Takeshi Obayashi

A developer of ATTED-II (@ATTED) and COXPRESdb (@COXPRESdb). Professor at Graduate School of Information Sciences / WPI-AIMEC in Tohoku University.

[石巻専修大学 ベントス研 @Benthos_ISU]

2025年ベンプラ合同大会の懇親会でご演奏いただいた「スミス＆マッキンタイヤ」さんからYouTube動画を共有いただきました！
M1．わかんない
M2．ベントス学会30周年記念本のテーマ
M3．海で研究をはじめた
M4．うちの父さん（母さん）仕事は研究
アンコール　もてるためなら
https://t.co/DhY3i5idj9

[WPI-AIMEC (変動海洋エコシステム高等研究所) @wpi_aimec]

👥Recruitment

We are looking for 10 positions to join us as AIMEC Postdoctoral Researchers, contributing to the understanding and prediction of marine ecosystem change!  

📅Applications must arrive by December 21, 2025, at 23:59 in Japan time
https://t.co/qS0GbOPoUl

[WPI-AIMEC (変動海洋エコシステム高等研究所) @wpi_aimec]

👥採用情報

ポストドクトラル研究員として、海洋生態系の変化の理解・予測に向けて一緒に働いてくださる方を募集しています！
📅応募締切：2025年12月21日（日）23時59分(JST)必着
https://t.co/XuCkAc0OjT
#WPI_AIMEC #JAMSTEC #TohokuUniversity

[Takeshi Obayashi @dancing_infobio]

うちからも ATTED-II と PlanDyO について、ポスター発表とライトニングトークを行います。

[NBDC @NBDC_info]

▼▼ポスターセッションのご紹介✨▼▼
全50件の演題を公開！
https://t.co/ksyvNdh20G
※ポスターセッションは午前中に開催で、ライトニングトークのみライブ配信予定です。
#togo2025

[Takeshi Obayashi @dancing_infobio]

聴衆に語りかける熱いプレゼンが高く評価され、JaronchaiさんがBest Oral Presentation Awardを受賞しました。おめでとうございます👏

[lab_infobio @lab_infobio]

🎉受賞のお知らせ
M1年のDilokkalayakul Jaronchaiさんが、IMBC2025にてBest Oral Presentation Awardを受賞しました！
発表テーマ：
"Automated Taxonomic Identification of Marine Plankton Using a Large-Language-Model and Retrieval-Augmented-Generation Framework"
🔗https://t.co/loURS26MV9

[JSBi @npoJSBi]

【文科省・JST後援】2025年度バイオインフォマティクス技術者認定試験

第二回試験申込
2025年8月1日（金）〜10月8日（水）

第二回試験日程
CBT試験　2025年11月8日（土）〜12月7日（日）

沖縄準会場　2025年11月28日（金）（沖縄高専関係者のみ）/11月29日（土）・11月30日（日）

[lab_infobio @lab_infobio]

【登壇のお知らせ】
大林武教授が「タフ・サイバーフィジカルAI研究センター シンポジウム2025」で講演します。
🧬講演：
「地球環境変化に応答する沿岸生態系の理解に向けた長期メタゲノム解析」

🔗詳細： https://t.co/msFfzI6ehw
#東北大学 #PlanDyO #メタゲノム #沿岸生態系

[WPI-AIMEC (変動海洋エコシステム高等研究所) @wpi_aimec]

👥採用情報

研究員もしくはポストドクトラル研究員として、海洋生態系の変化の理解・予測に向けて一緒に働いてくださる方を募集しています！

🗓️応募締切：2025年6月15日（日）23時59分必着
https://t.co/XuCkAc0OjT

[lab_infobio @lab_infobio]

📢【お知らせ】
東北大学 統計科学研究センターのウェブサイトが公開されました！
研究紹介やコラムも随時更新予定です。ぜひご覧ください。
🔗 日本語版：https://t.co/7lOavxfPJA
🔗 英語版：https://t.co/N8wx3S2x2U
#東北大学 #統計科学 #データサイエンス

[Takeshi Obayashi @dancing_infobio]

@KanaBU12 大変お疲れさまでした！特に整理の仕方について、様々な議論ができて大変勉強になりました。査読者にも感謝です！

[Kanako Bessho-Uehara @KanaBU12]

多種のゲノム・トランスクリプトーム情報が利用可能な現代においては種間比較を行い進化解析から候補遺伝子を絞り込むことは当然の流れのように感じますが、まだまだウェットな研究者にはハードルが高い部分もあります。そのため、ツールの中でも比較的直感的で使いやすいものを紹介しました。（3/n）

[Kanako Bessho-Uehara @KanaBU12]

今回のLetterでは前から取り組みたかった、RNA-seqで大量に出てきた候補遺伝子の中からどうやって実験に持ち込むための絞り込みをするのか、また候補リストの中に存在する機能未知遺伝子の中でよりpromissingなものを絞り込むのか、という手法について書きました。(2/n)

[Kanako Bessho-Uehara @KanaBU12]

Our letter is now open in PCP.
We discussed several strategies to narrow down the candidate genes related to targeted trait by using evolutionary approach. Hope you will enjoy reading.

https://t.co/v4ygPKJbTF

[Takeshi Obayashi @dancing_infobio]

非モデル生物のゲノム解析が進む中、進化的解析手法の重要性が高まっています。本Letterでは、最新のウェブツールとともに、活用可能な解析アプローチを整理しました。ぜひご覧ください！https://t.co/Szinkz1LcL

[Plant Cell Physiology @PCP_EIC]

🚅Advance Access: Letter💐
Bessho-Uehara @KanaBU12 & Obayashi @dancing_infobio offer a practical guide to integrating #bioinformatics approaches to explore the unidentified genes and gain deeper insights into #PlantAdaptation
and diversity.
#plantsci

[WPI-AIMEC (変動海洋エコシステム高等研究所) @wpi_aimec]

👥Recruitment

We are looking for up to 14 people to join us as AIMEC Researchers or Postdoctoral Researchers, contributing to the understanding and prediction of marine ecosystem change!

📅Applications must arrive by January 26, 2025, 23:59 in Japan time
https://t.co/qS0GbOPWJT

[WPI-AIMEC (変動海洋エコシステム高等研究所) @wpi_aimec]

👥採用情報

研究員もしくはポストドクトラル研究員として、海洋生態系の変化の理解・予測に向けて一緒に働いてくださる方を、計14名まで募集しています！

📅応募締切：2025年1月26日（日）23時59分 （日本時間/JST）必着
https://t.co/XuCkAc0OjT

[Takeshi Obayashi @dancing_infobio]

(English versions)
https://t.co/EzXonb3MeZ
https://t.co/YmXKnrPjrB
https://t.co/L9CuDWgqGN

[Takeshi Obayashi @dancing_infobio]

WPI-AIMECで研究員・ポスドク計14名の大規模公募が始まりました！
変動する海洋生態系を、物理・生物・計算機科学の視点から統合的に解明する最適な研究環境に加えて、国際水準の給与も魅力ですので、ぜひご応募をご検討ください！

全ユニット共通（12名）
https://t.co/dvBAQ0a3L5

[Takeshi Obayashi @dancing_infobio]

海洋環境統合解析ユニット（1名）
https://t.co/FUzuvI3rUG
沿岸生態系サービス研究ユニット（1名）
https://t.co/XEPpfGBiJr

[WPI-AIMEC (変動海洋エコシステム高等研究所) @wpi_aimec]

📝活動報告

The 3rd WPI-AIMEC Colloquiumを女川フィールドセンターで開催しました。WPI-AIMECのメンバーが一堂に会し、各研究や融合研究について意見交換します。

今回はUL 大林 武 @dancing_infobio 教授がプログラムを組み、「AIMEC Grand Challenges」を議論しました。

https://t.co/ns1dNrqIrx