Pawel Krawczyk

Bioinformatician, Opinions are my own

[Pawel Krawczyk @pakraw]

🎉 Incredibly proud to share my first-author paper in @Nature! Heartfelt thanks to my mentor @AndrzejDziembo1 and the brilliant team at @DziembowskiLab. More details in the 🧵below ⬇️ https://t.co/IY0sGzJJQc

[Pawel Krawczyk @pakraw]

I’m happy to share that our @Nature paper on #mRNA-1273 re-adenylation was awarded 1st prize in the @IIMCB_Poland competition for the best #paper published in 2025. Huge congrats and thanks to all co-authors. A very nice closing chapter to my now-finished academic career.

[IIMCB, Warsaw, Poland @IIMCB_Poland]

Best Papers Awards 2025 at IIMCB announced! 🥳

1st prize
"Re-adenylation by TENT5A enhances efficacy of SARS-CoV-2 mRNA vaccines", Nature ➡️ https://t.co/jd4155CXDM

[Ming "Tommy" Tang @tangming2005]

5/
Stats gives you tools, not answers.
P-values don’t tell you if it’s interesting.
Only biology can. Context is everything.

[Pawel Krawczyk @pakraw]

Bardzo ważny wątek. Dzięki Funduszowi jako dzieciak z małej miejscowości miałem okazję zobaczyć jak robi się prawdziwą naukę, coś co było niedostępne dla mnie w inny sposób. To inicjatywa która bardzo ciągle potrzebuje wsparcia.

[Adam Gendzwill @adamgendzwill]

W Zamku Królewskim rozpoczął się 42 rok (!!) programu pomocy wybitnie uzdolnionej młodzieży, prowadzony przez Fundusz Zdolni (wcześniejsza nazwa: Krajowy Fundusz na rzecz Dzieci).

Ogromnie ważne przedsięwzięcie, które - niestety - umyka uwadze wielu.

Krótki wątek na ten temat

[Maciej Serda @SerdaMaciej]

Moi drodzy już w 2026 premiera spektaklu DZIADY NAUKOWE.
@donaldtusk @Domanski_Andrz @MarcinKulasek

[Agata Starosta @MissAgataStar]

Na naukę powinny się znaleść pieniądze. Bądźmy jak Korea, kraj stale zagrożony atakiem, inwestujmy w badania, rozwój, innowację.
Kupowanie sprzętu bez odpowiedniego szkolenia ludzi, rozwijania własnych rozwiązań nie wystarczy.
Własne badania, rozwiązania to suwerenność i bezpieczeństwo.
@MNiSW_GOV__PL @MarcinKulasek @PremierRP @MF_GOV_PL @Domanski_Andrz

[Pawel Krawczyk @pakraw]

@Kevin_McKernan @HateTheMachine Linearization is not always 100% efficient (although it should be)

[Pawel Krawczyk @pakraw]

@Kevin_McKernan @HateTheMachine No, BLAST results clearly indicate the hit was in the 3'UTR (shared between vaccines), not in the gp145 coding sequence. So telling people there’s HIV in the vaccine was a big overstatement, which renowed scientist should be aware of

[Pawel Krawczyk @pakraw]

@Kevin_McKernan @HateTheMachine I already told you I'm not sure those are plasmid sequences - more likely IVT read-throughs. The paper focuses on a completely different subject, so there's no reason for a correction

[Pawel Krawczyk @pakraw]

@HateTheMachine No, there is no HIV sequence. @Kevin_McKernan updated his post. gp145 presence was claimed too fast, without the proper interpretation of obtained BLAST data

[Vanessa Linke 🦋 @MassSpecVaniLi.bsky.social @MassSpecVaniLi]

Last week to apply!

[Vanessa Linke 🦋 @MassSpecVaniLi.bsky.social @MassSpecVaniLi]

🤩 JOB ALERT 🤩 Come work with me and two cutting-edge LC-MS/MS systems at our brand new Mass Spectrometry Facility @IIMCB_Poland in Warsaw! Apply here https://t.co/Rr0miaLrXi or send any questions my way. #TeamMassSpec please share widely!

[Ming "Tommy" Tang @tangming2005]

1/ Bioinformatics is NOT just statistics.
The p-value is small, but is it biologically meaningful?
Let’s talk. 🧵

[Pawel Krawczyk @pakraw]

Very important thread! I 100% agree with all the points!

[Ming "Tommy" Tang @tangming2005]

1/ Bioinformaticians: our people skills matters as much as our code
Here’s why communication is your most underrated tool 🧵

[Pawel Krawczyk @pakraw]

@gaworj @oxfordnanopore Great! I was giving direct RNA sequencing training there last year with my colleagues, hope they remembered something 🙂

[Pawel Krawczyk @pakraw]

Interesting. I indeed observed something like foldback when sequencing linear plasmids some time ago. will give it a try.

[antisense. @razoralign]

Detecting Foldback Artifacts in Long Reads https://t.co/xa16gQsUlH

[Jan Gawor @gaworj]

The second Pole in space in our Polish history. 47 years after the flight of a Polish soldier, we have a scientist in space. 🚀👨‍🚀🇵🇱

[Agata Starosta @MissAgataStar]

Rekrutujemy! Doktorat u mnie w labie, w projekcie i pod opieką Olgi Iwańskiej w ramach Sonata NCN

[Łukasz Okruszek @LOkruszek]

Gdyby media poświęcały regularnie tyle uwagi walce o finansowanie nauki, #3ProcentNaNaukę, #NCNtoTlen i sukcesach polskich naukowców co tej partykularnej historii, to naprawdę bylibyśmy jako kraj w innym miejscu dziś.

[Pawel Krawczyk @pakraw]

@revpdh @toobaffled Thank you for this voice of reason among all these conspiracy theories

[IIMCB, Warsaw, Poland @IIMCB_Poland]

🔬 Join us for a full-day event at IIMCB in collaboration with @thermofisher. Discover the power of Glacios 2 Cryo-TEM & Hydra Bio Plasma-FIB. Agenda and details: https://t.co/OVIXpIQjYg
#CryoEM #StructuralBiology @REA_research #INMOLCELL #FunduszeUE