西村瑠佳 (Luca Nishimura)

古代ウイルスを研究する東大医科研ポスドク
Hokkaido Univ.→SOKENDAI, NIG→Postdoc at @SystemsVirology lab, Univ. of Tokyo
Ancient virus / Virome / iGEM / Violin / 生命情報科学, 遺伝学, ウイルス若手

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

卒業に合わせてこちらのインタビュー動画・記事が公開になりました！動画インタビューは初めてでドキドキだったのですが、素敵なものができたと思います✨研究内容だけでなく、研究を始めたきっかけなども紹介しています。ぜひご覧ください👀

[総研大 (総合研究大学院大学) @SokendaiU]

【学生インタビュー】ウイルスは未知の宝庫（遺伝学専攻 西村瑠佳さん）
https://t.co/xK805uYRIL

[北海道大学理学部 @Science_HU]

髙木昌興教授（生物科学科／生物学）が監修した、#学研の図鑑LIVE『鳥 新版』が刊行！約900種の鳥を掲載し、スマホで約200種の鳴き声も聞ける充実の内容。多くの鳥の研究者が関わり、科学的な解説もあります。鳥好きはもちろん、大人も子どもも、鳥の魅力を発��できる一冊です。@gakken_zukan #学研の図鑑
https://t.co/5xIetQE2bX

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

It was a pleasure to attend the NIDO conference 🇭🇰
Many thanks to everyone who visited my poster and to those who attended my one minute oral talk (which was indeed only one minute long😂)

[The Sato Lab (Kei Sato) @SystemsVirology]

#nidovirus2026 is finally over! What a great 4 days in Hong Kong🇭🇰! 11 gangs from The Sato Lab participated in😎

Many thanks to all the participants. Let’s keep in touch, and I am very much looking forward to seeing you again in the near future🤩

[The Sato Lab (Kei Sato) @SystemsVirology]

#nidovirus2026 will start so soon🇭🇰!!
Looking forward to seeing all coronavirologists and nidovirologists tomorrow. The Sato Lab is almost ready😎 https://t.co/ioGQBA6g9c

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

Sharing our new preprint🤩
This work represents what I have been working on during my two years as a postdoc.
This study would not have been possible without the support and collaboration of many people. I'm deeply grateful.
I'd be happy if you take a look!

[Jumpei Ito @jampei2]

By rapidly quantifying interferon-stimulated genes (ISGs) expression across 220k RNA-seq data sets from diverse animals, we comprehensively identified “hidden viral infections” in wildlife and livestock (1/n).
https://t.co/K6Yu47dhCJ

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

共有が遅くなりましたが、プレプリントを公開しました。
ポスドクの2年間で取り組んできた内容になります。
多くの方のご協力のおかげで形にすることができ、心より感謝申し上げます。
ご興味のある方はぜひご覧いただけますと幸いです🙏

[Jumpei Ito @jampei2]

【拡散希望】新作プレプリントが出ました！
様���な動物に由来する22万件のRNA-seq dataから自然免疫関連遺伝子群（ISGs）の発現を高速に定量し、ウイルス感染の有無を予測することで、野生動物・家畜における「隠されたウイルス感染」を網羅的に同定しました（1/n）。
https://t.co/K6Yu47dhCJ

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

@saiaka3 ��藤先生、どうもありがとうございます🙇‍♀️

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

昨年末に参加した日本免疫学会で、Best Presentation Awardを受賞しました🌸発表を聞きにきてくださった皆さん、審査してくださった先生方にお礼申し上げます🙇‍♀️写真は会場近くの姫路駅。
https://t.co/xSjmirA5hj

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

ご無沙汰しております🙇‍♀️風邪を拗らせていたこともあり、今月はほとんど投稿できずでした🥺
また、忌中につき新年のご挨拶は控えさせていただきます。
研究や音楽活動等で関わってくださった全ての皆さまに、心より感謝を申し上げます🙏
よいお年をお迎えください✨来年もよろしくお願いいたします！

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

そして今週は免疫学会に参加中です！
明日2日目(12/11) 16:40-16:50にRoomFのViral infections and immunityにて口頭発表とポスター発表があります。お時間のある方、ぜひお越しください🙏
[WS20-29-O/P]#日本免疫学会

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

報告が遅くなりましたが、先週は分子生物学会@パシフィコ横浜参加してきました！口頭発表やポスターを聞きにきてくださった皆様、ありがとうございました���

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

分生3日目午前の「【J】攪乱RNA-生体を負に制御するRNAの生理とその適応機構」セッションにて、口頭発表・ポスター発表をさせていただきます😊 タイトルは「大規模RNA-Seqデータを用いた宿主免疫応答の定量に基づくウイルス感染の検出」です！ぜひお越しください✨
[3AS-03-03(3P-793)] #MBSJ2025

[The Sato Lab (Kei Sato) @SystemsVirology]

本日午後、第48回日本分子生物学会年会 #MBSJ2025 で、シンポジウム「『次のパンデミック』に備えるための実験ウイルス学の挑戦」を開催します。第15会場です。

ウイルス研究と分子生物学は切っても切れないものです。分子生物学に基づいたこれからのウイルス研究についてお話しましょ��！

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

【811日目】腸管内での水素産生が主にB型の[FeFe]-ヒドロゲナーゼによって駆動されていることを示した研究。解析によりヒドロゲナーゼをコードする遺伝子が腸内細菌に広く存在、転写されることが明らかに。クローン病患者ではB型ヒドロゲナーゼが減少する模様。#毎日ろんぶん
https://t.co/PJW9DxRqtM

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

【810日目】野鳥・家禽・哺乳類由来の1818のHA配列を解析し、2021~の北米でのH5N1の流行について調べた研究。H5N1は大西洋・太平洋の渡り経路への約9の導入により引き起こされ、渡鳥によって急速に大陸内で拡散が起こった模様。主にカモ類等典型種により伝播。#毎日ろんぶん
https://t.co/rKZEi3W7fM

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

【809日目】environmental micro-compartment genomics (EMCG)という技術を開��した研究。粒子をピコリットルサイズの半透膜カプセルに分け、カプセル内でDNA増幅とバーコーディングを行い単一粒子ゲノム解析を高効率化。海水300 nLから2037粒子のゲノムを取得。#毎日ろんぶん
https://t.co/fgAQGLdUex

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

ここ一ヶ月諸々の出張を言い訳に全然更新できずでした…😭反省😭

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

【808日目】永久凍土で見つかった∼39,000年前の10検体のケナガマンモスの筋肉と皮膚から古代RNAを抽出・発現解析を行った研究。現代アジアゾウデータとの比較より、新規のmicroRNA候補配列を同定した。また筋肉組織特��的な遺伝子発現の保持が明らかに。#毎日ろんぶん
https://t.co/45JHRUAXmY

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

ここ1ヶ月、マレーシアとシンガポールにそれぞれ出張で行きました✈️ 美味しかったものの写真を一部🤤
I recently visited Malaysia and Singapore. Many thanks to everyone who took the time to talk with me!

[西村瑠佳 (Luca Nishimura) @nishimura_luca]

Congratulations, Spyros 🥳Your research is always amazing! Looking forward to your future fascinating work at Institut Pasteur 🇫🇷

[Spyros Lytras @SpyrosLytras]

Guess the news is officially out! Extremely excited to announce that I will be starting my own laboratory at Institut Pasteur @institutpasteur this coming spring!

Slight change to my office window view from Tokyo Tower🗼 to the Tour Eiffel. 🇫🇷

[The Sato Lab (Kei Sato) @SystemsVirology]

Happy to share my review in Cell Host & Microbe @cellhostmicrobe!

Wrote about systems virology, G2P-Japan, pandemic preparedness & responsive science in pandemic. It covers about G2P-Japan from its inception to its role in pandemic & my future perspective
https://t.co/j8wP5K6zOQ