Jernej Kovac

assistant professor #PhD
#genomics #epigenetics & #transcriptomics, #NGS #ncRNA #miRNA #exosomes #raredisease #researcher #scientist. #chillipepper #enthusiast

[Marinka Zitnik @marinkazitnik]

AutoScientists is a fully open science project

A step toward agent teams that can sustain long-running scientific experimentation across biomedicine and science

Website: https://t.co/JHAkbEwuKE

Paper: https://t.co/mzEx5xvW36

Code: https://t.co/hE0i2c0UJF

Congrats to stellar @GaoShanghua @AdaFang_ and our agent collaborators! 👏

@HarvardDBMI @KempnerInst @broadinstitute @harvard

[Jernej Kovac @JerKoNej]

@basedsystems @razoralign Can it be run locally?

[Upasana DasAdhikari @UpasanaDA]

For decades, we taught a simple rule: MHC I → CD8 T cells, MHC II → CD4 T cells.
Turns out, that’s incomplete.

MHC I doesn’t just help CD8s “see” cells — it also protects cells from CD4 T cell–driven killing.https://t.co/AB5OUxIWfH

[Slovensko Biokemijsko Društvo @SBD_novice]

V sredo, 18. februarja 2026, ob 15.00 uri vljudno vabljeni na predavanje "The Centrosome as an RNA-RBP Hub in Neural Cells", ki ga bo imela Giulia Antognolli (Biomedical Center Munich / Helmholtz Center Munich). @kemijski

[Žiga Avsec @Avsecz]

AlphaGenome is out in @nature today along with model weights! 🧬

📄 Paper: https://t.co/1fHzSPiY1x
💻 Weights: https://t.co/z6JWLT4Mpv

Getting here wasn’t a straight path. We sat down @googledeepmind to discuss the story behind the model, paper & API: https://t.co/cT8CiXfnxQ

[Jernej Kovac @JerKoNej]

@Avsecz @Nature @GoogleDeepMind Congrats! 🎉💪🏻 Amazing tool!

[Niko Gamulin @NikoGamulin]

🧵 1/ Zakaj lahko naložba v superračunalnik brez strategije pomeni izgubo več sto milijonov evrov?

Nova nit, ki postavlja ogledalo tehnološki politiki Slovenije – in opozarja, da brez ljudi ni umetne inteligence.
👇

[Jernej Kovac @JerKoNej]

🔬 Iščemo mladega raziskovalca!

Raziskuj epigenetske biomarkerje sladkorne bolezni tipa 1 v vrhunskem genetskem laboratoriju @CISLD_SI, v programsko skupini @TBattelino na @ukclj

Začetek: jesen 2025

Prijave do 20. 6. 2025 👉 jernej.kovac[at]https://t.co/NuP1ZcXR1u

[Urh Groselj @UrhGroselj]

Our new study published in @AJPCardio
Can we better detect insulin resistance and early metabolic complications in children with obesity using a simple 2-point test?
“Enhanced OGTT for early detection of IR & metabolic complications”
📄 https://t.co/mw8AvgkFuK

[AJPC @AJPCardio]

🧪 New study: Enhanced OGTT may help detect insulin resistance & metabolic issues early in children with obesity—supporting timely care & better outcomes.

🔗 https://t.co/kXe8QsiN62

#PediatricHealth #Obesity #CVDPrevention #MetabolicHealth

[Urh Groselj @UrhGroselj]

Just published in @ojrarediseases : our overview of gene therapy in rare diseases as milestone and Slovenia’s first clinical experiences—including metabolic disorders, SMA, CTNNB1 syndrome, and IL-12–based immunotherapy.#genetherapy #raredisease
Read more: https://t.co/4VBW9d4rTW

[antisense. @razoralign]

Lossless Pangenome Indexing Using Tag Arrays https://t.co/Jp9AGZ0bEI

[Jernej Kovac @JerKoNej]

Prvi otrok na svetu zdravljen s CRISPR terapijo za redko jetrno bolezen – začetek nove dobe medicine! #CRISPR

https://t.co/PbOK4uP4K4

[Sebastian @seba1337]

Aha, 20 miljonov € fizičini osebi od GEN-i. A je bilo to kar je bilo sporno, da bo javno?

[Eric Topol @EricTopol]

Most genome editing work to date has been DNA based. A new paper out today assessed a single dose of epigenetic editing (thru PCSK9) for marked (~70%) and durable reduction of LDL cholesterol [in non-human primates]
https://t.co/3sbW909ZpY @NatureMedicine @jaffeab @chromamedicine

[Jernej Kovac @JerKoNej]

🧬 Slovenski Referenčni Genomski Projekt odpira vrata natančnejši diagnostiki in ciljanemu zdravljenju. Več znanja = boljše terapije!

📢 Leta 2026 bo ponovno zbiranje vzorcev prostovoljcev. Prijavite se že zdaj: info.srgp[at]https://t.co/NuP1ZcXjbW
Več:https://t.co/IyjGo3Krtl

[Jernej Kovac @JerKoNej]

🕯️

[UKC Ljubljana @ukclj]

In memoriam: prof. dr. Bojan Vrtovec (1972–2025)

Z globoko žalostjo sporočamo, da nas je po dolgi in zahrbtni bolezni v nedeljo, 12. januarja 2025, zapustil profesor dr. Bojan Vrtovec, eden najuglednejših slovenskih kardiologov in znanstvenikov zadnjih desetletij. Njegovo življenje in delo sta zaznamovala neizmerna intelektualna radovednost in neomajna zavezanost medicinski znanosti.

Profesor Vrtovec je bil več kot le izjemen zdravnik in znanstvenik – bil je človek, ki je vsakomur, ki je imel srečo delati z njim, pustil neizbrisen pečat s svojo toplino, odprtostjo in predanostjo. Bil je intelektualec v pravem pomenu besede – človek, ki je s svojo vedoželjnostjo in nenehnim iskanjem resnice dvigoval meje znanosti in hkrati navdihoval svoje kolege in študente.

Njegova zapuščina presega zgolj medicinske dosežke, saj je kot mentor in mislec spodbujal celosten razvoj kardiovaskularne znanstvene skupnosti v Sloveniji, ki se bo še naprej navdihovala z njegovim delom in vizijo.

V teh težkih trenutkih izražamo globoko sožalje družini, bližnjim in prijateljem profesorja dr. Bojana Vrtovca. Naj vas tolaži spomin na njegovo izjemno življenje in neizbrisno zapuščino, ki jo je zapustil.

Naj počiva v miru, a njegovo intelektualno in humanistično zapuščino bomo nosili naprej.

Interna klinika, UKC Ljubljana

https://t.co/BmYXRwLH5h

[Jernej Kovac @JerKoNej]

🔬 Priložnost za podoktorske raziskovalce! Pridružite se ekipi @CISLD_SI pri raziskovanju redkih imunoloških bolezni. 💡 Napredne tehnike genomike, pretočne citometrije in mednarodni projekti. Pošljite prijavo do 1.1.2025! 📩 [email protected] #znanost #imunologija #raziskave

[Jernej Kovac @JerKoNej]

🔬 Iščemo tudi bioinformatika! Pridruži se Slovenskemu referenčnemu genomskemu projektu in ekipi prof. Battelina @CISLD_SI! 📚 Razvoj genomskih tehnologij, T2T reference in pangenoma. 🌟 CV na: [email protected] #Bioinformatika #Genomika

[Jernej Kovac @JerKoNej]

V e-naslovu zgoraj boste zlahka našli napako in jo popravili, ko boste pošiljali CVje 🙂

[Jernej Kovac @JerKoNej]

🚨 Priložnost! 🚨
Postani del prelomnih raziskav v genomiki! 🔬
Posdoktorsko mesto na Slovenskem referenčnem genomskem projektu.
🧬 Delo: Sekvenciranje genoma (ONT), analiza podatkov, razvoj pangenoma
🏥: @CISLD_SI
✉ CV: https://t.co/vKFAP1Xhcc
⏳ Rok: 10.01.2025
🔗: ⬇️