Mohammed

Applied Statistics. Dimensionality Reduction and Clustering

[Mohammed @itsMMohammed]

1)
كيف تحسب الأعمار للجد الجامع TMRCA في مشجرات https://t.co/RJO3XO0pgD؟ سأحاول الإجابة على هذا التساؤل بالرغم أن هناك الكثير من السيناريوهات اللتي قد تتدخل في حساب العمر

#جينات

[Mohammed @itsMMohammed]

اعوذ بالله من وهم المعرفة

[نادي الهلال السعودي @Alhilal_FC]

في كأس العالم.. أرسـل زعيمًا ولا توصِـه 💙

[Tesla Super Intelligence @TeslaSI]

Hello world, meet @robotaxi

[Mohammed @itsMMohammed]

@bin_harbi_ @greatjob_22 أسأل الله لهم تمام الشفاء و العافية وألا يحرمكم الأجر

[عبدالهادي بن حربي الزهراني | Abdullhadi @bin_harbi_]

تبرع أخي بإحدى كليتيه لأختي-شفاهما الله-
فقرّت عين أبونا-حفظه الله-

و إذ بأبونا جميعاً #خادم_الحرمين_الشريفين #الملك_سلمان_بن_عبدالعزيز -أعزه الله وحفظه- يبارك هذه الشيمة والقيمة والوازع الدَّيني بمنحه لأخي #وسام_الملك_عبدالعزيز من الدرجة الثالثة

أسرتي لها والِدَيْن وبيت كبير🇸🇦

[Mohammed @itsMMohammed]

@ojojojojojoj4 ماذكره تيد لا يعارض التغريدة. الكيرف يصل إلى قمته عند المتوسط المذكور في الواي فل في حال ان توزيع الطفرات يتبع توزيع متماثل مثل التوزيع الطبيعي

[Mohammed @itsMMohammed]

تعتمد الأعمار على متوسط عدد الطفرات، فعدد عينات 40 فأكثر يعتبر فالغالب جدا ممتاز لتقدير المتوسط

BY8 تحته فرعين فقط و كل فرع يوجد تحته على الأقل 60 عينة فتقدير عمر BY8 يعتبر دقيق

متوسط أعمار العينات تحت BY9 حتى الوصول لطفرة BY8 : ٢٨٠١ سنة
متوسط أعمار العينات تحت ZS4062 حتى الوصول لطفرة BY8: ٢٧٧٦ سنة

شبه اتفاق عمري بين الفرعين على أن متوسط العمر التقدير ل BY8 هو ٢٨٠٠ سنة تقريبا

معلومة: تحت BY8 لايوجد إلا 419 عينة داخلة في حساب الأعمار.

[تأبط خيراً @ojojojojojoj4]

🛑مهم جداً🛑
مقطع مهم جداً نشرح بالصوت أعمار التحورات الجينية في BY8 من شركة YFULL لفهم خوارزميات
تحديد أعمار التحورات التقديري (إستمع للنهاية)

[Mohammed @itsMMohammed]

@AZDfgc4415 إنا لله وإنا إليه لراجعون
اللهم اغفر له وارحمه و اكرم نزله

أحسن الله عزاءكم و ألهمكم الصبر و السلوان

[Mohammed @itsMMohammed]

@Aboturki11117 لا حول ولا قوة الا بالله
أحسن الله عزاءكم و غفر لها و اسكنها فسيح جناته

[Mohammed @itsMMohammed]

#NYC

[Mohammed @itsMMohammed]

إلى الدكتور فايز الغنامي @faezSot

يسرني و يسعدني أن أقدم لك أصدق التهاني و التبريكات بمناسبة حصولكم على درجة الدكتوراه في الكيمياء من جامعة نورث داكوتا.

أسأل الله أن يجعلها عونا لكم على طاعته و خدمة الدين والوطن

[عـادل @antijal]

صدفة حكت

[Mohammed @itsMMohammed]

#ARG_CAN
#Messi

[Life in Saudi Arabia @LifeSaudiArabia]

Saudi 🇸🇦 Security officers resting on the ground after completing 🕋 Hajj Duty.

[Mohammed @itsMMohammed]

@benmowoo https://t.co/dZp87bcS5H

[Mohammed @itsMMohammed]

إحصائية تشمل 862 عينة من السلالة J1 من مختلف الفروع المرفوعة إلى YFull بصيغة BAM لدراسة طول التغطية من إجمالي طول Y-chromosome لما فيه من فائدة لأصحاب المشاريع و المهتمين في تطوير المشجرات الجينية و اكتشاف إلتقاءات جديدة

يبلغ طول Y-chromosome من ما يقارب 62.4 مليون قاعدة

في الجدول التالي نستعرض ما يعرف ب Odd Ratio للعينات اللتي يتعدى التغطية فيها 50, 70, و 90% من إجمالي طول Y-chromosome
لنأخذ الشركة FTDNA(700) كمثال:
بالمجمل هناك 404 عينة. الرقم 0.12 يعني أن احتمالية تغطية Y-chromosome تصل إلى 50% على الأقل هو 88% أقل مقارنة بالعينات اللتي لم تصل إلى هذا المستوى من التغطية.

مثال آخر Nebula Genomes:
بالمجمل هناك 52 عينة. الرقم 2.71 يعني أن هناك 1.71 أكثر "أي أكثر من الدبل" للعينات اللتي تصل تغطياتها على الأقل 50% من Y-chromosome مقارنة بالعينات اللتي لم تصل إلى هذا المستوى من التغطية.

[Mohammed @itsMMohammed]

صحيح بالنسبة للإختبار اللي أجريته ولكن هناك إختبار أخر وهو المنتشر عن الكثير من الباحثين اللذين يتعاملون مع Nebula و هو إختبار Deep و سعره $249.00 ونتائجه قريبة جدا من نتائج Deep Ultra حسب ما إطلعت عليه من نتايج

راجع تغريدة سابقة في حسابي تتناول الفرق بين عدة شركات من ناحية التغطية الطولية Y-Chromosome

[Mohammed @itsMMohammed]

مقارنة بين مخرج اختبارين من شركتين مختلفتين لعينتي الشخصية

FTDNA: Big Y-700 2018 $500.00
Nebula: Ultra-Deep 2024 $899.00

درجة في حال تفوق شركة على أخرى ونصف درجة لكلا الشركتين في حال التعادل لعدة مقاييس

جدول الواي فل به التفصيل

جدول الإكسل فيه مختصر الدرجة

[Mohammed @itsMMohammed]

@NRudae @tahtam809 جزاك الله خير و الله يبارك فيك و يرفع قدرك اخي العميد مهندس نواف. 🌹🌹

[Mohammed @itsMMohammed]

@aladwani585 @AAlshrif الله يبارك فيك أستاذنا العم أحمد أبو ساري و وفقك الله لما يحب و يرضى