Tomoki T. Mitani

KI🇸🇪& AsstProf_Niigata U🇯🇵/M.D.Ph.D/ 3D whole-brain spatial omics revealed “Microglial security hole”→

[Nalini Rao @NaliniRRao]

Excited to share my first postdoc work co-led with Yuichi Chayama, from @andcyang lab - now out in @CellCellPress! We created a genetic system to trace how the brain clears waste, uncovering surprising new biology about waste clearance pathways. 🧵1/9

🔗 https://t.co/1s7AcXZcv4

[nature @Nature]

Nature research paper: Sustaining microglial reparative function enhances stroke recovery

https://t.co/hyi0SyhIcm

[Takeshi Imai @TakeshiImaiLab]

Our live tissue clearing paper is out in @naturemethods! We achieved optical clearing of mammalian brain tissues without compromising normal neuronal function. Big congrats to @Shigenori774 and our wonderful collaborators! 🎉
https://t.co/joMB5odihK (1/10)

[Takeshi Imai @TakeshiImaiLab]

機能を保ったまま生きた脳組織の透明化を実現した論文がNature Methods誌に掲載されました。
2013年に固定組織の透明化法を発表した当初、「いつか生きたまま透明にできますか？」という質問を幾度となくされて、常にNoと答えてい���のですが、ついに実現しました！
https://t.co/joMB5odihK

[ShorterLab @ShorterLab]

Brain-wide mapping of oligodendrocyte organization, oligodendrogenesis, and myelin injury: Cell https://t.co/huXjrDup1m

[Tatz Murakami @TatzMurakami]

Our whole-brain multiplexed FISH paper is out! So grateful to everyone who made this project possible. https://t.co/ZOTMrnSVQb

[Neuron @NeuroCellPress]

Online now: Artificial intelligence-driven whole-brain cell mapping with highly multiplexed in situ hybridization https://t.co/gmc5jw4jPb

[Murayama lab, RIKEN CBS @mlab_cbs]

新作論文：意識・無意識脳での神経ネットワーク構造の可視化に成功-睡眠中に感覚応答を知覚できない脳の謎にヒント-ハブ細胞の役割とは？大泉ラボ@oizumimとのコラボ。同じデータでマクロからミクロまでネットワーク指標を解析するパイプライン���構築
https://t.co/8mxBzBRTDb
https://t.co/s2rlMjj4Gg

[医学界新聞 @igakukaishinbun]

【医学界新聞プラス・インタビュー】
生命の始まりに挑む ――「オスの卵子」が誕生した理由（林克彦）
https://t.co/sLASJTbUQG

オスのマウスのiPS細胞から卵子を作製し，子を誕生させる――。
2023年，林氏が主導した研究の成果は，生殖の常識を覆すものとして世界を驚かせました。生命誕生の根源的なメカニズムに迫る研究は，不妊治療の発展や絶滅危惧種の保全推進など，医療の枠を超えて限りない可能性を秘めています。世界初の快挙に至った経緯と林氏が見据える未来について，話を聞きました。

[Fei Chen Lab @insitubiology]

Thrilled to share our newest method for transcriptome recording using TimeVault!
https://t.co/pqdSzjhn5J

[加藤忠史 @KatoTadafumi]

双極症の原因脳部位として視床室傍核を同定した論文がNature Communicationsに受理されました！　37年間双極症の原因解明を目指してきましたが、ついに双極症の病態の中心を解明できたと思���ます。世界的に認められれば、診断法・治療法開発の飛躍的進歩につながると思います。https://t.co/U8cauWocXB

[Zhiqiang Sha (@zhiqiangsha.bsky.social) @sha_zhiqiang]

Bridging the dimensional gap from planar spatial transcriptomics to 3D cell atlases | Nature Methods
https://t.co/oW8lUm8DdN

[Ali Max Erturk @erturklab]

Most transcriptomics studies sample ~0.001% of a mouse. Which region to choose? Often we guess.

We introduce DISCO-seq🤗flipping the order:
Whole-body 3D imaging with RNA-preserving clearing→ pick ROIs in 3D→ unbiased scRNAseq
Led by @HarsharanBhatia
https://t.co/kYkzAWC5K9

[bioRxiv Synthetic Biology @bioRxiv_synbio]

PURE makes PURE: reconstitution of the PURE cell-free system from self-synthesized non-ribosomal proteins https://t.co/6lnXiRKumc #biorxiv_synbio

[bioRxiv SysBio @biorxiv_sysbio]

DISCO-seq: 3D single-cell transcriptomics of intact biological systems https://t.co/Ac6FyALh1D #biorxiv_sysbio

[Hiroki R. Ueda @hiroking1975]

全脳の神経活動の時刻表を作成した論文がサイエンスに。約80%の脳領域(508領域) が有意に概日リズムを示すことを発見。CUBIC論文時(2014年)に着想し10年以上かかりようやく実現。山下さん・木下さんおめでとう! 大学院生を募集中。Ms→https://t.co/VBzWFjBMPr　DB→https://t.co/01evod4ChG

[Hiroki R. Ueda @hiroking1975]

#PR Our Ms on brain atlas of circadian activity is out in Science! ~80%(508 regions) of whole brain show significant oscillations. We envisioned it at first CUBIC papers in 2014. It took a decade. Congrats, Katsu&Fukuaki! Ms→https://t.co/VZNUIEsHbm
DB→https://t.co/01evod4ChG

[東京大学 | UTokyo @UTokyo_News]

[プレスリリース] 脳全体の活動リズムを3次元で可視化――マウス脳のさまざまな領域の朝・昼・夜の活動パターンを明らかに―――医学系研究科・医学部
https://t.co/T4CuScMCGd

[Ohue M/大上雅史 @tonets]

RFantibody論文出てるねぇ
Atomically accurate de novo design of antibodies with RFdiffusion | Nature
https://t.co/NBmQ6WvhrB

[Giovanni D'Angelo @Gio_Dangel0]

The Lipid Brain Atlas is out now! If you think lipids are boring and membranes are all
the same, prepare to be surprised. Led by Luca Fusar Bassini with Gioele La Manno's lab, we mapped membrane lipids in the mouse brain at high resolution.
https://t.co/q3AeqGsIS1