Lucía Patrón

Engineer in Biotechnology - ORT University
Uruguay
24 years old

[Lucía Patrón @LuciaPatron6]

Hola @LatinXChem, con mucho gusto presento mi trabajo titulado “Variante de una citosina desaminasa para la conversión de 5-Fluorocitosina” #LatinXChem23 #LatinXChemBio #Bio060
@UniversidadORT #proteintechnologygroup #BiotecORT

[Lucía Patrón @LuciaPatron6]

@Claudia_Berna @LatinXChem @UniversidadORT Muchas gracias por tu pregunta! Mutaciones de AA del sitio activo han sido reportadas de variar la actividad catalítica. Sin embargo, yo propongo mutar los superficiales, que se encuentran en la entrada del pocket. En las MD que hemos hecho, se observa su función de portero.

[Lucía Patrón @LuciaPatron6]

Hola @LatinXChem, con mucho gusto presento mi trabajo titulado “Variante de una citosina desaminasa para la conversión de 5-Fluorocitosina” #LatinXChem23 #LatinXChemBio #Bio060
@UniversidadORT #proteintechnologygroup #BiotecORT

[Lucía Patrón @LuciaPatron6]

@bruno_sacchetto @LatinXChem @UniversidadORT Hi, thank you so much for your question. In the lab we are now trying some mutants with double mutations, that are reported to be more active. However, the ones that I presented in this poster, I would like to mutate them one at a time, and then try new MDs individually.

[Lucía Patrón @LuciaPatron6]

@FerCofas @LatinXChem @UniversidadORT Muchas gracias por la información!Especialmente porque la proteína es un hexámero bastante grande, las simulaciones que he generado han sido de una subunidad para lograr hacer la simulación de menos coste computacional. Con mi equipo de trabajo estamos evaluando Martini y Sirah

[Lucía Patrón @LuciaPatron6]

@FerCofas @LatinXChem @UniversidadORT Si, es una muy buena idea. Incluso he generado modelos de homología de otros organismos que no tengo estructura cristalográfica, para evaluar el grado de conservación de residuos. La idea final sería de todo eso volver a largar simulaciones y evaluar los modelos.

[Lucía Patrón @LuciaPatron6]

@FerCofas @LatinXChem @UniversidadORT Para complementar la decisión de generar mutantes, podría utilizar predictores web de estabilidad proteica luego de generadas las mutaciones por ejemplo. Así como también generar la mutación en la proteína y evaluar si afecta los parches proteicos.

[Lucía Patrón @LuciaPatron6]

@FerCofas @LatinXChem @UniversidadORT Por otro lado, una mutación de los residuos Phe186 o Ile 85 (residuos que en la simulación funcionan de porteros para la entrada del sustrato) por residuos más pequeños, permitirían facilitar la entrada del sustrato al sitio activo.

[Lucía Patrón @LuciaPatron6]

@FerCofas @LatinXChem @UniversidadORT Principalmente esperaría que afectaran la actividad catalítica. La mutación de una serina 126 por una arginina, por ejemplo, la estoy evaluando en mesada y ha demostrado mayor afinidad por el sustrato 5-FC que por su sustrato natural citosina, lo cual es prometedor. Continuo

[Lucía Patrón @LuciaPatron6]

@FerCofas @LatinXChem @UniversidadORT Si claro! Realicé una simulación de 20 ns, utilizando NAMD, empleando un ensamble NPT, donde la presión la mantuve a 1 bar, la temperatura a 37ºC y cantidad de partículas constantes. Además la simulación se realizó en condiciones periódicas.

[Nature Portfolio @NaturePortfolio]

In a Nature Portfolio Cancer Community post, Elizabeth Mann, Scientific Reports senior editor, shares the 100 most downloaded cancer papers published in @SciReports during 2021. https://t.co/HJFB1kH8jc

[Slava Bobrov @slava__bobrov]

Neurons in the hippocampus are shown using the brainbow technique:

#neuroscience by G. Dunn

[Arbor Day Foundation @arborday]

“The greatest threat to our planet is the belief that someone else will save it.” – Robert Swan

[David Kwan @DavidKwanPhD]

Good bye, Uruguay! Had a fantastic time. Thank you @betancor_lorena for hosting my visit to your lab @UniversidadORT! It was such a pleasure working with talented students Lucía Patrón and @MathiasCosta4!

Thank you for a wonderful time in Montevideo. Hasta luego!

[Lucía Patrón @LuciaPatron6]

@DavidKwanPhD @betancor_lorena @UniversidadORT @MathiasCosta4 Thank you so much for the opportunity to work together and learn from you. I hope we meet again! :)