ktroule

Computational biologist, now @sangerinstitute, before @BU_CNIO.

[ktroule @ktroule]

+5 years of experience qualify me to say that the @BU_CNIO is not only a great scientific team, but a group composed by the best human beings that you can find in the field, something harder to find than it should be. PS Music might not always be the best, specially on christmas.

[Constantin Ahlmann-Eltze (@const-ae.bsky.social) @const_ae]

There's a lot of excitement about foundation models and their ability to learn biology 🧬💻

But current tools for perturbation prediction perform worse than simple linear models! We need more careful benchmarking to make progress.

https://t.co/lTJM7ghk2r

[ktroule @ktroule]

Pequeño recordatorio. Algunos de los que se quejan hoy de estas medidas (y con razón) son PI que tienen a cargo estudiantes trabajando muchas más de las 40h semanales y de esto nunca se protesta. Porque la ciencia entiende derechos laborales a veces.
https://t.co/mtWbENJoDV

[BU_CNIO now in Bluesky: @bioinformatics.cnio.es @BU_CNIO]

PanDrugs2 is out!
✅Multiomics analyses combining somatic & germline variants,CNVs & gene expression data for personalized treatment prioritization💊
✅Genetic dependencies as druggability evidence
✅Report to support clinical decision-making
ℹ️📚@NAR_Open https://t.co/WHvjztTC8m

[Joan Anton Català Amigó @estelsiplanetes]

Pocs temes són tan apassionants (i misteriosos alhora) com l'origen de la vida a la Terra.
A Joan Oró, això el va captivar tant que hi va dedicar la seva, de vida, a estudiar-ho.
Enguany celebrem el centenari del naixement d'aquest enorme científic lleidatà. Deixeu-me que us expliqui...
#AnyJoanOró @FundacioJoanOro @recercauniscat

[BU_CNIO now in Bluesky: @bioinformatics.cnio.es @BU_CNIO]

Hoy estamos encantados de asistir a la defensa de la tesis doctoral de @fpozoca !! 🧑🏻‍💻🤓
Enhorabuena Fer!!! Y enhorabuena a su director @MichaelTress y compañeros de laboratorio 🍾👏👏

[Anna Arutyunyan @immunobananna]

So excited to see our work on mapping human trophoblast in early pregnancy out in @Nature! I had the privilege of working alongside @krobertssci, @ktroule, @fredwck, @MSheridan226 and an incredible team on one of the coolest tissues @sangerinstitute https://t.co/cgomW3lA80

[ktroule @ktroule]

@pacolonso "Las mujeres enumeraban
las excelencias de la rata en el arroz de la paella; muchos la habían comido sin saberlo, asombrándose con el sabor de una carne desconocida." Cañas y barro tiene al menos 4 referencias.

[M. Ángeles Bonmatí @bonmati_m]

Ser científico SÍ es una profesión. El problema del discurso Mr Wonderful en torno a la vocación científica es que con él se nos van los derechos laborales que podríamos tener si todos tuviéramos clara la primera afirmación.

[Molecular Oncology @MolOncology]

🆕Review - now available

💻This review provides bioinformatics tools and workflows for tailored treatment selection depending on type of tumour heterogeneity targeted (inter-/intra-tumour)

🆓https://t.co/wZmsAnLrS6

#Bioinformatics #TumourHeterogeneity

[Colm Ryan @colmr]

Finishing up my PhD in 2012 I had a stipend of €18k. A decade later my students have a stipend that is only marginally higher (€18.5k, 3% increase). In the same time period rent for a single room in Dublin has gone up almost 70%. This is completely unsustainable.

[Ulisses Ortiz @ulissesOB]

Portes (i persianes) del Carrer de la Pilota. De Castelló de la Plana a Mutxamel. Raspall, galotxa, llargues i palma (2018-2022) #pilotavalenciana

[BU_CNIO now in Bluesky: @bioinformatics.cnio.es @BU_CNIO]

📢We are hiring!!
Would you like to work at @CNIOStopCancer ?
Now is your chance to join @BU_CNIO team!
🧬👩🏽‍💻We are looking for a bioinformatician to analyse and interpret cancer multi-omics data.
ℹ️Check full info and more details here: https://t.co/KpP8hBiVp3
Please spread!!

[ktroule @ktroule]

@bollofruits el camión vuestro que ha pasado entre la Barraca y Alzira sobre las 19:10 iba zigzagueando y casi se lleva por delante a un ciclista que circulaba correctamente por el arcén. Quizás os apetezca revisar estás prácticas.

[Michael Love @mikelove]

Got an RNA-seq dataset with 50, 100, 200+ samples? Plug it into a differential expression tool and hope for the best? No! You need to consider QC, EDA, and modeling technical variation, or else risk generating spurious results. A thread on papers, methods, and best practices:

[BU_CNIO now in Bluesky: @bioinformatics.cnio.es @BU_CNIO]

Ya está abierto el plazo de preinscripción para la "6ª Edición del Máster de Bioinformática aplicada a la Medicina Personalizada y la Salud". Organizan @SaludISCIII @CNIOStopCancer @BSC_CNS @SEBiot_
Puedes preinscribirte en https://t.co/lUhURKEFdD
🧬💻👩🏼‍💻👨🏼‍💻📚🎓👌🏼

[Niels Eijkelkamp @Eijkelkamp_N]

Pain resolving macrophages: Macrophages resolve inflammatory pain by donating their mitochondria to sensory neurons.
Team work with @MichielVlist @RaoofRamin @HLDMWillemen @LindeMeyaard. Proud! Such a fun, cool and inspiring collaboration.
https://t.co/n2KqJHx2Ce
A thread.1/n

[Joves PV - Compromís l'Alacantí @JovesPVALC]

🧡 80 anys sense el poeta oriolà Miguel Hernández i 29 anys sense el poeta burjassoter Vicent Andrés Estellés.

Dos figures imprescindibles del poble valencià. #MiguelHernández #Estellés #PaísValencià #Oriola #Alacant #Burjassot #Memòria #Ser

[Vicent Baydal @vicentbaydal]

Jake Abbott ha fet les fotografies de NITS DE TINTA, una obra que ha preparat amb Felipe Escolano i Pepe Sopa durant més de 20 anys sobre les pesqueres dels cingles de Xàbia i Benitatxell. En parlarà @jvmiralles en la @RevLletraferit #28. Una barbaritat de reportatge!!

[ktroule @ktroule]

@Sapiencia5 Ha estado de categoría, mel de romer.

[ktroule @ktroule]

@Sapiencia5 Regocijo y algarabia por doquier!