Edwin Cuppen

Edwin Cuppen is scientific director of the Hartwig Medical Foundation a nonprofit organisation that aims to improve cancer care by whole genome sequencing

[Daniela Bezdan @Daniela_Bezdan]

#SBX vs. @Illumina: Genome-Wide Coverage SBX provides higher coverage in high-GC regions, earlier drop-off in low-GC. With MAPQ>20, SBX covers 95.6% (1X) vs. 97.3% (Illumina). In GIAB high-confidence, SBX achieves 99.82% (1X), 99.45% (10X). #AGBT25 #AGBT2025 #AGBT @AGBT @Roche

[Daniela Bezdan @Daniela_Bezdan]

SBX vs. Illumina: SNV & INDEL Concordance In 30 patient samples, SBX shares 97.4% SNVs with Illumina, detects 2,449 unique SNVs (0.9%) vs. 4,470 Illumina-only (1.7%). INDELs are mainly T homopolymers, with SBX enriched in 464 sites vs. 1,088 for Illumina. #AGBT25 #AGBT2025 #AGBT @AG@AGBT @Roche

[Edwin Cuppen @ecuppen]

Less than a week for registration. Check out the program: https://t.co/OVQW6DjEJl. With keynotes by @nlbigas and @CharlesSwanton and exciting sessions on clinical implementation and impact, research insights and future developments around cancer whole genome sequencing
#ccg2025

[Edwin Cuppen @ecuppen]

Start the new year well and register in time for the Clinical Cancer Genomics meeting 2025. Don't miss out on the great line-up of speakers covering the impact of whole genome sequencing in clinical practice, the value for research and a glimpse into future developments.

[Edwin Cuppen @ecuppen]

Hear the latest about their achievements, clinical impact and plans for the future!
The session will be concluded with a forward looking discussion with the speakers: @StefanFrohling , Frédérique Nowak, Matthew Brown, Bettina Lundgren, Richard Rosenquist Brandell, @ecuppen.

[Edwin Cuppen @ecuppen]

Clinical Cancer Genomics 2025: two more weeks till registration deadline! Check out the website for detailed program and speakers.

The meeting includes a session with presentations from all major cancer whole genome sequencing initiatives in Europe.
https://t.co/OVQW6DkcyT

[Edwin Cuppen @ecuppen]

I have left x for bluesky: https://t.co/3WPBPDQ0Bd

[Ultima Genomics @UltimaGenomics]

Our collaboration with @HartwigMedical will utilize the UG 100 sequencer & ppmSeq to offer high accuracy sequencing at reduced costs - expanding whole genome-based cancer diagnostics accessibility and improving treatment outcomes.

Read the full PR here:
https://t.co/8PAgTSlprr

[Hartwig Medical @HartwigMedical]

↗ Ben jij een Software Developer met ervaring met DevOps of infrastructure as code?
↗ Heb je ervaring met refactoring, geautomatiseerd testen en code review?
↗ Wil je impact maken op het leven van patiënten met kanker?
Solliciteer! https://t.co/YZPUrJKeQL

[Hartwig Medical @HartwigMedical]

Data Steward gezocht, die zorgt dat zoveel mogelijk onderzoekers gebruik maken van de Hartwig Medical Database. Doel: hergebruik van data ter bevordering van de behandeling van toekomstige patiënten met kanker. Solliciteer nu: https://t.co/b7rPhPTGo9

[Mijke Jetten🌱 @JettenMijke]

In discussion w Marc Smits @privacyfirst @ecuppen @HartwigMedical Irith Kist @NKI_nl on encrypted BSN as linking key #healthri2023 @Health__RI. ‘Connecting the Dots via joint Health-RI effort is an opportunity to solve the obstacles for this topic & bridge different interest’

[Roel Verhaak @roelverhaak]

Given that there are more treated than untreated cancer patients, papers such as this one deserve more attention (and citations). Re-posting mutational footprints of cancer therapies. https://t.co/cF15gcg6Qx

[Hartwig Medical @HartwigMedical]

“Als je deelname aan een studie goed organiseert, dan is de complete DNA-test bijna standaard patiëntenzorg”: Laurens Beerepoot, internist-oncoloog @ETZnl. Lees het hele interview https://t.co/RPPTvgPdTS #wholegenomesequencing #diagnostiek #zorgopmaat

[Hartwig Medical @HartwigMedical]

“De ontwikkeling van de moleculaire diagnostiek in de oncologie heeft een razendsnelle ontwikkeling doorgemaakt in de laatste jaren". @Louisa Hoes, internist-oncoloog in opleiding bij het @Antoni van Leeuwenhoek, over de stage moleculaire diagnostiek: https://t.co/HosxcuoEFf

[Hartwig Medical @HartwigMedical]

@hetAVL @prinsesmaximac Interessant symposium met onderwerpen als kiembaan benaderingen, zelflerend zorgsysteem en recente updates mutaties en potentiële klinische toepassingen. #verpleegkundigspecialist #patholoog #internistoncoloog #radioloog #researchverpleegkundige #kmbp #wholegenomesequencing

[Antoni van Leeuwenhoek @hetAVL]

📅Op dinsdag 7 november organiseert het Antoni van Leeuwenhoek in samenwerking met @prinsesmaximac en @HartwigMedical een symposium over de laatste ontwikkelingen in Whole Genome Sequencing. Bekijk het programma en schrijf je in ➡️ https://t.co/mzecEJQ1hf

[Hartwig Medical @HartwigMedical]

“A complete genetic analysis should be part of standard diagnostics for every patient with cancer for: 1 better, tailored treatment advice, 2 less over- and under-treatment, 3 more cost-effective affordable care” Miriam Koopman @UMCUtrecht @oncodeinstitute https://t.co/lKoyzkMnKN

[Hartwig Medical @HartwigMedical]

Door data en kennis met elkaar te delen ontstaat er een lerend zorgsysteem. Zo wordt met de data van de patiënt van vandaag de behandeling van de patiënt van morgen verbeterd.

#lerendzorgsysteem #zorgopmaat #kankeronderzoek #sequencing

[Hartwig Medical @HartwigMedical]

"Zelfs als we geen behandeling vinden, maar wel de oorsprong van de ziekte, dan is dat ook winst. De onzekerheid over waar die tumor vandaan komt, is ook een groot issue voor de patiënt": Vincent Smit, hoofd pathologie van het @LUMC Leiden https://t.co/2F4xvDWQZW #tumoronbekend

[Hartwig Medical @HartwigMedical]

Gezocht: Moleculair Analist - Lab Technician in een high-tech NGS lab.

Wil je een bijdrage leveren aan de verbetering van de behandeling van kankerpatiënten? Solliciteer nu!

https://t.co/jPjOVLduZD

#moleculairanalist #hightech #DNA #sequencing #laborant #researchtechnician