukazakiL]

「構造生命科学　AlphaFold時代にどう活かす？」

ー生命機能を解く、変える、創るための技術と研究戦略ー　　加藤英明，西増弘志／編

研究室用に購入しました。
所属学生にもおすすめします。

https://t.co/cB0eGdOJsH

[Tsukazaki-LAB @TsukazakiL]

３つのうちの２つ目が FEBS Letters に掲載されました。
Takahashi et al., FEBS Letters (2025)

Leminorella grimontii の糖輸送体GatCの結晶構造とクライオ電顕構造を解明しました。

> 投稿時のアーカイブはこちら：
> https://t.co/GuTrDGnMiF

https://t.co/Ntc5UIR0FB

[Tsukazaki-LAB @TsukazakiL]

３つのうちの１つ目が Cell Reports に掲載されました。
Miyazaki et al., Cell Reports (2025)

外膜タンパク質複合体 LptDE の成熟過程の後半において、小型タンパク質 LptM が LptD を安定化することを、クライオ電子顕微鏡解析と機能解析により明らかにしました。

https://t.co/mOk4LKoYyt

[NAISTバイオサイエンス領域 @NAIST_BS]

塚崎研では、現在、発表前の論文（投稿中）を3つbioRxivにアーカイブしています。
bioRxivは生物系研究を査読前に公開するサイトです。
最先端の研究にご興味あればぜひ！
https://t.co/OihJ1sTGPm
https://t.co/6l91wVG6fS
https://t.co/kKfdpvh14p

#構造生命科学研究室 #塚崎研 #NAISTバイオ

[奈良先端科学技術大学院大学 @NAIST_MAIN]

【プレスリリース】
細菌の生存に不可欠なリポ多糖の輸送役のタンパク質が、小型タンパク質と形成する複合体の構造と機能を解明 〜小型タンパク質のわずか10個未満のアミノ酸の領域で全体構造を安定化する重要な機能を発見〜
https://t.co/aUnWcAxUoP
#奈良先端大 #NAIST