Francisco S.S

🎄

[Jacob @JacobMolBio]

For biologists using Claude Science, here is Motif, an AI-native molecular biology workbench plugin. Now, you don't need to leave Claude Science to view and operate on your sequences.

Motif gives the full power of Claude to your upstream mol bio workflows, such as asking Claude to: 1) fetch the genes in a target pathway and annotate them, 2) perform and view multiple sequence alignments using your preferred alignment tool, 3) design and label CRISPR-Cas guide sequences, and much more.

Motif was built as part of the "Built with Claude: Life Sciences" hackathon, and is an MIT-licensed, open source plugin.

Also, Claude made this demo video using HeyGen's Hyperframes and Elevenlabs TTS.

[Ming "Tommy" Tang @tangming2005]

(Harvard STAT115): Introduction to Bioinformatics and Computational Biology by Shirley Liu.
https://t.co/sTJfvCq9nO

[Nature Reviews Microbiology @NatureRevMicro]

New online! Immune safeguarding as a conserved principle of antiviral defence https://t.co/KCaCmDAy6U

[Francisco S.S @luis_ss22]

Argentina te banco a morir 🤍

[Dr. Sezen Arslan @sezenalsra]

Yüksek lisans/doktora teziniz veya makaleniz için literatür taraması sürecini kolaylaştıracak yapay zeka tabanlı bir araçtan bahsetmek istiyorum. Bu aracın en güzel yanı, abonelik gerektirmemesi ve tamamen ücretsiz olması. Türkçe arama da yapabiliyorsunuz. Aracımızın adı: https://t.co/g8V7hlKnqO

Open Alex’in filtreleri sayesinde, bir çalışmanın yayın yılı, açık erişim olup olmadığını görebiliyorsunuz ve ayrıca konunuza uygun makale, kitap bölümü, tez vb. hangisini istiyorsanız onu seçebiliyorsunuz. Ayrıca atıf sayısı filtresi sayesinde, belirli bir sayı üzerinde atıf almış makaleleri de bulmanızı sağlıyor.

Open Alex’i güçlü kılan yanlarından biri de 'domain', ‘field’, ‘keyword’ gibi filtreleri sayesinde, çalışma alanınıza yönelik spesifik aramalar yapabilmeniz.

Bunların yanı sıra, sadece belirli yayıncıya (PubMed, Wiley vb.) ait dergileri de filtreleyebilirsiniz.

Ayrıca, arama sekmesinin hemen altında boolean ve semantic opsiyonları bulunuyor. Boolean opsiyonunu, tam olarak ne aradığınızı biliyor, hangi anahtar kelimeleri kullanarak araştırma yapmak istiyorsanız kullanabilirsiniz.

Semantic opsiyonu ise, konuyu genel çerçeve olarak biliyor, yapay zekanın bu konu ile anlamsal olarak ilintili çalışmalar önermesini istiyorsanız kullanabilirsiniz.

Türkçe arama yapabilsek de, malesef İngilizce kadar zengin filtre ayarları bulunmayabiliyor.

Sizler için hazırladığım, filtreleri görebileceğiniz kısa tanıtım videosunu aşağıda bulabilirsiniz.

📍Bu paylaşımım hesabımdaki diğer yapay zekâ araçları tanıtımında olduğu gibi, herhangi bir sponsorluk ya da ticari bir işbirliği değildir. Sadece bizzat deneyimlediğim akademik verimliliği artırdığına inandığım araçları araştırmacılara yol gösterme niyetiyle paylaşmaktayım.

[小互 @xiaohu]

Anthropic 发布 Claude Science

面向科学家的 AI 工作台，内置 60 多个科研技能

它是一个装在你自己电脑或服务器上的应用：你用大白话向一个 AI 提出科学问题，它调动数十个专业工具去查数据、跑分析、画图表、写手稿，而每一步产物都能倒查回它是怎么来的。

你可以像用 Jupyter Notebook 那样，在本地（macOS／Linux）用它，也可以在远程机器上通过 SSH 或 HPC 登录节点用它。

→ 应用内置60多个预配置技能和连接器，覆盖基因组学、单细胞、蛋白质组学、结构生物学、化学信息学，背后接进成百上千个专业数据源（UniProt、PDB、Ensembl等）以及期刊、预印本资源。

→ 它能自主起草计算任务，征得用户同意后提交到用户自己的 HPC集群或 Modal云端GPU，把分析从单块GPU 扩展到数百块，而原始数据始终留在用户自己的系统里。

→ 内置一个审稿 agent，全程检查生成内容里的引用是否真实、数字能否对上计算过程、图表是否和产出它的代码一致，发现问题会自动修正。

[Alejandro Alegria 🌴 @alegriagonzaa]

🔴#Tucapel Las intensas ráfagas de viento han provocado una densa nube de polvo en el sector de #Trupán.

⚠️ Precaución en la ruta.

@reddeemergencia @Sepulinares @RedGeoChile @RNE_Alpha_8 @cleivamoris @nimbusmeteorol @NodoRiesgo @Seba_Quake_WX

[Itai Yanai @ItaiYanai]

🔥 Published today, and just in time for summer conferences, here are your guidelines for presenting badly

[Huiluo Cao 曹慧荦 @hlcao]

A Streptomyces megacluster encodes synergistic biotin-targeting antibiotics | Nature https://t.co/iBn9S4LI0T

[د.مها @res_pian3]

محرك بحث اكاديمي يعمل بالذكاء الاصطناعي Scinapse خصائص رهيبة مفيد جدًا للباحثين، اهم الخصائص المتاحة يعطي قائمة بكافة المراجع والاقتباسات من المقال. خاصية registry تحتفظ بتاريخ ما بحثت عنه سابقاً.

👇👇
https://t.co/svIf5LDeg5

[Aude Bernheim @AudeBer]

Join us in Paris on April 8th-10th for the 2025 Symposium on the Immune System of Bacteria 🥖🍷🦠🧬.

Excited to welcome these amazing speakers at @institutpasteur .

Registration will open beginning of November. Abstract deadline February 28. Stay tuned.

[Francisco S.S @luis_ss22]

Hi David!! @WishartLab I wanted to ask if the phastest server is down?

thanks!

[Rosana Ferrero 📈📊🙌 @RosanaFerrero]

Si sigues enviando análisis de datos en archivos Excel, Words o PDFs que quedan obsoletos en cuanto cambian los datos o modificas un paso del análisis, entonces este post te interesa 👇

#RStats #DataScience #Quarto #RMarkdown #ReproducibleResearch #DataAnalytics #DataViz #stats

[Oliver Prompts @oliviscusAI]

Turn Claude Code into a full academic research team with this guide.

> Deep Research: 13 agents, 8 modes
> Academic Paper: 12 agents, 11 modes
> Academic Paper Reviewer: 7 agents
> Academic Pipeline: 10-stage orchestrator with citation verification

Free for non-commercial use.

[Dr. Sezen Arslan @sezenalsra]

Yüksek lisans/doktora teziniz veya makaleniz için özgün bir konu bulmaya çalışıyorsanız, alternatif bir yapay zekâ aracını sizinle paylaşmak isterim: https://t.co/FVivmDItLv

Öncelikle uygulamanın çalışma prensibinden bahsedeyim. Uygulamaya girip ilgilendiğiniz konuyla ilgili birkaç makaleyi seçiyorsunuz ve Research Rabbit, bu makalelerin kaynakçalarını, bu makalelere yapılan atıfları ve ortak yazarları analiz ederek sizi konunuzla ilgili başka diğer makalelere yönlendiriyor. Siz, bu makaleler arasından yenilerini seçtikçe, algoritma ilgi alanınızı daha iyi öğreniyor ve önerileri daha rafine bir hale getiriyor.

Bu işlem sayesinde odaklanılmış konuları görmekle birlikte, birbiriyle ilişkilendirilmemiş alanları da görebiliyoruz. Mesela, tamamen sizin için örnek olması maksadıyla oluşturduğum aşağıdaki görselde; literatür boşluğu sağ üst veya sağ alt kısımdaki izole, yani hiçbir çalışmayla ilişkilendirilmemiş makalelerde saklı olabilir. Açıp okumak lazım.

Herkesin atıf yaptığı makaleler, teorik çerçeve ve kuramsal zemin için elbette şart ama yeni bir şeyler söylemek istiyorsak, farklı mecralar keşfetmek zorundayız. Bu konuda Research Rabbit’i deneyebilirsiniz.

📍Bu paylaşımım hesabımdaki diğer yapay zekâ araçları tanıtımında olduğu gibi, herhangi bir sponsorluk ya da ticari bir işbirliği değildir. Sadece bizzat deneyimlediğim akademik verimliliği artırdığına inandığım araçları araştırmacılara yol gösterme niyetiyle paylaşmaktayım.

[Olivier Borkowski @O_Borkowski]

Paradoxical gene regulation explained by competition for genomic sites
https://t.co/nzjEQY4APU

[Yusnelkis @Milanes_guisado]

Repos de skills para investigación con Claude Code.

Para escribir artículos, no está nada mal 😊

1. Academic Research Skills for Claude Code
https://t.co/xV6VNaDhDq

2. research-proof
https://t.co/JB6xhf3XRu

A seguir aprendiendo !

[Nona @Nona_xai]

Un tipo llamado nbatman en Reddit construyó accidentalmente el sitio web más útil de internet.

Se llama FMHY (Free Media Heck Yeah).

Este es el sitio web que Google eliminó de los resultados de búsqueda por violaciones de DMCA, que Reddit ocultó parcialmente por promover la piratería, que la Motion Picture Association señaló como una de las principales amenazas de piratería, y sobre el que la RIAA presionó a proveedores de hosting para que lo eliminaran. Aun así, sigue en línea. Y sigue actualizándose cada mes.

Así es como funciona.

FMHY es el índice. La wiki en sí no aloja nada. Solo te dice dónde vive realmente todo lo gratuito en internet, organizado en 14 categorías con calificaciones de seguridad en cada enlace.

→ Películas y series en 4K desde más de 50 sitios de streaming
→ Música con calidad de Spotify y Apple Music
→ Adobe Creative Cloud, Microsoft Office, AutoCAD, JetBrains
→ Todos los cursos de pago de las principales plataformas de aprendizaje
→ 100 millones de libros y artículos a través de Anna’s Archive
→ Alternativas gratuitas a todas las herramientas de IA de pago
→ Una extensión de navegador llamada SafeGuard que marca sitios inseguros en tiempo real

Comenzó como un simple Google Doc mantenido por un moderador de Reddit en 2018. Google lo eliminó mediante una solicitud DMCA en 2023.

La comunidad reconstruyó la wiki en su propio dominio, la replicó en GitHub e IPFS, y ahora funciona simultáneamente en 12 dominios de respaldo.

No hay empresa. No hay CEO. No hay un servidor central. Seis voluntarios anónimos mantienen todo esto en su tiempo libre. Las donaciones por Ko-fi pagan el hosting. Nadie obtiene beneficios.

Hollywood no puede cerrar esto. Spotify no puede cerrar esto. Adobe no puede cerrar esto.

Toda la economía de suscripciones se sostiene en que no sepas que esta wiki existe.

https://t.co/xDVW1xKCxd

[Jeremy Nguyen ✍🏼 🚢 @JeremyNguyenPhD]

Paper Debugger: Multi-Agent System for Academic Writing

[veyhon @veyhon]

把 Claude Code 变成一条学术研究流水线，用人类确认点和强制完整性门禁串起检索、写作、审稿、修订和定稿。

https://t.co/fVf8RfDXec

ARS 把流程拆成 RESEARCH → WRITE → INTEGRITY → REVIEW → REVISE → FINAL INTEGRITY → FINALIZE，每个阶段都要用户确认；2.5 和 4.5 是完整性门禁，先跑机器验证，再由用户确认报告，失败就退回修正。