PillotP

Scientific front-end dev @ Chemical Computing Group
Ex. prof de SVT

[PillotP @PillotP]

#libmol Nouveau dans Libmol : Visualisation des contacts. Exemple avec un dimère d'HBS : déterminer les interactions réalisées par la Val6 de la globine beta mutée. #nglviewer

[PillotP @PillotP]

@sarah_edo Try/catch with a loose handling of exceptions might better describe my process

[PillotP @PillotP]

@RolandDunbrack Connectivity in mmCif files: chem_comp_bond records are absent from mmCif files which forces to download extra dict data to fix inferred connectivity. PDBe « updated » files have them, but it probably should be standard

[PillotP @PillotP]

A la demande d'enseignants de SPC, j'ai hébergé la ressource ScribMol sur une nouvelle adresse: https://t.co/5X6OTKWd9w

[PillotP @PillotP]

@PhCosentino Peut être qu’il y a une précaution à prendre vu que Calor est une marque déposée?

[PillotP @PillotP]

@SD_Viz Thanks for highlighting this feat!
I've noticed that the structure file contains H atoms despite having a resolution of 4.2Å. Also, the EDMap looks coarse when viewed in Mol*. I wonder how confident we can be about the hydrogens positions?

[Brady Johnston @bradyajohnston]

@wojciechkopec3 I'm struggling with how to handle atoms that are on the edges of the simulation box. Currently I'm interpolating between positions, but when atoms move out of the box and come in from the other side, it looks janky to interpolate between.

[Guillaume Bourque @guilbourque]

The amazing @C3Genomics team! I'm lucky to be working and learning with such a great group of people every day. @McGillGenome @mcgillu

[PillotP @PillotP]

@MyrtilleGardet Elle est décapante!

[PillotP @PillotP]

@FoxarFR C’est très intéressant de voir ainsi toutes les itérations du modèle 🤓

[PillotP @PillotP]

@vmarquetvienne @TICE_SVT Quand j’étais en Australie, ils suivaient les élèves d’une année à la suivante pendant leur scolarité dans l’établissement (de la sixième à la seconde).
Mais le système est différent: les profs font la vie scolaire (surveillance, etc…), des camps, …

[PillotP @PillotP]

@PhCosentino La couleur peut être améliorée. Je t’en reparlerai.

[PillotP @PillotP]

@PhCosentino Mais bon… en classe clear pas top… trop de notions

[PillotP @PillotP]

@PhCosentino En fonction des fréquences des acides aminés dominants. Les résidus sont colorés au niveau de leur arrière plan seulement si le seuil de «  majorité » est dépassé: par exemple thr et Ser should représentent tous deux plus de 50% de la colonne. Ça évite flavor des couleurs partout

[PillotP @PillotP]

@PhCosentino Mon point c’est que ça introduit un concept supplémentaire, donc un obstacle supplémentaire à la compréhension ( en plus de la distinction tiret haut/ tiret bas

[PillotP @PillotP]

@MyrtilleGardet @VPantaloni @iaipr_pb #clyschmart !

[PillotP @PillotP]

@PhCosentino @C3Genomics Moi aussi! Une opportunité pour mettre au point des services afin de faciliter la diffusion et l’utilisation de données de séquençage (groupes de recherches en oncologie, COVID, etc…)

[PillotP @PillotP]

Premier jour dans mon nouveau poste au @C3Genomics et de belles perspectives professionnelles et personnelles!

[Martina Maritan @MartinaMaritan]

Preprint out on @JMolBiol: We build the first 3D model of an entire bacterial cell with molecular details starting from system biology simulation. 👉https://t.co/Zik3yt88WH

So proud of this work and forever thankful to @dsgoodsell @grinche Art Olson for this amazing project!