計算化学.com

計算化学と華山転生が大好きなJK。
羽化登仙を目指す玄境の計算化学者。

[計算化学.com @ComputerChem]

これ使い始めてから授業資料の作成がめちゃくちゃ楽になりました。
MolDraw は cdxml ファイルで出力してくれるので、そのまま ChemDraw にも貼り付けられます。

[Rafeeque @rafeequemavoor]

Moldraw chrome addon preview:

Don't spend time drawing all molecules you find online or in PDFs.

Take screenshots moldraw chrom addon will convert to smiles and editable strctures..

[計算化学.com @ComputerChem]

@Ag_smith 前の大学で卓上NMR購入したときに、磁場の測定を複数箇所で行いました！
エレベーターの近くはだめ、１階も���くを車が通るからダメと言われました。金属の塊が高速で動くとダメみたいでした。

[計算化学.com @ComputerChem]

���愛と幻想のファシズム」
「5分後の世界」
「ヒュウガ・ウイルス」
など、面白かったなぁ。

高校生の頃に読んだ作品は、今でも特に思い出深いものが多い。

[幻冬舎BOOKS @BOOKS_GENTOSHA]

村上龍氏　ご逝去のお知らせ

作家の村上龍氏が2026年10月17日に　自宅で逝去されました　享年74歳
ここに謹んで���悼の意を表し　ご報告申し上げます
葬儀におきましては　家族葬として執り行われました

『限りなく透明に近いブルー』に始まり　常に若い世代に向けて衝撃的な作品を発表し続けた村上龍氏の早すぎる逝去の報せを受け　深い悲しみに堪えません
時代のトップランナーとして疾走した同氏の安らかな眠りをお祈り申し上げます

有限会社村上龍事務所
株式会社幻冬舎編集本部

[Takuto Ohmura @t0hmura]

また、AI Agent用のSkillsも整備したので、Claude/Codex/Cursor等のAI Agentに反応機構解析を自動で行わせることも可能です。

併せてホームページも更新しました。興味ある方は是非ご覧ください��

https://t.co/Bg50IlOVui

[Takuto Ohmura @t0hmura]

酵素反応機構解析ツールpdb2reactionの論文がACS Omegaに掲載されました！

https://t.co/H4zUMhGzJ1

PDB等の複合体構造から、活性部位モデル構築→MEP探索→TS最適化→IRC→熱化学までの反応機構解析を、機械学習ポテンシャルを用いてend-to-endで実行できます。

GitHub: https://t.co/SFf73yoXr1

[宮内洋 @Hiroshi_Miyauch]

人格者がノーベル賞を受賞するのは珍しいのではないだろうか。

[計算化学.com @ComputerChem]

研究者向けに最先端モデルが提供される ChatGPT for Academic Researchers の申請通りました！

SPReAD、萌芽、JST さきがけとか採択が続く。やっぱり俺は運だけで生きてる！

[計算化学.com @ComputerChem]

さきがけ2回目、採択されました〜🎊
1回目の採択時に周囲から「マグレ」と言われましたが、、、2回目もマグレでした〜（笑）😄

4回応募して3回面接、2回採択。採択率50%📊
採択か不採択かの二択であれば、これは統計的に極めて「妥当な」数字と言えるはず……！✍️

今年はSPReAD（くじ引き）も当たったりと、運の強さが完全に研究能力を上回っています。実力ゼロでも、運さえ良ければアカデミアで生き残れることを体現し続けてます。🎲✨

[Takuto Ohmura @t0hmura]

PDBから反応エネルギープロファイル・TS構造を高速・簡単に求めるソフトウェア、 ”pdb2reaction” のGUI版をGoogle Colab Workspaceで公開しました。

直感的な操作で、誰でも簡単に、無料で酵素反応機構解析が可能です。

GitHub: https://t.co/SFf73yoXr1

Colab GUI: https://t.co/YJ9evNz8Bn

[Akimasa Miyanaga @miyaaki1978]

2026年度BINDSユニット連携講習会
ColabReactionの講習会など
日時：2026/10/23 16:00-19:00
会場：Zoomによるオンライン
https://t.co/ahEzM5pRCU

[Chem-Station（ケムステ） @chemstation]

数日かかっていた反応機構解析を、わずか数分に！ | Chem-Station (ケムステ) https://t.co/1P8XXOR4Hw

[計算化学.com @ComputerChem]

@K_Oisaki 私は、あんな超短い申請書に文句言う人が大勢いたことに驚きました！みんなあまり申請書書かないんですかね？
私も私の周りの人も 1〜2 週間に 1 個は何かしらの助成金の申請書を書いている人が多いです。他の助成金に比べたら、SPReAD の申請書は短くてラッキーという感じでした。

[計算化学.com @ComputerChem]

@shin1koda 今年の分子シミュレーション討論会は参加されますか？
論文を引用して頂いて大変感謝しております。一度お会いできればと思っております。

[計算化学.com @ComputerChem]

@rio_chem QM/MM を機械学習ポテンシャルを用いて高速化した ML/MM も１年前にツールが出てます。

https://t.co/BgDwaa4yX0

[Takuto Ohmura @t0hmura]

機械学習ポテンシャル(MLIP)を用いて、酵素が触媒する化学反応の機構を高速に解析可能にするPythonライブラリ、ML/MM toolkitを公開しました。

全体��1万原子を超える系でも、約2時間でΔG‡・ΔGが得られました。

ChemRxiv：https://t.co/VOrGGYHjmd

Github：https://t.co/LPVkqhh0w9

[計算化学.com @ComputerChem]

@rio_chem 機械学習ポテンシャルUMAを用いた遷移状態構造探索のツールが一年前に出てますので、もし良ければ使い下さい。数分程度で TS を求めることができます。
https://t.co/b6VfOXIxCX

[計算化学.com @ComputerChem]

従来のDFT計算より100倍以上高速なのに同等の精度で遷移状態構造探索を行うことができるクラウドベースの無料の計算ツール ColabReaction が東京大学の研究グループから発表されました。

https://t.co/jtzCsO5K4R で誰��も無料で使用可能です。

プレプリント: https://t.co/Sf7Ehqbc5n

[計算化学.com @ComputerChem]

最近、嫌なことが続いている。
こういうときは、自分に原因があることが多い。態度を改め、もう一度謙虚な気持ちで、目の前のことにコツコツ取り組もうと思う。

JSTさきがけの面接選考の通知が届いた。
30代で2度目のさきがけ採択なるか？

面接の準備頑張りたいが、その前にまた招待講演がある。。。

[計算化学.com @ComputerChem]

国際学会の招待が来た。

さきがけ領域会議 --> 中国の学会 --> シンガポールの学会 という 8 日間の連続出張を引き受けるかどうか思案中。
どちらの学会も旅費・宿泊費・謝金が支給される招待講演だが、体力ない自分にはキツイ。。。

もっと国際的な知名度・存在感を向上させるよう領域会議でいつも言われているから、国際学会に参加した方が良いのは分かってはいるが、キツイ。

[計算化学.com @ComputerChem]

七夕のたびにこのツイートを思い出す。

[竹薮林 @takeyaburinC]

今年のお願い

[計算化学.com @ComputerChem]

@Ag_smith 国際学会ですか？