Shuichi Onami

Scientist. Team Director @BDR_RIKEN, Project Director @RIKEN_en TRIP Headquarters, Associate Division Director @RIKEN_en R-IH.

[Shuichi Onami @sonamix]

理研のデータが使いやすくなりました！多様な研究データベースへのポータルサイトを公開 | 理化学研究所 https://t.co/TRsbOI2ULs
https://t.co/ZjD9CoWdx5. .

[Shuichi Onami @sonamix]

The GloBIAS Bioimage Analysis Conference has ended. Thank you to the 160+ participants who gathered in Kobe from around the world! Hope you enjoyed the science, food, sake, and culture in Kobe, Japan. See you soon! @GloBIAS_ @BDR_RIKEN @GerBI_GMB @czi @GlobalBioImage

[Shuichi Onami @sonamix]

We are almost ready to welcome you all to the GloBIAS Bioimage Analysis Conference 2025 in Kobe, Oct 26-31. Safe trip to Kobe, Japan, and see you soon! @GloBIAS_ @BDR_RIKEN https://t.co/G0uMKSrnwV

[Shuichi Onami @sonamix]

近年世界レベルで重要性を増している、研究機関のコアファシリティで働く技術者のキャリアパスに興味を持つ方々のための、体験イベントです。百聞は一見に如かず。興味のある方は是非ご参加ください。

[理化学研究所（理研） @RIKEN_JP]

最先端研究プラットフォーム連携(TRIP)事業本部では、8/26(火)に理系の専門学校生・高専生・大学生・大学院生を対象としたイベントを開催します！
日頃、見ることができない研究施設や技術者の日常を大公開。ぜひご応募ください。

お申込み・詳細: https://t.co/VOSxlK190z

[Shuichi Onami @sonamix]

We work together! @ssbd_en

[Global BioImaging @GlobalBioImage]

OME team from @dundeeuni @openmicroscopy joins Global BioImaging Image Data 2025 Course at @IISERPune @IndiaBioImaging

With Virtual Machines from @RIKEN_BDR and support from @sonamix participants learn how to set up OMERO server in an imaging core facility

[RIKEN BDR @BDR_RIKEN]

RIKEN BDR Lab for Developmental Dynamics (@sonamix) is hosting the @GloBIAS Bioimage Analysis Conference to be held in Kobe, Japan, Oct 26-31, 2025.
Training school, #Hackathon & #Taggathon are also being organized!
Registration deadline: Jun 15, 2025
👇
https://t.co/u8xj7MAFxr

[Shuichi Onami @sonamix]

バイオイメージングデータの共有と再利用のためのプラットフォーム「SSBD」@ssbd_ja の新たな紹介動画を公開しました。SSBD:repositoryには学術誌上で発表された全てのバイオイメージング関連データをどなたでも論文発表に合わせて公開することが可能です。https://t.co/jF5H4mX4EV

[Kota Miura @kotapub]

本屋さんの書架にも並んだみたいです。https://t.co/KbSNYPDT7v

[Hiroki HIGASHIYAMA (東山 大毅) @h_higashiyama]

なお、この研究で用いられた全ての組織学データ(マウス頭部の連続組織切片データ; 8.5-15.5 dpc)は、理研のSSBD:repository(@ssbd_en)よりダウンロードが可能です。
All histological data head are available on SSBD:repository !
➡ https://t.co/RUVOQndU4Z

[GIDE @GIDEproject]

#foundingGIDE celebrates one year! We’re excited to share the highlights from one of our biggest events of 2024: the foundingGIDE Community Event in Okazaki, Japan 🇯🇵

More of foundingGIDE Community Event 2025 here: https://t.co/hsnASUAYP0

#imaging #metadata #ontologies

[Shuichi Onami @sonamix]

Thrilled to share our newly developed incubator-type biaxial light-sheet microscope. The system allows in toto single-cell observation in a whole hemisphere of an E5.5 embryo for 12h. Collaboration with Tomonobu Watanabe Lab @BDR_RIKEN is always exciting!

[LifeScienceAlliance @LSAjournal]

embryonic development / single-cell tracking / SPIM microscope / trans-scale / live-imaging @sonamix @BDR_RIKEN @RIKEN_en
https://t.co/YNBUV1KaaB

[Shuichi Onami @sonamix]

理研OLSPは"オープンライフサイエンスの現状と展望"をテーマとしたシンポジウムを開催します。オープンサイエンスに関する専門家や研究者が一同に会し、生命科学のオープンサイエンスの最新の知見や実用例について議論します。2025年1月27日@理研和光 @RIKEN_OLSP @RIKEN_JP https://t.co/vNMzkxJOy2

[RIKEN OLSP @RIKEN_OLSP]

We will host OLSP Symposium 2025: Present and Future Perspectives of Open Life Sciences. The event will bring together experts and researchers to discuss and share the latest findings and practical applications related to open science in life sciences. https://t.co/ajbDwGAjSh

[理研BDR(生命機能科学研究センター) @RIKEN_BDR]

理研BDRの新海創也上級研究員と九州大学の落合博教授らは、エンハンサーとプロモーターが遺伝子発現に与える影響を調べ、特定の遺伝子が活発に発現しているとき、周辺の特定DNA領域が近接し、転写関連因子が集積することを確認しました。

詳細は九州大学のwebをご覧ください👇https://t.co/Wesg6VETgP

[Shuichi Onami @sonamix]

本日(11/29)11:45よりMBSJ2024の第11会場にて、バイオイメージングデータのグローバルな共有リポジトリ/データベースであるSSBDの紹介をするランチョンセミナーを開催します。論文発表時の画像データを共有するレポジトリ等としてのSSBDの機能を紹介します
@ssbd_ja #MBSJ2024 https://t.co/SD1YI8LKVu

[SSBD:database / SSBD:repository @ssbd_ja]

2024/11/29 11:45-12:35 第47回日本分子生物学会年会 @mbsj_2024 におきまして、
バイオテクノロジーセミナー（ランチョンセミナー）
3BT-11「SSBD: バイオイメージングデータのグローバルな共有」を開催いたします #MBSJ2024

[理研BDR(生命機能科学研究センター) @RIKEN_BDR]

【プレスリリース】
理研BDRの大浪修一チームリーダーらは、生命科学分野の画像データの共有と再利用を促進する公共リポジトリおよび高付加価値データベースを開発・公開しました。https://t.co/Oq9X2fpQYu

[GIDE @GIDEproject]

Day 2 and 3 of the #foundingGIDE Hackathon was a mix of #ilastik, #metadata, #ontology, #OMERO and the cutting edge of computing!

We visited one of the world's most powerful #Fugaku supercomputer at @riken_en 💻🔬 #Interoperability

[理研バイオリソース研究センター（BRC） @RIKEN_BRC_jp]

画像データの共有がもたらす生命科学の発展
－理研発のデータ共有エコシステムが世界をつなぐ－ https://t.co/bpp68fxF5Q
#理研BRC #BRC

[openmicroscopy @openmicroscopy]

The OMERO installation workshop at #foundingGIDE event at @riken_en in Kobe was followed by the "Imaging workflows in OMERO" workshop. The participants had the satisfaction of installing OMERO on a VM. A lively discussion ensued on Monday 4th November here in Kobe.