花田耕介 kousuke hanada

学部（日本大学・獣医学科）、博士課程・遺伝研(遺伝学)、シカゴ大、ミシガン州立大学、理化学研究所を経て 九州工業大学(九工大) で植物を利用して、新しい遺伝子が生まれる進化メカニズムを研究しています。 生命化学情報工学研究科に所属してます。
#九工大　#植物　#ゲノム　#進化　#ペプチド　#denovo_gene

[花田耕介 kousuke hanada @Hanada_Kyutech]

九州工業大学・花田研究室では、シロイヌナズナ形質転換体作製サービスを開始しました。1バイナリーベクターあたり8万円で、独立したT1形質転換体由来の10系統以上のT2種子を成果物としてお返しします。詳細はこちらをご覧ください。https://t.co/tt7cxZOLjy
ご質問などございましたら、お気軽にご連絡ください。共同研究・受託研究のご相談も歓迎いたします。

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マレーシア・マラヤ大学との共同研究で、小さな遺伝子候補であるsORFをバナナで見出した論文が発表されました。
https://t.co/bmxgb120m6

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本日、九工大の大学院入試、皆さん頑張れー。

[花田耕介 kousuke hanada @Hanada_Kyutech]

私は、高校時代、勉強せずにラグビーばかりしていました。高校の成績は非常に悪く、浪人中も、燃え尽き症候群で、まじめに勉強できずに、大学にいきました。大目に見ても６割ぐらいのパワーで大学に行き、自分のダメさ加減を感じながら大学を卒業しました。その後、博士課程以降は、がむしゃらにやっており、現在では、それなりの成果はあります。私の燃え尽き症候群が、研究生活で「さぼった」という「心の傷」になったのは確かです。最近、燃え尽き症候群は、大小あれど、ほとんどの人も経験している気がします。20歳、30歳、40歳、50歳ぐらいに来る人もいると感じます。私は、10代の終わりなのでよかったですが、年齢行ってからなると、取り返しがつかないことになる時もありそうです。私の子供は、スポーツをやり、それに燃えていますが、俺のように燃え尽き症候群になったらまずいなと思います。今までは、頑張るという閾値を上げるために、スポーツを必死にやってみろーーと言い続けていました。ただ、それが正しいことなど、わからないよなとも思っています。そもそも燃えつかないで、ほどほどにやっていると、継続的に頑張れるのかもしれません。最近、ほどほどにやると決めて黙々とやるのもありなのかなとおもってきました。タイプによるのかな。

[花田耕介 kousuke hanada @Hanada_Kyutech]

「サッカー統計プロバイダー『オプタ（Opta）』によるスーパーコンピューター分析を引用し、ブラジルがベスト16に進出する確率を69・1％、日本については30・9％と予測した。」30%の確率で勝てるのは、すごいこと。そんなに期待していいのか

[花田耕介 kousuke hanada @Hanada_Kyutech]

@HiromasaShikata これはおそらく周りのアミノ酸は一緒で一つにアミノ酸だけが異なっているのだと思います　つまり　読み枠外れていないと言う中でのコドンとミスマッチなアミノ酸があるのだと思いますよ

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これは、エラーと考えていいのか？

[Prof. Nikolai Slavov @slavov_n]

Since the 1960s, the genetic code has been used to predict protein sequences from DNA and mRNA sequences.  Our @Nature article demonstrates that these predictions miss thousands of protein sequences present in human tissues.

Across >1,000 human samples, we identified numerous abundant proteins whose amino acid sequences differ from those predicted by the genetic code.

These proteins are not rare translation byproducts. They accumulate to thousands of copies per cell. Some are more abundant than the proteins predicted by the genetic code from the same transcripts.

Their abundance reflects a combination of alternate RNA decoding mechanisms — including codon-anticodon mismatches, tRNA abundance, and RNA modifications — and selective stabilization of the resulting proteins. The last factor – protein stability – emerges as a major determinant of protein abundance across proteins, proteoforms and cell types: https://t.co/IzOfAZKnxT

Alternate RNA decoding is pervasive across functional groups of proteins, healthy and diseased tissues. It affects proteins playing key roles in neurodegeneration, and some alternately decoded proteins show strong enrichment in tumors compared to their surrounding tissues.

This discovery has been a long and exhilarating journey with Shira Tsour and the @slavovLab team. It started in 2019 and proceeded through many challenges and thrilling highs. A journey that has opened new perspectives that we long to explore!

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[花田耕介 kousuke hanada @Hanada_Kyutech]

進化学会に久しぶりに行こうと思います。シロイヌナズナで機能的なde-novo遺伝子の同定した結果をまとめているのでいいタイミングです。

[花田耕介 kousuke hanada @Hanada_Kyutech]

本日、Long Journalで Nucleic Acid Researchの論文を学生が紹介した。Impact Factorが15であることにびっくりした。Genome ResearchやGenome Biologyが10前後であるのに、比べて非常に高い。Mol Bio Evoも15ぐらいある。Genome論文はよりも各論が重要になってきているのかな。

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福岡にきてわかったこと！、牛乳は断トツで「みどり牛乳」がおいしいです！

[Let's KYUTECH 留学！ @GCE_Kyutech]

📣台湾派遣プログラム募集🇹🇼

台湾国立大学でビッグデータ×生命科学🔬
現地学生と1対1ペアで実習🤝

🗓8/30〜9/5（※8/27オンライン）
🎓工・情工・生命体（B2〜M2）
👥10名
⏰6/27締切

挑戦したい方大歓迎🔥
詳細👇
https://t.co/EhqIyKLPe3

[花田耕介 kousuke hanada @Hanada_Kyutech]

九工大の皆様！ 国立台湾大学への短期留学（分子のビックデータ解析）に興味がある方は、花田　耕介に連絡ください
申し込み締切日： 6月27日
渡航先： 国立台湾大学
渡航期間： 8月30日～9月5日
対象学部： 工学部・情報工学部・生命体
対象学年： B2・B3・B4・M1
人数： 10人
旅費支援： 一部あり

[花田耕介 kousuke hanada @Hanada_Kyutech]

Nature Index 2026 Research Leadersを見ると、学術機関ランキングのトップ10のうち9校が中国の大学で、トップ30でも中国の大学が大半を占めている。研究力の重心が大きく中国へ移っていることを、数字として強く感じる。米国の研究力は、世界中から集まる移民・留学生・研究者の力によって支えられてきた面が大きい。一方で、中国の研究力は、国外から人材を集めるというより、中国国内の巨大な研究予算と圧倒的なマンパワーによって押し上げられているように見える。中国発の論文を読んでいると、時に「力業の研究力」であり、必ずしも技術的な飛躍ばかりではないと感じることもある。しかし同時に、地道で美しい研究も確実に増えている。量だけでなく、質の面でも無視できない段階に入っていると思う。さらに気になるのは、中国の研究力が英語圏の国際循環だけでなく、中国語圏の中でも強く推進されている可能性である。以前は「研究の中心言語は英語であり続ける」と思っていたが、中国は別の研究圏を作れてしまうのではないか、という気もしてきた。私の周りの日本人で中国に研究留学したいという人は多くない。しかし東南アジアの研究者の中には、中国語を話せる場合、中国を有力な研究先として選び始めている人もいる。今後、研究をするうえで英語だけでなく中国語を学ぶ必要が出てくる時代も来るのだろうか。大きな転換期にきているのかもしれない。
https://t.co/7igySw5ItK

[花田耕介 kousuke hanada @Hanada_Kyutech]

株)エヌ・ティー・エスから、『合成生物学ハンドブック』が出版されました。私たちのグループは、植物の合成生物学という１つのチャプターを担当しました。高額ですが、興味のあるかたは連絡ください。15%のクーポンコードをお伝えします。https://t.co/Tu5UuLWMAm

[花田耕介 kousuke hanada @Hanada_Kyutech]

海外の学生を受け入れることができるJASSO、9月に受け入れるタイ・カセサート大の共同研究グループを受け入れるさくらサイエンスにも採択されました。9月の初めは、台湾でトランクリプトーム解析の実習もやらないといけません。科研費の申請も9月です。忙しそうです。。

[花田耕介 kousuke hanada @Hanada_Kyutech]

海外に興味を持ったないと、多様性も理解できないですよね。海外に興味を持つ学生が少ないと感じています。
https://t.co/YFwFrfg7JH

[花田耕介 kousuke hanada @Hanada_Kyutech]

GWが終わりました。今回のGWはかなり休んでしまった。明日は、生命化学情報工学科に入った二年生に生命化学情報工学入門として、1コマの講義をします。丁寧にはなすことを心がけます。

[花田耕介 kousuke hanada @Hanada_Kyutech]

Frontiers in Plant Scienceに、論文が、Publishしました。
https://t.co/29DCnu8pTR
共生菌を向上させるような植物ペプチドを探索する研究をしたかったので、晝間さん（東大）から、共生菌をいただいて、共生菌効果を簡単に見れる系の構築を試みました。共生菌効果は、環境条件を変えるとえらく変わります。もちろん、人工気象機でやっても、実験日によって条件はかなり変わります。実験をする人、植物の状態、菌の状態でえらい変わります。これは、大変だと思って、共生菌効果をみるために、SAがない植物でやったら共生菌効果をみやすくなるんじゃない？　とおもって試しにやったのですが、どのような条件でも、共生菌効果がなくなりました。共生菌の効果をみるのは簡単じゃないということをよく理解しました。その結果をとりあえず、Publishしたという内容です。もう、共生効果に関わるペプチドをみるのはあきらめようと思っています。いつも思いますが、成長を良くするものをみるという実験は簡単じゃないです。