BIOscience Research Group

All about Omics Science

[Waggoner Lab @LabWaggoner]

Review @Nature_NPJ @Andres_Lopez_C 🇪🇨
Circadian engineering of in vivo CAR T cell therapy for precision oncology
https://t.co/WGJcyZnHKC

[Andrés López-Cortés @Andres_Lopez_C]

Rethinking Colorectal Cancer Through the Gut Microbiome https://t.co/wziwOYh0rw

[Jhommara Bautista @JhommyBautista]

🇪🇨🇪🇸En nuestra reciente publicación, mostramos que comprender el cáncer colorrectal requiere ir más allá del genoma humano e integrar el microbioma como regulador activo

🧬: https://t.co/UNOcJsOQ6X

[William A. Wallace, Ph.D. @WilliamWallace]

How the gut microbiome synchronizes with the brain’s circadian clock

This figure shows how the gut and brain communicate through neural, immune, endocrine, and metabolic pathways that are influenced by the body’s internal clock. The microbiome, hormones, and light–dark cycles interact to coordinate sleep, metabolism, stress responses, and inflammation across the gut–brain axis.

1️⃣ Central and peripheral clocks
The brain’s master clock in the suprachiasmatic nucleus (SCN) aligns daily rhythms with environmental light through the retinohypothalamic tract. Peripheral clocks, including those in the gut, follow signals from the SCN but also respond to feeding times and microbial metabolites.
🟢 Example: Disrupted light exposure or irregular eating can desynchronize the gut’s circadian rhythm, altering microbial composition and metabolic regulation.

2️⃣ Endocrine pathway
The hypothalamic–pituitary–adrenal (HPA) axis links stress and circadian timing through hormone signaling. Gut microbes influence HPA activation by releasing metabolites and cytokines that affect cortisol release.
🟢 Example: Certain bacteria such as Actinobacteria and Streptococcus modulate HPA activity, contributing to changes in inflammation and stress hormone output.

3️⃣ Immune pathway
Microbial components interact with immune cells in the intestinal mucosa, producing cytokines that reach the brain through circulation or vagal signaling.
🟢 Example: Lipopolysaccharides (LPS) and pattern-associated molecules from gut bacteria trigger IL-1β and TNF-α release, linking dysbiosis to neuroinflammation and altered sleep quality.

4️⃣ Metabolic pathway
Microbes regulate lipid and glucose metabolism through production of short-chain fatty acids and other metabolites that follow circadian patterns.
🟢 Example: Species like Lactococcus chungangensis and Ruminococcus bromii affect lipid metabolism, aligning energy use with the body’s day–night cycle.

5️⃣ Neural pathway
The vagus nerve transmits microbial and immune signals bidirectionally between gut and brain. Neurotransmitters and microbial by-products influence mood, stress, and cognition through this circuit.
🟢 Example: Cytokines and bacterial metabolites act on vagal afferents, shaping neural activity in regions that regulate alertness and emotional balance.

Together, these pathways demonstrate how the microbiome acts as a peripheral clock that integrates environmental cues, diet, and stress signals with the brain’s circadian system. When alignment breaks down, it contributes to insomnia, metabolic dysfunction, and inflammation across multiple organ systems.

https://t.co/HtR3nA6AZ3

[Frontiers - Microbiology @FrontMicrobiol]

New Research: Microbial beginnings: determinants and disruptions of the neonatal microbiome https://t.co/Tbn52TVn0a #FrontiersIn #Microbiology

[Andrés López-Cortés @Andres_Lopez_C]

🧬 Neurodegeneration rewires the tumor microenvironment via the neuro–immune–cancer axis. @UDLAEcuador @UDLA_Investiga @JhommyBautista @saloaraujo11

iScience https://t.co/hygiIEcFTA

[Esteban Ortiz @EstebanOrtizMD]

¿Algunos virus pueden despertar el cáncer? 🦠
Sí. En nuestro último trabajo, donde colaboramos con @paulcarald y @Andres_Lopez_C, publicamos en Frontiers in Cellular and Infection Microbiology un análisis completo sobre el virus linfotrópico de células T humanas tipo 1 (HTLV-1), un retrovirus altamente oncogénico.

El HTLV-1 está asociado a la leucemia/linfoma de células T del adulto (ATLL) y a la mielopatía asociada a HTLV-1 (HAM/TSP). Infecta entre 5 y 10 millones de personas en el mundo 🌍, con focos en África, Japón, Caribe, Sudamérica y Oceanía. Se transmite por vía materno-infantil, sexual y sanguínea, y su capacidad de transformar células se debe a proteínas como Tax y HBZ, que favorecen proliferación, evasión inmune y daño genético.

El artículo revisa en detalle:
•🔬 Mecanismos oncogénicos: integración en el ADN, reprogramación epigenética, expansión clonal.
•💉 Avances en vacunas: vectores virales, ADN, péptidos, ARNm y células dendríticas.
•💊 Nuevas terapias: anticuerpos monoclonales, inhibidores epigenéticos y compuestos naturales.

Conclusión: El HTLV-1 sigue siendo una infección olvidada que requiere atención global. Comprender sus mecanismos es clave para desarrollar una vacuna y terapias efectivas.

📄 Referencia:
Vasconez-Gonzalez J, Suárez-Sangucho IA, Acosta-Muñoz E, Paz y Miño L, Borja-Mendoza D, et al. Human T-cell leukemia virus type 1: oncogenic potential and vaccine development strategies. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2025; doi:10.3389/fcimb.2025.1587802

[Esteban Ortiz @EstebanOrtizMD]

🚨📢 ¡Nueva publicación científica!
Hoy se ha publicado nuestro artículo “Current and emerging Mpox vaccine strategies: A comprehensive review” en la prestigiosa revista Vaccine 🧪 (Q1, h-index: 222, Impact Factor: 3.5).
🦠 La Mpox (antes viruela del mono) es una enfermedad reemergente que en 2022 y 2023 afectó a más de 111 países 🌍, con brotes que dejaron más de 1.000 muertes y un impacto desproporcionado en África.
Este trabajo es fruto de un equipo multidisciplinario de la @UDLAEcuador y colaboradores internacionales, con la participación de:
👨‍🔬 @Andres_Lopez_C (¡gráficos profesionales impresionantes!)
👨‍🔬 @IzquierdoCondoy
👨‍🔬 @JorgeVsconez1
…y un grupo de investigadores apasionados por la salud pública.

📚 ¿Qué hicimos?
✅ Revisamos más de 125 referencias científicas
✅ Analizamos vacunas aprobadas (MVA-BN/Jynneos, ACAM2000, LC16m8) 🧬
✅ Describimos plataformas emergentes: mRNA, multivalentes, virus atenuados, VLPs y más
✅ Evaluamos ventajas, limitaciones y escenarios de uso 📊
✅ Proponemos estrategias para acceso equitativo a vacunas en regiones endémicas y de bajos recursos 🌍⚖️
💡 Dato clave: Las vacunas actuales pueden alcanzar hasta 86% de efectividad 💉, pero aún existen brechas en seguridad, escalabilidad y distribución equitativa.
Las plataformas mRNA prometen una respuesta más rápida y adaptable frente a nuevas variantes 🔬.
📖 Este artículo es de acceso abierto, porque la ciencia debe ser libre y accesible para todos 🌎🤝.
🔗 https://t.co/p9BvLekFr6
🙏 Gracias a todo el equipo por su trabajo incansable y a la revista Vaccine por confiar en nuestra investigación.
#Mpox #Vacunas #VaccineJournal #OneHealth #CienciaLatam #SaludPública #Investigación #OpenAccess

[Jhommara Bautista @JhommyBautista]

🧠🦠 Les compartimos nuestra nueva publicación: HSV-1 podría contribuir a la neurodegeneración a través del eje intestino-cerebro. La microbiota y sus metabolitos emergen como un nuevo enfoque integrador hacia la neuroinmunología de precisión.

https://t.co/ejFl7L5bdS

[Andrés López-Cortés @Andres_Lopez_C]

🦠💊 Contentos de compartirles nuestra más reciente publicación sobre virus oncolíticos y como modulan el microambiente tumoral. Muchas gracias @UDLA_Investiga @UDLAEcuador

Felicitaciones autores 👏👏

https://t.co/kshb77YhQO

[Andrés López-Cortés @Andres_Lopez_C]

🧬 UDLA Symposia: Cancer Edition

https://t.co/rClRto81LY

[Carolina Echeverría Andrade @caro_ea18]

🍯Happy to share our New preprint: Metabolic Adaptations of Prostate Cancer Cells Under Chronic Fructose Stimulation

https://t.co/fnm05jesnu

[Jhommara Bautista @JhommyBautista]

Les compartimos nuestra más reciente publicación sobre cómo los virus oncogénicos reconfiguran el epigenoma en el cáncer humano 🧬🦠

Gracias a @Andres_Lopez_C por la guía y apoyo de siempre. Vamos por mucho más siendo equipo! 🇪🇨🇪🇸

https://t.co/GNuwXj1d6n

[Jhommara Bautista @JhommyBautista]

Les compartimos nuestra más reciente publicación sobre relojes periféricos e interacciones con zeitgebers sistémicos del ritmo circadiano en medicina de precisión 🧬☀️🌙

Gracias a @Andres_Lopez_C por toda la
guía y a los autores por hacerlo posible!
https://t.co/tOaQduFuqt

[Andrés López-Cortés @Andres_Lopez_C]

🇨🇴🇪🇨 Integrating next-generation sequencing and artificial intelligence for the identification and validation of pathogenic variants in colorectal cancer

https://t.co/Ab9cP8Hzwh

[Esteban Ortiz @EstebanOrtizMD]

¿Sabías que en Sudamérica existen enfermedades similares al Ébola con un potencial epidémico ?

Si no lo sabías, ahora lo sabes. Y nuestro último trabajo acaba de ser publicado para profundizar en este tema.

En este trabajo regional liderado por nuestro grupo de la @UDLAEcuador y colegas de Colombia de @Uniquindio de Argentina de @UBAonline y de GYE @uees_ec exploramos las fiebres hemorrágicas causadas por los Mammarenavirus sudamericanos, un grupo de virus zoonóticos con una letalidad alarmante que han sido identificados en Argentina, Bolivia, Brasil y Venezuela.

Estas enfermedades pueden transmitirse de animales a humanos, y en algunos casos, de persona a persona, generando brotes potencialmente catastróficos.

🔬 En el artículo discutimos:

✔️ Epidemiología y transmisión de virus como el Junín, Machupo, Guanarito, Sabia y Chapare.

✔️ Factores ambientales que facilitan la emergencia de estas enfermedades.

✔️ Potencial de vacunas y tratamientos, incluyendo terapias con anticuerpos monoclonales.

✔️ El impacto del cambio climático y la deforestación en la propagación de estos virus.

🦠 A pesar de que estas fiebres hemorrágicas han estado limitadas a ciertas regiones, las alteraciones ambientales y la expansión humana podrían favorecer su aparición en nuevas áreas.

📄 Si te interesa la epidemiología de enfermedades emergentes y el riesgo de futuras pandemias, no puedes perderte este estudio.

🔗 Lee el artículo completo aquí: https://t.co/0x9ZH67sDO

Como siempre un reconocimiento a mis colegas @JorgeVsconez1 @IzquierdoCondoy D.A. Becerra-Cardona , María José Farfán-Bajaña , Susana García-Cañarte y como no mencionar a @Andres_Lopez_C por su contribución con el diseño gráfico

#Ciencia #Epidemiología #FiebresHemorrágicas #OneHealth #Virus #SaludPública #Investigación

[Andrés López-Cortés @Andres_Lopez_C]

🧬 Felices de compartirles nuestra más reciente publicación sobre las proteínas alteradas en el Alargamiento Alternativo de Telómeros (ALT) en 32 tipos de cáncer, su asociación con el metaboloma y sus estrategias terapéuticas, publicado en PLoS ONE.

🔴 https://t.co/r3eiefj097

[Andrés López-Cortés @Andres_Lopez_C]

#WorldCancerDay #UnitedByUnique

https://t.co/KfQWMnKmCb

[Sebastián Rivera @sebastian30573]

Estamos orgullosos de presentar nuestro preprint titulado NeoPhAR: Next-generation Phage Therapy for Antimicrobial Resistance en @biorxivpreprint , donde exploramos el potencial de la terapia con fagos como una herramienta crucial para combatir la resistencia antimicrobiana. 💊🦠

[Sebastián Rivera @sebastian30573]

Les compartimos nuestro más reciente estudio publicado en @biorxivpreprint sobre el diseño de vacunas contra Mpox mediante enfoques de inmunoinformática y predicción computacional de epítopos. Esperamos tener la versión final publicada muy pronto!.

🦠https://t.co/WWmRTuDEdg