Toyonori Sakata

Assistant Professor at IQB, University of Tokyo/Researcher at CMB, Karolinska Institutet
3D genome structure/SMC protein complexes/NGS analysis/cohesin

[Toyonori Sakata @KI_CMB]

Our study is out in @NatureComms! Beyond genome folding, cohesin helps recruit RNA polymerase II and restrains its pause release. In cultured human cells, we reveal how this supports productive transcription. 1/4
https://t.co/J3CKHhhsjt
#Cohesin

[Toyonori Sakata @KI_CMB]

A model explains the modest RNA changes: reduced Pol II recruitment and faster pause release can offset each other. But TNF-alpha-induced gene activation was impaired after cohesin loss, revealing a role masked at steady state. Fig. 7c,e
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https://t.co/rlg8IpQA0c

[Toyonori Sakata @KI_CMB]

Our study is out in @NatureComms! Beyond genome folding, cohesin helps recruit RNA polymerase II and restrains its pause release. In cultured human cells, we reveal how this supports productive transcription. 1/4
https://t.co/J3CKHhhsjt
#Cohesin

[Toyonori Sakata @KI_CMB]

Why does pausing matter? After cohesin removal, RNA polymerase II associated with fewer elongation factors, and we found evidence consistent with premature termination. Pausing appears to allow time to prepare for sustained elongation. Fig. 2a-e
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[Toyonori Sakata @KI_CMB]

コヒーシンはPol IIの呼び込みにも機能していました。除去による「呼び込みの低下」と「停止からの再開の促進」が、RNA量への影響を相殺するモデルを提案しました。一方、TNFα刺激による遺伝子の誘導は低下。定常状態のRNA量だけでは見えにくい役割が分かりました。
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https://t.co/MLEDrEC41p

[Toyonori Sakata @KI_CMB]

私たちの研究が@NatureCommsに掲載されました。ゲノムの折りたたみに関わるコヒーシンは、転写装置を呼び込む一方で、その「一時停止」にも機能していることがわかりました。ヒト培養細胞で見えてきた、転写制御におけるコヒーシンの新たな役割です。(1/4)
https://t.co/J3CKHhhsjt　

#Cohesin

[Toyonori Sakata @KI_CMB]

さらに、コヒーシンを失うと、Pol IIに結合する伸長因子が減少。転写が途中で終わりやすくなることを示唆する結果も得られました。一時停止は単なるブレーキではなく、RNAを最後まで作るための準備段階と考えられます。
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[東京大学 | UTokyo @UTokyo_News]

日本電気株式会社（NEC）と、人とAIが豊かに共生する信頼社会の実現に向けて産学協創協定を締結しました。今後は同社と連携・協力することで、「AIと共生する未来の協奏ー信頼ある社会実装に向けてー」というビジョンのもと、安全・安心を基調としたAIネイティブ社会の構築に取り組んでまいります。
#総���航海日誌 #PresidentsLog
https://t.co/7VDQRJV2c9

[Naomichi Takemata @pombe_archaea]

【拡散希望】当研究室で補助研究員を募集しています(勤務地：滋賀県草津市)。何かあれば気軽にメール・DM等でお尋ねください！
https://t.co/4Kx8uH0iNG

[Ryuichiro Nakato (中戸 隆一郎) @RyuichiroNakato]

2日間のUTokyo-NTU国際シンポジウム、無事終了しました。たくさんの方々に幅広いトピックでご発表いただき、とても盛り上がりました！いつも台湾で歓迎してくれるNTUの先生方を今回ご招待できてとても嬉しく思います。
Sakana AIの山田さんのAI Scientistのトークも大変面白かったです！😀また来年！

[Toyonori Sakata @KI_CMB]

ポスドク募集です。スウェーデンのカロリンスカ研究所のC. Björkegren教授の研究室でポスドクを募集しております。Smc5/6を中心とした染色体研究のラボです。

#ポスドク
#研究員
#PD

[Naomichi Takemata @pombe_archaea]

【拡散希望】私も運営に携わらせてもらっているEMBO–MBSJ Laboratory Leadership Forumが6月27日に東京で開催されます！ラボ運営に必要なスキルについて学べる貴重な機会だと思いますので、みなさん是非ご参加ください！

[Y. Kawahara @mahimahi]

最大500万円×計1,000件！
文部科学省AI for Science 萌芽的挑戦研究創出事業（SPReAD 1000）。第1回公募は4/17（金）〜5/18（月）正午。1課題あたり最大500万円。人文、社会科学OK、学生OK。審査方法も挑戦的。

[Ryuichiro Nakato (中戸 隆一郎) @RyuichiroNakato]

毎年台湾大学でのシンポに招待していただいていたのですが、今年は定量研主催で台湾大学の先生をお呼びしてシンポジウムを行います。定量研のほぼ全ラボの研究発表を聞ける貴重な機会でもあります。一般参加も可能（参加費無料）ですので、お近くの方、もしよろしければ聞きに来てください😀

[Ryuichiro Nakato (中戸 隆一郎) @RyuichiroNakato]

Smc proteinsの専門家たちが定量研に集結しています。平野先生をお祝いするために世界中から集まりました😀あまりの熱気に火災報知器が誤作動しないか心配です🔥

[Toyonori Sakata @KI_CMB]

このUTokyo-KI LINKに関連して、私のような日本人の研究者も同じラボスペースに数人おります。
海外のラボで研究してみたい方はぜひお問い合わせください。

[Toyonori Sakata @KI_CMB]

ポスドク募集です。スウェーデンのカロリンスカ研究所のC. Björkegren教授の研究室でポスドクを募集しております。Smc5/6を中心とした染色体研究のラボです。

#ポスドク
#研究員
#PD

[Toyonori Sakata @KI_CMB]

Björkegren教授はUTokyo-KI LINKも主催しており、東京大学や日本との繋がりも深いです。
https://t.co/eAIfYVIOHV