Michelli Gonçalves

PhD Student in Agricultural Microbiology at @Unesp_Oficial. Microbiology 🧫| Plant-Microbiome Interactions 🌱🦠| Omics Sciences 🧬| 💻 Bioinformatics

[biorxiv_scicomm @biorxiv_scicomm]

Bridging the Python Training Gap for Bioscientists in Brazil: Improvements and Challenges https://t.co/mml0yf0UIk #biorxiv_scicomm

[Michelli Gonçalves @michelli_gf]

Beautiful fungi contamination plate! 🍄 #microbiology #fungi

[Michelli Gonçalves @michelli_gf]

@chicoma_angel Amazing work!
Congrats Luis 👏

[Brazilian Python Workshop for Biological Data @BrazilPythonWS]

Hoje @vhfsantos colocou no ar a lista dos 40 selecionados para a 5ª edição do Workshop de Python para Dados Biológicos.

Confiram aqui:
https://t.co/GYaSK09UCQ

#Python #Biociências #Programação #Workshop #Educação

[Brazilian Python Workshop for Biological Data @BrazilPythonWS]

Opfi, um pacote feito em #Python para identificação de clusters gênicos, criado por Hill et al, pode ser utilizado para verificar genes que realizam funções específicas em clusters genéricos, permitindo conhecer novas funções gênicas. https://t.co/gsODwD3Lv9

Obrigado @scaketti!

[Brazilian Python Workshop for Biological Data @BrazilPythonWS]

Gsmodutils é uma ferramenta em #Python, desenvolvida por Gilbert et al. (2019), amplamente utilizada na biologia sintética e na microbiologia industrial para simulações metabólicas usando modelos em escala genômica (GEM). Veja mais em https://t.co/eZ1wsltUFt

Thanks @ph_narciso!!

[Brazilian Python Workshop for Biological Data @BrazilPythonWS]

O Community Simulator é um pacote em #Python criado por @MarslandBobby et al. para simular dinâmicas populacionais microbianas de forma reproduzível, transparente e escalável. Seu algoritmo chega ao estado de equilíbrio de populações.
https://t.co/o9KPwmWALP
Thanks, @leoreidela!

[Brazilian Python Workshop for Biological Data @BrazilPythonWS]

MatteoPalù et al. (2022) desenvolveram o KEMET, uma ferramenta implementada em #Python com objetivo de avaliar módulos KEGG e expandir a anotação de genomas microbianos por buscas direcionadas com sequências ortólogas.

[Ian Lidbury @IanDEALidbury]

Please RT: I will have a full-funded 3.5 year PhD studentship available in Oct 2022 (hopefully) or the year after (definitely).

Determining unique carbon & phosphorus acquisition mechanisms driving the success of Flavobacterium in the plant microbiome.

[Dr. Ulisses Rocha (he/they) @ulisses_rocha]

Are you interested in recovering genomes from Prokaryotes, viruses, and/or Eukaryotes?

We just released the MuDoGeR: https://t.co/gZ7qL9KDk1

Let us know what you think about the tool. The manuscript will be uploaded to @biorxivpreprint in the next few days.

#bioinformatics

[Michelli Gonçalves @michelli_gf]

@WBDSLA @sarmanhon

[Brazilian Python Workshop for Biological Data @BrazilPythonWS]

Pacote em #Python criado por @ghislainv, ForestAtRisk é capaz de processar arquivos RASTER de alta definição, para identificar áreas de risco de desmatamento nos trópicos.

Acesse: https://t.co/9GUoKAgmfp

[Michelli Gonçalves @michelli_gf]

@chicoma_angel 👏👏

[Brazilian Python Workshop for Biological Data @BrazilPythonWS]

O #iNucs é uma ferramenta de #bioinformática escrita em #Python para visualização de redes de interação no nível de #nucleossomos e desvendar a organização do genoma. O artigo foi publicado na @OUPBioinfo https://t.co/pcgDoOgK0D

[Brazilian Python Workshop for Biological Data @BrazilPythonWS]

Manish Goel e Korbinian Schneeberger desenvolveram o plotsr uma ferramenta implementada em #Python via #CLI, que permite a visualização de forma simples e flexível de semelhanças estruturais e grandes rearranjos entre múltiplos #genomas. Veja mais: https://t.co/L6NgaANLVR

[RedeComCiência @redecomciencia]

👉 Workshop gratuito idealizado pelo biólogo Renato Corrêa (@CorreaSantosRA), membro da RedeComCiência, ensina linguagem de programação para biocientistas.

🗒 Leia mais sobre o projeto @BrazilPythonWS no nosso site: https://t.co/SG1m45Wz6b

#AçõesDaNossaComunidade #Python

[Brazilian Python Workshop for Biological Data @BrazilPythonWS]

Hachimi et al. desenvolveram a biblioteca Data Science Toolkit em #Python, implementando algoritmos de #DataScience e facilitando a manipulação de dados de diversas áreas, unindo funções de processamento de imagens, #MachineLearning e visualização de dados https://t.co/Vj1diB47Sw

[Brazilian Python Workshop for Biological Data @BrazilPythonWS]

O pacote NSDPY é uma ferramenta implementada em #Python desenvolvida por Hebert e Meglécz da @univamu, uma alternativa para recuperação de grandes quantidades de sequências dos bancos de dados do #NCBI, simplificando buscas a partir de termos de pesquisa https://t.co/R6AsHBsgCT

[Microbiologist 🇵🇸 @CDC_MicroBio]

Life of a Microbiologist 😃
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[Brazilian Python Workshop for Biological Data @BrazilPythonWS]

Tools for Analyzing Time Series of Satellite Imagery (TATSSI) foi desenvolvido por pesquisadores do @Conacyt_MX, em #Python e com uso de #Jupyter Notebooks. #TATSSI tem diversas funções, como download de dados temporais de satélites e análises de dados. https://t.co/lhLlA61qM6