Top Tweets for #sccomp
We just launched #sccomp for #Python!
Testing for differences in cell-type proportion in #singlecell #spatial data?
#sccomp is a mixed-effect Bayes model
- Use Sum-constrained BetaBinomial
- Outliers detect.
- 🧹 unwanted effects
https://t.co/b9bdWWRWC2
🙏 @zhanchen2603
🎉 Major release update for #sccomp, now also capable of
- Random effect modelling (e.g. nested, crossing)
- Modelling proportions directly (e.g. in deconvolution)
- Uses the new @mcmc_stan backend `cmdstanr`
https://t.co/BcBVttw9ae
This study introduces the #multilevel (random effect) capability of #sccomp on a multi-atlas scale!
For #compositional analyses (differences in cell proportions) and the body and tissue levels. @Bioconductor
https://t.co/DTIwx5PxwS
⚡️ #sccomp 1.7.7 got lightning-fast with variational inference!
Your #singlecell #proportion, #compositional analyses got 10x faster without compromising on
- continuous/discrete models
- outlier removal
- prediction
- removal of unwanted variation
The new interface for #sccomp is out! And it's #tidy ;)
#robust abundance and variability analyses for #singlecell data.
... |>
sccomp_estimate() |>
sccomp_remove_outliers() |>
sccomp_test()
-> https://t.co/5M9QdfJqid
@Bioconductor @mcmc_stan @mikelove @fishswilliam
🚨🧬 Excited to share ->The circulating immune cell landscape stratifies metastatic burden in breast cancer patients
Progressing #immunodiagnosis in #BreastCancer
#singlecell | #sccomp | Cell inter-talk | gd T cells
https://t.co/4ntCyDEj00
👏🏽@drbhupinderpal & team!
Notre spécialiste du comportement @NickBDiamond était à la préconférence @sciencepolicy 2023!
Il s’est joint à @ISDE_CA dans le cadre d’un panel pour parler de la #mésinformation en ligne et des résultats de plusieurs projets de #ScComp d’#ImpactCanada.
https://t.co/3kaNCEjDwM
#sccomp -> Compositional analysis of #singlecell RNA, #CyTOF and #microbiome.
https://t.co/O2G2DfO8HL
We show that
1: Proportion means & overdispersions are correlated (beyond the "Beta-binomiality").
2: The Dirichlet-multinomial produces biased estimates of variability.
#sccomp is out! 🔥 Test differences in #composition and #variability in #singlecell
- Complex models, discrete/continuous
- Outlier robust
- Count based
- Data simulation
- Prediction
- Removal of unwanted variation
@WEHI_research @Bioconductor
https://t.co/O2G2DfNASd
🙌 La réunion scientifique d'ACC 2023 commence aujourd'hui!
Joignez-vous à @KTCanada et à @uOttawa_SEPH dans les 2️⃣ prochains jours pour des discussions, débats d'experts et présentations, notamment de notre boursière en #ScComp Katie Harper.
#ImpactCanada
Notre collègue @leifer_jessica est conférencière à la #SOBDR2023, où elle parlera de la #ScComp dans les organisations. Jess discutera de notre modèle en #ScComp et de son utilisation pour améliorer le fonctionnement du gouvernement pour les 🇨🇦
https://t.co/YFjYimsGq7
AUJOURD'HUI : la #SOBDR2023!
Écoutez nos collègues @dselarka91, Katie Harper et @sofia_deleniv parler d'études en #ScComp, dont :
⚙️ Transparence opérationnelle
📝 Segmentation + traduction pour les Comms
🏡 Chauffage résidentiel
https://t.co/RH5Z5UFy20
Joignez-vous à @KTCanada et à @uOttawa_SEPH pour la réunion scientifique d'ACC de 2023.
La boursière en #ScComp d'#ImpactCanada Katie Harper fera une présentation par affiche sur la segmentation + l'application pour les comms! ✍
📅 11 et 12 mai
🔗 https://t.co/ghr0Ogq1gf
Notre collègue @FindlaterKM a rencontré les étudiants de @CarletonSPPA dans le cadre de leur #MPPACapstone. Il a parlé de l'utilisation de la #ScComp par #ImpactCanada pour lutter contre les #ChangementsClimatiques et la #mésinformation.
En savoir plus : https://t.co/7yICLtqM5c
EN DIRECT : Lancement du rapport sur la #mésinformation, par @OCDE_fr.
@lauryn_conway et @rodney_ghali et nos collègues de @OPSIgov et @_DITP présentent le rapport sur l'utilisation de la #ScComp contre la prolifération des #FaussesNouvelles.
https://t.co/bhWlxXpRWs
📢 DATE À RETENIR : 15 novembre 📅 lancement du rapport sur la #mésinformation par @OCDE_fr et @OPSIgov.
🎧 Des experts de la #ScienceduComportement et d'autres expliqueront comment utiliser la #ScComp pour freiner la mésinformation.
💻 Inscription : https://t.co/n885wOkDHF
Bienvenue à @justinsavoie, nouveau fellow en #ScComp à #ImpactCanada. Justin apportera son soutien au portefeuille Confiance du public et Mésinformation.
Bienvenue dans l’équipe! https://t.co/0PljjGMY7S
C'EST MAINTENANT : Présentation éclair « Messaging Trial to Understand Mask Wearing Intentions Beyond the COVID-19 Pandemic » dans le cadre de #BIGdifferenceBC.
Entendre nos fellows en #ScComp @Sarah_Wall93 et @tgoods88 parler de leur récents travaux. ⤵️
https://t.co/pInwQtMmJ4
Le lancement du rapport sur la #mésinformation aura lieu le 15 nov. 📅
Nos collègues @lauryn_conway et @rodney_ghali, et des experts de @OCDE_fr et @OPSIgov expliqueront comment la #ScComp 🧠 pourrait freiner la mésinformation.
Inscription : https://t.co/5Cq0Uy74Dn
L'événement #BIGdifferenceBC a lieu le 4 nov! Nos fellows en #ScComp @Sarah_Wall93 et @tgoods88 y seront avec la @BCPublicService et l'@UBCSauderSchool. Assistez à leur présentation éclair sur les intentions concernant le port du masque après la pandémie : https://t.co/tLCX7VEaPT
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