OlvTools | RNA-Seqデータ解析ツール

ライフサイエンスの研究に役立つツールを開発しています。
#OlvTools

[OlvTools | RNA-Seqデータ解析ツール @_OlvTools]

【RNA-Seqデータ解析ツール】

RNA-Seqデータ解析ツールをリリースしました。外部委託や共同研究者への依頼は行いたくない、自分で解析手法を勉強する時間がないといった方におすすめです。 Linuxのコマンド操作やスペックが高いパソコンの準備は不要です。是非お試しください。

#RNAseq

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【RNA-Seqデータ解析ツール】
これまでヒト・マウス・ラットに限定されていた、FASTQファイルからの遺伝子発現量の定量解析が、幅広い生物種にも対応しました。 ゲノムファイルとアノテーションファイルがあれば、あらゆる生物種での解析が可能です。
是非お試しください。

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【RNA-Seqデータ解析ツール】

FASTQファイル���ら遺伝子発現量の定量を行う際に、品質管理とアダプターのトリミングを実施できるようになりました。これにより精度と信頼性の高い結果が得られるようになりました。是非お試しください。

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【RNA-Seqデータ解析ツール】

Volcano plotやヒートマップといったグラフのダウンロードにつきまして、今までPNGファイルのみ対応していたところ、SVGファイルにも対応しました。これによりIllustrator等でのグラフの編集が容易になりました。是非お試しください。

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【RNA-Seqデータ解析ツール】

Volcano plotに加えてMA plotでもインタラクティブに操作できるようになりました。各ポイントにカーソルを合わせると、どの遺伝子に対応しているか簡単に確認できます。是非お試しください。

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@bio_labcode ありがとうございます！フロントエンドはReactを使用しておりまして、グラフ描画部分にはEchartsを使用しています。

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【RNA-Seqデータ解析ツール】
Volcano plotをインタラクティブに操作できるようになりました。各ポイントにカーソルを合わせると、どの遺伝子に対応しているか簡単に確認できます。是非お試しください。

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【RNA-Seqデータ解析ツール】
Volcano Plotをアップデートしました。
・発現が上昇した遺伝子を赤、減少した遺伝子を青でプロット
・しきい値に破線を描画
是非お試しください。

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【RNA-Seqデータ解析ツール】
アップロードできるFASTQファイルのサイズ制限が緩和され１ファイルあたり8GBまでとなりました。公共データのアクセッション番号を指定する場合にも同様に8GBまでとなります。
是非お試しください。

[KNakamura @manchester0623]

バイオインフォマティクス検定を受けました。
#OlvTools #バイオインフォマティクス検定 https://t.co/JTr9MPWZCi

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【RNA-Seqデータ解析ツール】
FASTQファイルのアップロードが高速になりました。（※動画は早送りです）
是非お試しください。

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【RNA-Seqデータ解析ツール】
リードカウントに加えてTPMもダウンロードできるようになりました。是非お試しください。

[ミズワラビ🌱🍀🍂 @kosugigoke]

昔はRNA-Seqはvirtual boxにubuntu入れて、fastqファイルをQCして、リファレンス配列をダウンロードしてTopHat2でマッピング、Cufflinksで発現量算出、Cuffdiffで発現変動遺伝子を検出、Rでヒートマップ等作成って感じで解析していたけれど、今はオンラインの解析ツールがあるんだよね。便利になったな

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【RNA-Seqデータ解析ツール】
解析をバックグラウンドで実行するようにアップデートしました。これにより解析中はパソコンをシャットダウンして待つことが可能になります。是非お試しください。

[TATORO @tatro_os]

偏りがすごい…
NGSも自分が扱ったことないものだと分からんね…

バイオインフォマティクス検定を受けました。
#OlvTools #バイオインフォマティクス検定 https://t.co/xZ6tXJR4dQ

[OlvTools | RNA-Seqデータ解析ツール @_OlvTools]

皆様ご利用いただきありがとうございます！
おかげさまで公開1日で３００人以上の方に受験いただけました。
一部の方の結果は、#バイオインフォマティクス検定 からご覧いただけますので、是非チェックしてみてください！

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【バイオインフォマティクス検定】
バイオインフォマティクス検定をリリースしました。バイオインフォマティクスの知識がどの程度身についているか把握するためにご利用ください。結果はすぐにレーダーチャートで可視化されます。
#OlvTools #バイオインフォマティクス検定

[ブロッコ @BroccoDQX]

バイオインフォマティクス検定を受けました。
#OlvTools #バイオインフォマティクス検定 https://t.co/46hx9ip8qY

インフォマティクスはドシロウトだもんなー。分かる。

[RdPnd @RdPnd0]

Linuxが満点で生物情報が60なの謎すぎる…笑

バイオインフォマティクス検定を受けました。
#OlvTools #バイオインフォマティクス検定 https://t.co/AYe2mujNFH

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バイオインフォマティクス検定はこちらからアクセスできます！
https://t.co/VKVeo6ZxRC

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【バイオインフォマティクス検定】
バイオインフォマティクス検定をリリースしました。バイオインフォマティクスの知識がどの程度身についているか把握するためにご利用ください。結果はすぐにレーダーチャートで可視化されます。
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